seq1 = pF1KB7033.tfa, 1272 bp
seq2 = pF1KB7033/gi568815597r_26905947.tfa (gi568815597r:26905947_27112667), 206721 bp

>pF1KB7033 1272
>gi568815597r:26905947_27112667 (Chr1)

(complement)

1-261  (100001-100261)   100% ->
262-1272  (105711-106721)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGTCGGAGAGCGGAGCTGAGCGCAGGGACCGGGCGGCTGCTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGTCGGAGAGCGGAGCTGAGCGCAGGGACCGGGCGGCTGCTCAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGACGGCTGCGGCCACGGCGGTGGCCACGGCAGCCCCGGCAGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGGACGGCTGCGGCCACGGCGGTGGCCACGGCAGCCCCGGCAGGCGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCCGACCCGGAGGCCTTATCGGCCTTCCCCGGACGGCACCTGAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCCCGACCCGGAGGCCTTATCGGCCTTCCCCGGACGGCACCTGAGTGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGAGCTGGCCACAGGTGAAGCGACTGGACGCTCTTCTGAGCGAGCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGAGCTGGCCACAGGTGAAGCGACTGGACGCTCTTCTGAGCGAGCCGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCCCATTCACGGGCGCGGCAACTTCCCCACGCTGAGCGTGCAGCCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCCCATTCACGGGCGCGGCAACTTCCCCACGCTGAGCGTGCAGCCCCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGATCGTGCAG         GTGGTCCGCAGCACCCTGGAGGAGCAGGGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGATCGTGCAGGTG...CAGGTGGTCCGCAGCACCCTGGAGGAGCAGGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTACATGTGCACAGTGTGCGGCTGCATGGTTCAGCTGCCAGCCACGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105741 CTACATGTGCACAGTGTGCGGCTGCATGGTTCAGCTGCCAGCCACGTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCACCCTGAGAGTGGCCTGGGCTACAAGGATCTGGACCTGGTGTTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105791 GCACCCTGAGAGTGGCCTGGGCTACAAGGATCTGGACCTGGTGTTCCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGACCTGCGCAGTGAGGCATCCTTCCAGCTGACCAAGGCAGTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105841 TGGACCTGCGCAGTGAGGCATCCTTCCAGCTGACCAAGGCAGTGGTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCTGCCTACTAGACTTCCTGCCGGCCGGTGTGAGCCGGGCCAAGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105891 GCCTGCCTACTAGACTTCCTGCCGGCCGGTGTGAGCCGGGCCAAGATCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCACTGACACTCAAGGAGGCATACGTGCAGAAGCTGGTGAAAGTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105941 GCCACTGACACTCAAGGAGGCATACGTGCAGAAGCTGGTGAAAGTGTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAGACTCGGACCGCTGGAGCCTCATCTCACTGTCCAACAAGAGCGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105991 CAGACTCGGACCGCTGGAGCCTCATCTCACTGTCCAACAAGAGCGGCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AACGTGGAGCTCAAGTTTGTGGACTCGGTGAGACGCCAGTTTGAATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106041 AACGTGGAGCTCAAGTTTGTGGACTCGGTGAGACGCCAGTTTGAATTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CATAGACTCCTTCCAGATCATCCTGGACTCCCTGTTGCTCTTTGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106091 CATAGACTCCTTCCAGATCATCCTGGACTCCCTGTTGCTCTTTGGCCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCTCGTCCACTCCCATGTCTGAGGCCTTCCACCCAACGGTCACAGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106141 GCTCGTCCACTCCCATGTCTGAGGCCTTCCACCCAACGGTCACAGGCGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGCCTGTACGGGGACTTCACCGAGGCCCTGGAGCACCTGCGGCACCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106191 AGCCTGTACGGGGACTTCACCGAGGCCCTGGAGCACCTGCGGCACCGTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CATCGCCACGCGCAGTCCCGAGGAGATCCGAGGTGGTGGCCTCCTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106241 CATCGCCACGCGCAGTCCCGAGGAGATCCGAGGTGGTGGCCTCCTCAAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACTGCCACCTCCTGGTGCGGGGCTTCCGGCCCCGGCCCAGCACCGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106291 ACTGCCACCTCCTGGTGCGGGGCTTCCGGCCCCGGCCCAGCACCGATGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGCGCCCTGCAGCGCTACATGTGCTCCCGCTTCTTCATCGACTTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106341 CGCGCCCTGCAGCGCTACATGTGCTCCCGCTTCTTCATCGACTTTCCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCTGGTGGAGCAGCGGCGCACCCTAGAGCGCTACCTGGAGGCCCACTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106391 CCTGGTGGAGCAGCGGCGCACCCTAGAGCGCTACCTGGAGGCCCACTTCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GTGGGGCAGATGCAGCCCGCCGTTACGCCTGCCTGGTGACACTGCACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106441 GTGGGGCAGATGCAGCCCGCCGTTACGCCTGCCTGGTGACACTGCACCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTGGTCAACGAGAGCACCGTGTGCCTCATGAACCACGAGCGCCGCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106491 GTGGTCAACGAGAGCACCGTGTGCCTCATGAACCACGAGCGCCGCCAGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GCTGGACCTCATTGCCGCACTGGCGCTGCAGGCACTGGCTGAGCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106541 GCTGGACCTCATTGCCGCACTGGCGCTGCAGGCACTGGCTGAGCAGGGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CAGCTGCCACTGCCGCCCTGGCCTGGCGCCCTCCAGGCACTGACGGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106591 CAGCTGCCACTGCCGCCCTGGCCTGGCGCCCTCCAGGCACTGACGGGGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GTGCCAGCCACTGTCAATTACTACGTGACCCCCGTGCAACCTCTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106641 GTGCCAGCCACTGTCAATTACTACGTGACCCCCGTGCAACCTCTCCTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :
   1242 TCACGCCTATCCCACCTGGCTGCCTTGTAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 106691 TCACGCCTATCCCACCTGGCTGCCTTGTAAC