seq1 = pF1KB7035.tfa, 1278 bp
seq2 = pF1KB7035/gi568815591r_41589653.tfa (gi568815591r:41589653_41800374), 210722 bp

>pF1KB7035 1278
>gi568815591r:41589653_41800374 (Chr7)

(complement)

1-388  (100001-100388)   100% ->
389-1278  (109833-110722)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTTGCTTTGGCTGAGAGGATTTCTGTTGGCAAGTTGCTGGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCTTGCTTTGGCTGAGAGGATTTCTGTTGGCAAGTTGCTGGATTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGAGGAGTTCCCCCACCCCAGGATCCGAGGGGCACAGCGCGGCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTGAGGAGTTCCCCCACCCCAGGATCCGAGGGGCACAGCGCGGCCCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGTCCGTCCTGTGCGCTGGCCGCCCTCCCAAAGGATGTACCCAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGTCCGTCCTGTGCGCTGGCCGCCCTCCCAAAGGATGTACCCAACTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCCAGAGATGGTGGAGGCCGTCAAGAAGCACATTTTAAACATGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCCAGAGATGGTGGAGGCCGTCAAGAAGCACATTTTAAACATGCTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTGAAGAAGAGACCCGATGTCACCCAGCCGGTACCCAAGGCGGCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTGAAGAAGAGACCCGATGTCACCCAGCCGGTACCCAAGGCGGCGCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAACGCGATCAGAAAGCTTCATGTGGGCAAAGTCGGGGAGAACGGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAACGCGATCAGAAAGCTTCATGTGGGCAAAGTCGGGGAGAACGGGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGGAGATAGAGGATGACATTGGAAGGAGGGCAGAAATGAATGAACTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGGAGATAGAGGATGACATTGGAAGGAGGGCAGAAATGAATGAACTTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAGCAGACCTCGGAGATCATCACGTTTGCCGAGTCAG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100351 GGAGCAGACCTCGGAGATCATCACGTTTGCCGAGTCAGGTT...CAGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAGCCAGGAAGACGCTGCACTTCGAGATTTCCAAGGAAGGCAGTGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109836 CAGCCAGGAAGACGCTGCACTTCGAGATTTCCAAGGAAGGCAGTGACCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCAGTGGTGGAGCGTGCAGAAGTCTGGCTCTTCCTAAAAGTCCCCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109886 TCAGTGGTGGAGCGTGCAGAAGTCTGGCTCTTCCTAAAAGTCCCCAAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAACAGGACCAGGACCAAAGTCACCATCCGCCTCTTCCAGCAGCAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109936 CAACAGGACCAGGACCAAAGTCACCATCCGCCTCTTCCAGCAGCAGAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACCCGCAGGGCAGCTTGGACACAGGGGAAGAGGCCGAGGAAGTGGGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109986 ACCCGCAGGGCAGCTTGGACACAGGGGAAGAGGCCGAGGAAGTGGGCTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAGGGGGAGAGGAGTGAACTGTTGCTCTCTGAAAAAGTAGTAGACGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110036 AAGGGGGAGAGGAGTGAACTGTTGCTCTCTGAAAAAGTAGTAGACGCTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAAGAGCACCTGGCATGTCTTCCCTGTCTCCAGCAGCATCCAGCGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110086 GAAGAGCACCTGGCATGTCTTCCCTGTCTCCAGCAGCATCCAGCGGTTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGGACCAGGGCAAGAGCTCCCTGGACGTTCGGATTGCCTGTGAGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110136 TGGACCAGGGCAAGAGCTCCCTGGACGTTCGGATTGCCTGTGAGCAGTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGGAGAGTGGCGCCAGCTTGGTTCTCCTGGGCAAGAAGAAGAAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110186 CAGGAGAGTGGCGCCAGCTTGGTTCTCCTGGGCAAGAAGAAGAAGAAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGAGGAGGGGGAAGGGAAAAAGAAGGGCGGAGGTGAAGGTGGGGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110236 AGAGGAGGGGGAAGGGAAAAAGAAGGGCGGAGGTGAAGGTGGGGCAGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CAGATGAGGAAAAGGAGCAGTCGCACAGACCTTTCCTCATGCTGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110286 CAGATGAGGAAAAGGAGCAGTCGCACAGACCTTTCCTCATGCTGCAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGGCAGTCTGAAGACCACCCTCATCGCCGGCGTCGGCGGGGCTTGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110336 CGGCAGTCTGAAGACCACCCTCATCGCCGGCGTCGGCGGGGCTTGGAGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGATGGCAAGGTCAACATCTGCTGTAAGAAACAGTTCTTTGTCAGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110386 TGATGGCAAGGTCAACATCTGCTGTAAGAAACAGTTCTTTGTCAGTTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGGACATCGGCTGGAATGACTGGATCATTGCTCCCTCTGGCTATCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110436 AGGACATCGGCTGGAATGACTGGATCATTGCTCCCTCTGGCTATCATGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AACTACTGCGAGGGTGAGTGCCCGAGCCATATAGCAGGCACGTCCGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110486 AACTACTGCGAGGGTGAGTGCCCGAGCCATATAGCAGGCACGTCCGGGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CTCACTGTCCTTCCACTCAACAGTCATCAACCACTACCGCATGCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110536 CTCACTGTCCTTCCACTCAACAGTCATCAACCACTACCGCATGCGGGGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 ATAGCCCCTTTGCCAACCTCAAATCGTGCTGTGTGCCCACCAAGCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110586 ATAGCCCCTTTGCCAACCTCAAATCGTGCTGTGTGCCCACCAAGCTGAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CCCATGTCCATGTTGTACTATGATGATGGTCAAAACATCATCAAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110636 CCCATGTCCATGTTGTACTATGATGATGGTCAAAACATCATCAAAAAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .
   1242 CATTCAGAACATGATCGTGGAGGAGTGTGGGTGCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110686 CATTCAGAACATGATCGTGGAGGAGTGTGGGTGCTCA