seq1 = pF1KB7043.tfa, 1410 bp
seq2 = pF1KB7043/gi568815575r_30204582.tfa (gi568815575r:30204582_30409363), 204782 bp

>pF1KB7043 1410
>gi568815575r:30204582_30409363 (ChrX)

(complement)

1-1168  (100001-101168)   99% ->
1169-1410  (104541-104782)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGCGAGAACCACCAGTGGCAGGGCAGCATCCTCTACAACATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGCGAGAACCACCAGTGGCAGGGCAGCATCCTCTACAACATGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATGAGCGCGAAGCAAACGCGCGCGGCTCCTGAGGCTCCAGAGACGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATGAGCGCGAAGCAAACGCGCGCGGCTCCTGAGGCTCCAGAGACGCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGGATCAGTGTTGGGGCTGTTCGTGCGGCGATGAGCCCGGGGTGGGC
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGGATCAGTGCTGGGGCTGTTCGTGCGGCGATGAGCCCGGGGTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGAGAGGGGCTGCTGGGCGGGCGGAACGTGGCGCTCCTGTACCGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGAGAGGGGCTGCTGGGCGGGCGGAACGTGGCGCTCCTGTACCGCTGCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTTGCGGTAAAGACCACCCACGGCAGGGCAGCATCCTCTACAGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTTGCGGTAAAGACCACCCACGGCAGGGCAGCATCCTCTACAGCATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGACGAGCGCAAAGCAAACGTACGCGGCGCCGAAGGCGCCCGAGGCGACG
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100251 TGACGAGCGCAAAGCAAACGTACGCGGCACCGAAGGCGCCCGAGGCGACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGGTCCGTGCTGGGGCTGTTCGTGCGGCTCTGATCCCGGGGTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGGTCCGTGCTGGGGCTGTTCGTGCGGCTCTGATCCCGGGGTGGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCGGGGCTTCCGGGTGGGCGGCCCGTGGCACTCCTGTACCGCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCGGGGCTTCCGGGTGGGCGGCCCGTGGCACTCCTGTACCGCTGCTGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTTGTGGTGAAGACCACCCGCGGCAGGGCAGCATCCTCTACAGCTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTTGTGGTGAAGACCACCCGCGGCAGGGCAGCATCCTCTACAGCTTGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACTAGCTCAAAGCAAACGCACGTGGCTCCGGCAGCGCCCGAGGCACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACTAGCTCAAAGCAAACGCACGTGGCTCCGGCAGCGCCCGAGGCACGGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGGGGCGCGTGGTGGGACCGCTCCTACTTCGCGCAGAGGCCAGGGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGGGGCGCGTGGTGGGACCGCTCCTACTTCGCGCAGAGGCCAGGGGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGAGGCGCTACCAGGCGGGCGGGCCACGGCGCTTCTGTACCGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGAGGCGCTACCAGGCGGGCGGGCCACGGCGCTTCTGTACCGCTGCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTTGCGGTGAAGACCACCCGCAGCAGGGCAGCACCCTCTACTGCGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTTGCGGTGAAGACCACCCGCAGCAGGGCAGCACCCTCTACTGCGTGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACGAGCACAAATCAAGCGCAGGCGGCTCCGGAGGAGCGGCCGAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACGAGCACAAATCAAGCGCAGGCGGCTCCGGAGGAGCGGCCGAGGGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTGGTGGGACACCTCCTCTGGTGCGCTGCGGCCGGTGGCGCTCAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTGGTGGGACACCTCCTCTGGTGCGCTGCGGCCGGTGGCGCTCAAGAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCACAGGTGGTCTGCGAGGCAGCCTCAGCGGGCCTGTTGAAGACGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCACAGGTGGTCTGCGAGGCAGCCTCAGCGGGCCTGTTGAAGACGCTGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTCGTCAAGTACTTGCCCTGCTTCCAGGTGCTGCCCCTGGACCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTTCGTCAAGTACTTGCCCTGCTTCCAGGTGCTGCCCCTGGACCAGCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGTGCTGGTGCGCAACTGCTGGGCGTCCCTGCTCATGCTTGAGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGTGCTGGTGCGCAACTGCTGGGCGTCCCTGCTCATGCTTGAGCTGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGGACCGCTTGCAGTTCGAGACTGTGGAAGTCTCGGAGCCCAGCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGGACCGCTTGCAGTTCGAGACTGTGGAAGTCTCGGAGCCCAGCATGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCAGAAGATCCTCACCACCAGGCGGCGGGAGACCGGGGGCAACGAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCAGAAGATCCTCACCACCAGGCGGCGGGAGACCGGGGGCAACGAGCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCCCGTGCCCACGCTGCAGCACCATTTGGCACCGCCGGCGGAGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCCCGTGCCCACGCTGCAGCACCATTTGGCACCGCCGGCGGAGGCCAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AAGGTGCCCTCCGCCTCCCAGGTCCAAGCCATCAAGTGCTTTCTTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AAGGTGCCCTCCGCCTCCCAGGTCCAAGCCATCAAGTGCTTTCTTTCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ATGCTGGAGTCTGAACATCAGTACCAAGGAGTACGCCTACCTCAAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 ATGCTGGAGTCTGAACATCAGTACCAAGGAGTACGCCTACCTCAAGGGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCGTGCTCTTTAACCCGG         ACGTGCCGGGCCTGCAGTGCGTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101151 CCGTGCTCTTTAACCCGGGTA...CAGACGTGCCGGGCCTGCAGTGCGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AAGTACATTCAGGGACTCCAGTGGGGAACTCAGCAAATACTCAGTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104564 AAGTACATTCAGGGACTCCAGTGGGGAACTCAGCAAATACTCAGTGAACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CACCAGGATGACGCACCAAGGGCCCCATGACAGATTCATCGAACTTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104614 CACCAGGATGACGCACCAAGGGCCCCATGACAGATTCATCGAACTTAATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GTACCCTTTTCCTGCTGAGATTCATCAATGCCAATGTCATTGCTGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104664 GTACCCTTTTCCTGCTGAGATTCATCAATGCCAATGTCATTGCTGAACTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TTCTTCAGGCCCATCATCGGCACAGTCAGCATGGATGATATGATGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104714 TTCTTCAGGCCCATCATCGGCACAGTCAGCATGGATGATATGATGCTGGA

   1400     .    :    .
   1392 AATGCTCTGTACAAAGATA
        |||||||||||||||||||
 104764 AATGCTCTGTACAAAGATA