seq1 = pF1KB7024.tfa, 1278 bp
seq2 = pF1KB7024/gi568815580r_48821375.tfa (gi568815580r:48821375_49050424), 229050 bp

>pF1KB7024 1278
>gi568815580r:48821375_49050424 (Chr18)

(complement)

1-613  (100001-100613)   100% ->
614-667  (101988-102041)   100% ->
668-742  (107870-107944)   100% ->
743-1278  (128515-129050)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCAGGACCAAACGATCTGCGCTCGTCCGGCGTCTCTGGAGGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCAGGACCAAACGATCTGCGCTCGTCCGGCGTCTCTGGAGGAGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCGCCCGGCGGCGAGGACGAGGAGGAGGGCGCAGGGGGAGGTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCGCCCGGCGGCGAGGACGAGGAGGAGGGCGCAGGGGGAGGTGGAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGCGAGCTGCGGGGAGAAGGGGCGACGGACAGCCGAGCGCATGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGGCGAGCTGCGGGGAGAAGGGGCGACGGACAGCCGAGCGCATGGGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTGGCGGCGGCCCGGGCAGGGCTGGATGCTGCCTGGGCAAGGCGGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTGGCGGCGGCCCGGGCAGGGCTGGATGCTGCCTGGGCAAGGCGGTGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGTGCCAAAGGTCACCACCATCCCCACCCGCCAGCCGCGGGCGCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGTGCCAAAGGTCACCACCATCCCCACCCGCCAGCCGCGGGCGCCGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGCCGGGGGCGCCGAGGCGGATCTGAAGGCGCTCACGCACTCGGTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGCCGGGGGCGCCGAGGCGGATCTGAAGGCGCTCACGCACTCGGTGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGAAACTGAAGGAGCGGCAGCTGGAGCTGCTGCTCCAGGCCGTGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGAAACTGAAGGAGCGGCAGCTGGAGCTGCTGCTCCAGGCCGTGGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGCGGCGGGACGCGCACCGCGTGCCTCCTGCTGCCCGGCCGCCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCGCGGCGGGACGCGCACCGCGTGCCTCCTGCTGCCCGGCCGCCTGGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCAGGCTGGGCCCGGGGGCGCCCGCCGGCGCGCAGCCTGCGCAGCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCAGGCTGGGCCCGGGGGCGCCCGCCGGCGCGCAGCCTGCGCAGCCGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCGTCCTACTCGCTCCCCCTCCTGCTGTGCAAAGTGTTCAGGTGGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCGTCCTACTCGCTCCCCCTCCTGCTGTGCAAAGTGTTCAGGTGGCCGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTCAGGCATTCCTCGGAAGTCAAGAGGCTGTGTTGCTGTGAATCTTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTCAGGCATTCCTCGGAAGTCAAGAGGCTGTGTTGCTGTGAATCTTACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGAAGATCAACCCCGAGCTGGTGTGCTGCAACCCCCATCACCTTAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGAAGATCAACCCCGAGCTGGTGTGCTGCAACCCCCATCACCTTAGCCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCTGCGAACTAG         AGTCTCCCCCCCCTCCTTACTCCAGATA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCTGCGAACTAGGTG...CAGAGTCTCCCCCCCCTCCTTACTCCAGATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCCGATGGATTTTCTCAAACCAACTG         CAGACTGTCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102016 CCCGATGGATTTTCTCAAACCAACTGGTG...CAGCAGACTGTCCAGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTGTGCCTTCCTCCGCTGAAACAGGGGGAACGAATTATCTGGCCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107885 CTGTGCCTTCCTCCGCTGAAACAGGGGGAACGAATTATCTGGCCCCTGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GGGCTTTCAG         ATTCCCAACTTCTTCTGGAGCCTGGGGATCG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 107935 GGGCTTTCAGGTA...TAGATTCCCAACTTCTTCTGGAGCCTGGGGATCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GTCACACTGGTGCGTGGTGGCATACTGGGAGGAGAAGACGAGAGTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128546 GTCACACTGGTGCGTGGTGGCATACTGGGAGGAGAAGACGAGAGTGGGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGCTCTACTGTGTCCAGGAGCCCTCTCTGGATATCTTCTATGATCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128596 GGCTCTACTGTGTCCAGGAGCCCTCTCTGGATATCTTCTATGATCTACCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CAGGGGAATGGCTTTTGCCTCGGACAGCTCAATTCGGACAACAAGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128646 CAGGGGAATGGCTTTTGCCTCGGACAGCTCAATTCGGACAACAAGAGTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GCTGGTGCAGAAGGTGCGGAGCAAAATCGGCTGCGGCATCCAGCTGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128696 GCTGGTGCAGAAGGTGCGGAGCAAAATCGGCTGCGGCATCCAGCTGACGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GGGAGGTGGATGGTGTGTGGGTGTACAACCGCAGCAGTTACCCCATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128746 GGGAGGTGGATGGTGTGTGGGTGTACAACCGCAGCAGTTACCCCATCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 ATCAAGTCCGCCACACTGGACAACCCGGACTCCAGGACGCTGTTGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128796 ATCAAGTCCGCCACACTGGACAACCCGGACTCCAGGACGCTGTTGGTACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CAAGGTGTTCCCCGGTTTCTCCATCAAGGCTTTCGACTACGAGAAGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128846 CAAGGTGTTCCCCGGTTTCTCCATCAAGGCTTTCGACTACGAGAAGGCGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 ACAGCCTGCAGCGGCCCAATGACCACGAGTTTATGCAGCAGCCGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128896 ACAGCCTGCAGCGGCCCAATGACCACGAGTTTATGCAGCAGCCGTGGACG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GGCTTTACCGTGCAGATCAGCTTTGTGAAGGGCTGGGGCCAGTGCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128946 GGCTTTACCGTGCAGATCAGCTTTGTGAAGGGCTGGGGCCAGTGCTACAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CCGCCAGTTCATCAGCAGCTGCCCGTGCTGGCTAGAGGTCATCTTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128996 CCGCCAGTTCATCAGCAGCTGCCCGTGCTGGCTAGAGGTCATCTTCAACA

   1300     .
   1274 GCCGG
        |||||
 129046 GCCGG