seq1 = pF1KB7032.tfa, 1272 bp
seq2 = pF1KB7032/gi568815586r_21665726.tfa (gi568815586r:21665726_21873616), 207891 bp

>pF1KB7032 1272
>gi568815586r:21665726_21873616 (Chr12)

(complement)

1-374  (100001-100374)   100% ->
375-1272  (106994-107891)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGGCCAGAAAGAGTATCATCCCGGAGGAGTATGTGCTGGCGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGGCCAGAAAGAGTATCATCCCGGAGGAGTATGTGCTGGCGCGCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGCAGAGAACCTGCGCAAGCCGCGCATCCGAGACCGCCTCCCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCGCAGAGAACCTGCGCAAGCCGCGCATCCGAGACCGCCTCCCCAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGCTTCATCGCCAAGAGCGGGGCCTGCAACCTGGCGCATAAGAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGCTTCATCGCCAAGAGCGGGGCCTGCAACCTGGCGCATAAGAACATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGTGAGCAAGGACGCTTTCTACAGGACATCTTCACCACCTTGGTGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGTGAGCAAGGACGCTTTCTACAGGACATCTTCACCACCTTGGTGGACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAATGGCGCCACACGCTGGTCATCTTTACCATGTCCTTCCTCTGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAATGGCGCCACACGCTGGTCATCTTTACCATGTCCTTCCTCTGCAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCTGCTCTTCGCTATCATGTGGTGGCTGGTGGCCTTTGCCCATGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCTGCTCTTCGCTATCATGTGGTGGCTGGTGGCCTTTGCCCATGGGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCTATGCTTACATGGAGAAAAGTGGAATGGAGAAAAGTGGTTTGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCTATGCTTACATGGAGAAAAGTGGAATGGAGAAAAGTGGTTTGGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACTGTGTGTGTGACTAATGTCAG         GTCTTTCACTTCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100351 CACTGTGTGTGTGACTAATGTCAGGTA...CAGGTCTTTCACTTCTGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTCTCTTCTCCATTGAAGTTCAAGTTACCATTGGGTTTGGAGGGAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107011 TTCTCTTCTCCATTGAAGTTCAAGTTACCATTGGGTTTGGAGGGAGGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATGACAGAGGAATGCCCTTTGGCCATCACGGTTTTGATTCTCCAGAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107061 ATGACAGAGGAATGCCCTTTGGCCATCACGGTTTTGATTCTCCAGAATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGTGGGTTTGATCATCAATGCAGTCATGTTAGGCTGCATTTTCATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107111 TGTGGGTTTGATCATCAATGCAGTCATGTTAGGCTGCATTTTCATGAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAGCTCAGGCTCACAGAAGGGCAGAAACTTTGATTTTCAGCCGCCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107161 CAGCTCAGGCTCACAGAAGGGCAGAAACTTTGATTTTCAGCCGCCATGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTGATTGCCGTCCGAAATGGCAAGCTGTGCTTCATGTTCCGAGTGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107211 GTGATTGCCGTCCGAAATGGCAAGCTGTGCTTCATGTTCCGAGTGGGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCTGAGGAAAAGCATGATCATTAGTGCCTCTGTGCGCATCCAGGTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107261 CCTGAGGAAAAGCATGATCATTAGTGCCTCTGTGCGCATCCAGGTGGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGAAAACAACTACACCTGAAGGGGAGGTGGTTCCTATTCACCAACTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107311 AGAAAACAACTACACCTGAAGGGGAGGTGGTTCCTATTCACCAACTGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATTCCTGTTGATAACCCAATCGAGAGCAATAACATTTTTCTGGTGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107361 ATTCCTGTTGATAACCCAATCGAGAGCAATAACATTTTTCTGGTGGCCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTTGATCATCTGCCACGTGATTGACAAGCGCAGTCCCCTGTATGACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107411 TTTGATCATCTGCCACGTGATTGACAAGCGCAGTCCCCTGTATGACATCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CAGCAACTGACCTGGCCAACCAAGACTTGGAGGTCATAGTTATTCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107461 CAGCAACTGACCTGGCCAACCAAGACTTGGAGGTCATAGTTATTCTGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGAGTGGTTGAAACTACTGGCATCACCACACAAGCACGAACCTCCTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107511 GGAGTGGTTGAAACTACTGGCATCACCACACAAGCACGAACCTCCTACAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGCTGAGGAGATCCAATGGGGCCACCGCTTTGTGTCCATTGTGACTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107561 TGCTGAGGAGATCCAATGGGGCCACCGCTTTGTGTCCATTGTGACTGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AAGAAGGAGTGTATTCTGTGGATTACTCCAAATTTGGCAACACTGTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107611 AAGAAGGAGTGTATTCTGTGGATTACTCCAAATTTGGCAACACTGTTAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTAGCTGCTCCACGGTGCAGTGCCCGAGAGCTGGATGAGAAACCTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107661 GTAGCTGCTCCACGGTGCAGTGCCCGAGAGCTGGATGAGAAACCTTCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CCTTATTCAGACCCTCCAAAAGAGTGAACTGTCTCATCAAAATTCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107711 CCTTATTCAGACCCTCCAAAAGAGTGAACTGTCTCATCAAAATTCTCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GGAAGCGCAACTCCATGAGAAGAAACAATTCCATGAGGAGGAACAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107761 GGAAGCGCAACTCCATGAGAAGAAACAATTCCATGAGGAGGAACAATTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ATCCGAAGGAACAATTCTTCCCTCATGGTACCAAAGGTGCAATTTATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107811 ATCCGAAGGAACAATTCTTCCCTCATGGTACCAAAGGTGCAATTTATGAC

   1250     .    :    .    :    .    :
   1242 TCCAGAAGGAAATCAAAACACATCGGAATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 107861 TCCAGAAGGAAATCAAAACACATCGGAATCA