seq1 = pF1KB7038.tfa, 1371 bp
seq2 = pF1KB7038/gi568815578r_22481853.tfa (gi568815578r:22481853_22684260), 202408 bp

>pF1KB7038 1371
>gi568815578r:22481853_22684260 (Chr20)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-1371  (101107-102408)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGAGCGGTGAAGATGGAAGGGCACGAGCCGTCCGACTGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGAGCGGTGAAGATGGAAGGGCACGAGCCGTCCGACTGGAGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACTATGCAGAGCCCGAG         GGCTACTCCTCCGTGAGCAACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 CTACTATGCAGAGCCCGAGGTA...CAGGGCTACTCCTCCGTGAGCAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAACGCCGGCCTGGGGATGAACGGCATGAACACGTACATGAGCATGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101129 TGAACGCCGGCCTGGGGATGAACGGCATGAACACGTACATGAGCATGTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGGCCGCCATGGGCAGCGGCTCGGGCAACATGAGCGCGGGCTCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101179 GCGGCCGCCATGGGCAGCGGCTCGGGCAACATGAGCGCGGGCTCCATGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATGTCGTCGTACGTGGGCGCTGGCATGAGCCCGTCCCTGGCGGGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101229 CATGTCGTCGTACGTGGGCGCTGGCATGAGCCCGTCCCTGGCGGGGATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCCCGGCGCGGGCGCCATGGCGGGCATGGGCGGCTCGGCCGGGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101279 CCCCCGGCGCGGGCGCCATGGCGGGCATGGGCGGCTCGGCCGGGGCGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCGTGGCGGGCATGGGGCCGCACTTGAGTCCCAGCCTGAGCCCGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101329 GGCGTGGCGGGCATGGGGCCGCACTTGAGTCCCAGCCTGAGCCCGCTCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGGCAGGCGGCCGGGGCCATGGGCGGCCTGGCCCCCTACGCCAACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101379 GGGGCAGGCGGCCGGGGCCATGGGCGGCCTGGCCCCCTACGCCAACATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTCCATGAGCCCCATGTACGGGCAGGCGGGCCTGAGCCGCGCCCGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101429 ACTCCATGAGCCCCATGTACGGGCAGGCGGGCCTGAGCCGCGCCCGCGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCAAGACCTACAGGCGCAGCTACACGCACGCAAAGCCGCCCTACTCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101479 CCCAAGACCTACAGGCGCAGCTACACGCACGCAAAGCCGCCCTACTCGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATCTCGCTCATCACCATGGCCATCCAGCAGAGCCCCAACAAGATGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101529 CATCTCGCTCATCACCATGGCCATCCAGCAGAGCCCCAACAAGATGCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGCTGAGCGAGATCTACCAGTGGATCATGGACCTCTTCCCCTTCTACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101579 CGCTGAGCGAGATCTACCAGTGGATCATGGACCTCTTCCCCTTCTACCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGAACCAGCAGCGCTGGCAGAACTCCATCCGCCACTCGCTCTCCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101629 CAGAACCAGCAGCGCTGGCAGAACTCCATCCGCCACTCGCTCTCCTTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CGACTGTTTCCTGAAGGTGCCCCGCTCGCCCGACAAGCCCGGCAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101679 CGACTGTTTCCTGAAGGTGCCCCGCTCGCCCGACAAGCCCGGCAAGGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCTTCTGGACCCTGCACCCTGACTCGGGCAACATGTTCGAGAACGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101729 CCTTCTGGACCCTGCACCCTGACTCGGGCAACATGTTCGAGAACGGCTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TACCTGCGCCGCCAGAAGCGCTTCAAGTGCGAGAAGCAGCTGGCGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101779 TACCTGCGCCGCCAGAAGCGCTTCAAGTGCGAGAAGCAGCTGGCGCTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGAGGCCGCAGGCGCCGCCGGCAGCGGCAAGAAGGCGGCCGCCGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101829 GGAGGCCGCAGGCGCCGCCGGCAGCGGCAAGAAGGCGGCCGCCGGAGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGGCCTCACAGGCTCAACTCGGGGAGGCCGCCGGGCCGGCCTCCGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101879 AGGCCTCACAGGCTCAACTCGGGGAGGCCGCCGGGCCGGCCTCCGAGACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CCGGCGGGCACCGAGTCGCCTCACTCGAGCGCCTCCCCGTGCCAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101929 CCGGCGGGCACCGAGTCGCCTCACTCGAGCGCCTCCCCGTGCCAGGAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CAAGCGAGGGGGCCTGGGAGAGCTGAAGGGGACGCCGGCTGCGGCGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101979 CAAGCGAGGGGGCCTGGGAGAGCTGAAGGGGACGCCGGCTGCGGCGCTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GCCCCCCAGAGCCGGCGCCCTCTCCCGGGCAGCAGCAGCAGGCCGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102029 GCCCCCCAGAGCCGGCGCCCTCTCCCGGGCAGCAGCAGCAGGCCGCGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CACCTGCTGGGCCCGCCCCACCACCCGGGCCTGCCGCCTGAGGCCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102079 CACCTGCTGGGCCCGCCCCACCACCCGGGCCTGCCGCCTGAGGCCCACCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GAAGCCGGAACACCACTACGCCTTCAACCACCCGTTCTCCATCAACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102129 GAAGCCGGAACACCACTACGCCTTCAACCACCCGTTCTCCATCAACAACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCATGTCCTCGGAGCAGCAGCACCACCACAGCCACCACCACCACCAGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 102179 TCATGTCCTCGGAGCAGCAGCACCACCACAGCCACCACCACCACCAACCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CACAAAATGGACCTCAAGGCCTACGAACAGGTGATGCACTACCCCGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102229 CACAAAATGGACCTCAAGGCCTACGAACAGGTGATGCACTACCCCGGCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CGGTTCCCCCATGCCTGGCAGCTTGGCCATGGGCCCGGTCACGAACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102279 CGGTTCCCCCATGCCTGGCAGCTTGGCCATGGGCCCGGTCACGAACAAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CGGGCCTGGACGCCTCGCCCCTGGCCGCAGATACCTCCTACTACCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102329 CGGGCCTGGACGCCTCGCCCCTGGCCGCAGATACCTCCTACTACCAGGGG

   1350     .    :    .    :    .    :
   1342 GTGTACTCCCGGCCCATTATGAACTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 102379 GTGTACTCCCGGCCCATTATGAACTCCTCT