seq1 = pF1KB7031.tfa, 1119 bp
seq2 = pF1KB7031/gi568815586r_108191844.tfa (gi568815586r:108191844_108392960), 201117 bp

>pF1KB7031 1119
>gi568815586r:108191844_108392960 (Chr12)

(complement)

1-1119  (100000-101117)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAATGGAGGATGAAGATTACAACACTTCCATCAGTTACGGTGATGA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GAGAATGGAGGATGAAGATTACAACACTTCCATCAGTTACGGTGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATACCCTGATTATTTAGACTCCATTGTGGTTTTGGAGGACTTATCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 ATACCCTGATTATTTAGACTCCATTGTGGTTTTGGAGGACTTATCCCCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAAGCCAGGGTGACCAGGATCTTCCTGGTGGTGGTCTACAGCATCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 TGGAAGCCAGGGTGACCAGGATCTTCCTGGTGGTGGTCTACAGCATCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCTTCCTCGGGATTCTGGGCAATGGTCTGGTGATCATCATTGCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 TGCTTCCTCGGGATTCTGGGCAATGGTCTGGTGATCATCATTGCCACCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGATGAAGAAGACAGTGAACATGGTCTGGTTCCTCAACCTGGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100199 CAAGATGAAGAAGACAGTGAACATGGTCTGGTTCCTCAACCTGGCAGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGATTTCCTGTTCAACGTCTTCCTCCCAATCCATATCACCTATGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100249 CAGATTTCCTGTTCAACGTCTTCCTCCCAATCCATATCACCTATGCCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGGACTACCACTGGGTTTTCGGGACAGCCATGTGCAAGATCAGCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100299 ATGGACTACCACTGGGTTTTCGGGACAGCCATGTGCAAGATCAGCAACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTTCTCATCCACAACATGTTCACCAGCGTCTTCCTGCTGACCATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100349 CCTTCTCATCCACAACATGTTCACCAGCGTCTTCCTGCTGACCATCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTCTGACCGCTGCATCTCTGTGCTCCTCCCTGTCTGGTCCCAGAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100399 GCTCTGACCGCTGCATCTCTGTGCTCCTCCCTGTCTGGTCCCAGAACCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCAGCGTTCGCCTGGCTTACATGGCCTGCATGGTCATCTGGGTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100449 CGCAGCGTTCGCCTGGCTTACATGGCCTGCATGGTCATCTGGGTCCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTTCTTGAGTTCCCCATCTCTCGTCTTCCGGGACACAGCCAACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100499 TTTCTTCTTGAGTTCCCCATCTCTCGTCTTCCGGGACACAGCCAACCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGGGAAAATATCCTGCTTCAACAACTTCAGCCTGTCCACACCTGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100549 ATGGGAAAATATCCTGCTTCAACAACTTCAGCCTGTCCACACCTGGGTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCTCGTGGCCCACTCACTCCCAAATGGACCCTGTGGGGTATAGCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100599 TCCTCGTGGCCCACTCACTCCCAAATGGACCCTGTGGGGTATAGCCGGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATGGTGGTGACTGTCACCCGCTTCCTCTGTGGCTTCCTGGTCCCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100649 CATGGTGGTGACTGTCACCCGCTTCCTCTGTGGCTTCCTGGTCCCAGTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCATCATCACAGCTTGCTACCTCACCATCGTGTGCAAACTGCAGCGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100699 TCATCATCACAGCTTGCTACCTCACCATCGTGTGCAAACTGCAGCGCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGCCTGGCCAAGACCAAGAAGCCCTTCAAGATTATTGTGACCATCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100749 CGCCTGGCCAAGACCAAGAAGCCCTTCAAGATTATTGTGACCATCATCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TACCTTCTTCCTCTGCTGGTGCCCCTACCACACACTCAACCTCCTAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100799 TACCTTCTTCCTCTGCTGGTGCCCCTACCACACACTCAACCTCCTAGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCACCACACTGCCATGCCTGGCTCTGTCTTCAGCCTGGGTTTGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100849 TCCACCACACTGCCATGCCTGGCTCTGTCTTCAGCCTGGGTTTGCCCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCACTGCCCTTGCCATTGCCAACAGCTGCATGAACCCCATTCTGTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100899 GCCACTGCCCTTGCCATTGCCAACAGCTGCATGAACCCCATTCTGTATGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TTTCATGGGTCAGGACTTCAAGAAGTTCAAGGTGGCCCTCTTCTCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100949 TTTCATGGGTCAGGACTTCAAGAAGTTCAAGGTGGCCCTCTTCTCTCGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGGTCAATGCTCTAAGTGAAGATACAGGCCACTCTTCCTACCCCAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100999 TGGTCAATGCTCTAAGTGAAGATACAGGCCACTCTTCCTACCCCAGCCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGAAGCTTTACCAAGATGTCATCAATGAATGAGAGGACTTCTATGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101049 AGAAGCTTTACCAAGATGTCATCAATGAATGAGAGGACTTCTATGAATGA

   1100     .    :    .
   1101 GAGGGAGACCGGCATGCTT
        |||||||||||||||||||
 101099 GAGGGAGACCGGCATGCTT