seq1 = pF1KB7022.tfa, 2916 bp
seq2 = pF1KB7022/gi568815593r_149954072.tfa (gi568815593r:149954072_150186427), 232356 bp

>pF1KB7022 2916
>gi568815593r:149954072_150186427 (Chr5)

(complement)

1-49  (100001-100049)   100% ->
50-307  (105404-105661)   100% ->
308-592  (106092-106376)   100% ->
593-729  (108180-108316)   100% ->
730-889  (108993-109152)   100% ->
890-1082  (112935-113127)   100% ->
1083-1198  (115857-115972)   100% ->
1199-1319  (116126-116246)   100% ->
1320-1510  (116365-116555)   100% ->
1511-1626  (118098-118213)   100% ->
1627-1753  (124579-124705)   100% ->
1754-1858  (124833-124937)   100% ->
1859-1969  (125456-125566)   100% ->
1970-2132  (126566-126728)   100% ->
2133-2221  (128836-128924)   100% ->
2222-2319  (129044-129141)   100% ->
2320-2442  (130087-130209)   100% ->
2443-2554  (130291-130402)   100% ->
2555-2654  (131092-131191)   100% ->
2655-2763  (131998-132106)   100% ->
2764-2916  (132204-132356)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCCAGGAGTTCTGCTGCTCCTGCTGGTGGCCACAGCTTGGCATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100001 ATGGGCCCAGGAGTTCTGCTGCTCCTGCTGGTGGCCACAGCTTGGCATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50         GTCAGGGAATCCCAGTGATAGAGCCCAGTGTCCCTGAGCTGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TA...CAGGTCAGGGAATCCCAGTGATAGAGCCCAGTGTCCCTGAGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCGTGAAGCCAGGAGCAACGGTGACCTTGCGATGTGTGGGCAATGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105446 TCGTGAAGCCAGGAGCAACGGTGACCTTGCGATGTGTGGGCAATGGCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGAATGGGATGGCCCCCCATCACCTCACTGGACCCTGTACTCTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105496 GTGGAATGGGATGGCCCCCCATCACCTCACTGGACCCTGTACTCTGATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCCAGCAGCATCCTCAGCACCAACAACGCTACCTTCCAAAACACGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105546 CTCCAGCAGCATCCTCAGCACCAACAACGCTACCTTCCAAAACACGGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTATCGCTGCACTGAGCCTGGAGACCCCCTGGGAGGCAGCGCCGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105596 CCTATCGCTGCACTGAGCCTGGAGACCCCCTGGGAGGCAGCGCCGCCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACCTCTATGTCAAAG         ACCCTGCCCGGCCCTGGAACGTGCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105646 CACCTCTATGTCAAAGGTG...TAGACCCTGCCCGGCCCTGGAACGTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCACAGGAGGTGGTCGTGTTCGAGGACCAGGACGCACTACTGCCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106117 AGCACAGGAGGTGGTCGTGTTCGAGGACCAGGACGCACTACTGCCCTGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCTCACAGACCCGGTGCTGGAAGCAGGCGTCTCGCTGGTGCGTGTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106167 TGCTCACAGACCCGGTGCTGGAAGCAGGCGTCTCGCTGGTGCGTGTGCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCCGGCCCCTCATGCGCCACACCAACTACTCCTTCTCGCCCTGGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106217 GGCCGGCCCCTCATGCGCCACACCAACTACTCCTTCTCGCCCTGGCATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTCACCATCCACAGGGCCAAGTTCATTCAGAGCCAGGACTATCAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106267 CTTCACCATCCACAGGGCCAAGTTCATTCAGAGCCAGGACTATCAATGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTGCCCTGATGGGTGGCAGGAAGGTGATGTCCATCAGCATCCGGCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106317 GTGCCCTGATGGGTGGCAGGAAGGTGATGTCCATCAGCATCCGGCTGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGCAGAAAG         TCATCCCAGGGCCCCCAGCCTTGACACTGGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106367 GTGCAGAAAGGTG...CAGTCATCCCAGGGCCCCCAGCCTTGACACTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCCTGCAGAGCTGGTGCGGATTCGAGGGGAGGCTGCCCAGATCGTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108211 GCCTGCAGAGCTGGTGCGGATTCGAGGGGAGGCTGCCCAGATCGTGTGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAGCCAGCAGCGTTGATGTTAACTTTGATGTCTTCCTCCAACACAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108261 CAGCCAGCAGCGTTGATGTTAACTTTGATGTCTTCCTCCAACACAACAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCAAG         CTCGCAATCCCTCAACAATCTGACTTTCATAATAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108311 ACCAAGGTC...CAGCTCGCAATCCCTCAACAATCTGACTTTCATAATAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCGTTACCAAAAAGTCCTGACCCTCAACCTCGATCAAGTAGATTTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109028 CCGTTACCAAAAAGTCCTGACCCTCAACCTCGATCAAGTAGATTTCCAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATGCCGGCAACTACTCCTGCGTGGCCAGCAACGTGCAGGGCAAGCACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109078 ATGCCGGCAACTACTCCTGCGTGGCCAGCAACGTGCAGGGCAAGCACTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACCTCCATGTTCTTCCGGGTGGTAG         AGAGTGCCTACTTGAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 109128 ACCTCCATGTTCTTCCGGGTGGTAGGTA...CAGAGAGTGCCTACTTGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTTGAGCTCTGAGCAGAACCTCATCCAGGAGGTGACCGTGGGGGAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112951 CTTGAGCTCTGAGCAGAACCTCATCCAGGAGGTGACCGTGGGGGAGGGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TCAACCTCAAAGTCATGGTGGAGGCCTACCCAGGCCTGCAAGGTTTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113001 TCAACCTCAAAGTCATGGTGGAGGCCTACCCAGGCCTGCAAGGTTTTAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TGGACCTACCTGGGACCCTTTTCTGACCACCAGCCTGAGCCCAAGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113051 TGGACCTACCTGGGACCCTTTTCTGACCACCAGCCTGAGCCCAAGCTTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TAATGCTACCACCAAGGACACATACAG         GCACACCTTCACCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 113101 TAATGCTACCACCAAGGACACATACAGGTA...CAGGCACACCTTCACCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TCTCTCTGCCCCGCCTGAAGCCCTCTGAGGCTGGCCGCTACTCCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115871 TCTCTCTGCCCCGCCTGAAGCCCTCTGAGGCTGGCCGCTACTCCTTCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GCCAGAAACCCAGGAGGCTGGAGAGCTCTGACGTTTGAGCTCACCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115921 GCCAGAAACCCAGGAGGCTGGAGAGCTCTGACGTTTGAGCTCACCCTTCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AT         ACCCCCCAGAGGTAAGCGTCATATGGACATTCATCAACG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115971 ATGTG...CAGACCCCCCAGAGGTAAGCGTCATATGGACATTCATCAACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GCTCTGGCACCCTTTTGTGTGCTGCCTCTGGGTACCCCCAGCCCAACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116165 GCTCTGGCACCCTTTTGTGTGCTGCCTCTGGGTACCCCCAGCCCAACGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ACATGGCTGCAGTGCAGTGGCCACACTGATAG         GTGTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 116215 ACATGGCTGCAGTGCAGTGGCCACACTGATAGGTA...CAGGTGTGATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGCCCAAGTGCTGCAGGTCTGGGATGACCCATACCCTGAGGTCCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116374 GGCCCAAGTGCTGCAGGTCTGGGATGACCCATACCCTGAGGTCCTGAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AGGAGCCCTTCCACAAGGTGACGGTGCAGAGCCTGCTGACTGTTGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116424 AGGAGCCCTTCCACAAGGTGACGGTGCAGAGCCTGCTGACTGTTGAGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 TTAGAGCACAACCAAACCTACGAGTGCAGGGCCCACAACAGCGTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116474 TTAGAGCACAACCAAACCTACGAGTGCAGGGCCCACAACAGCGTGGGGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TGGCTCCTGGGCCTTCATACCCATCTCTGCAG         GAGCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 116524 TGGCTCCTGGGCCTTCATACCCATCTCTGCAGGTG...CAGGAGCCCACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CGCATCCCCCGGATGAGTTCCTCTTCACACCAGTGGTGGTCGCCTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118107 CGCATCCCCCGGATGAGTTCCTCTTCACACCAGTGGTGGTCGCCTGCATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TCCATCATGGCCTTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTATTGTACAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118157 TCCATCATGGCCTTGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTATTGTACAAGTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 TAAGCAG         AAGCCCAAGTACCAGGTCCGCTGGAAGATCATCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118207 TAAGCAGGTG...CAGAAGCCCAAGTACCAGGTCCGCTGGAAGATCATCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AGAGCTATGAGGGCAACAGTTATACTTTCATCGACCCCACGCAGCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124613 AGAGCTATGAGGGCAACAGTTATACTTTCATCGACCCCACGCAGCTGCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 TACAACGAGAAGTGGGAGTTCCCCCGGAACAACCTGCAGTTTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 124663 TACAACGAGAAGTGGGAGTTCCCCCGGAACAACCTGCAGTTTGGTG...C

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1754   GTAAGACCCTCGGAGCTGGAGCCTTTGGGAAGGTGGTGGAGGCCACGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124831 AGGTAAGACCCTCGGAGCTGGAGCCTTTGGGAAGGTGGTGGAGGCCACGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CCTTTGGTCTGGGCAAGGAGGATGCTGTCCTGAAGGTGGCTGTGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124881 CCTTTGGTCTGGGCAAGGAGGATGCTGTCCTGAAGGTGGCTGTGAAGATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CTGAAGT         CCACGGCCCATGCTGATGAGAAGGAGGCCCTCAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124931 CTGAAGTGTG...CAGCCACGGCCCATGCTGATGAGAAGGAGGCCCTCAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GTCCGAGCTGAAGATCATGAGCCACCTGGGCCAGCACGAGAACATCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125490 GTCCGAGCTGAAGATCATGAGCCACCTGGGCCAGCACGAGAACATCGTCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 ACCTTCTGGGAGCCTGTACCCATGGAG         GCCCTGTACTGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 125540 ACCTTCTGGGAGCCTGTACCCATGGAGGTA...TAGGCCCTGTACTGGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 ATCACGGAGTACTGTTGCTATGGCGACCTGCTCAACTTTCTGCGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126580 ATCACGGAGTACTGTTGCTATGGCGACCTGCTCAACTTTCTGCGAAGGAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GGCTGAGGCCATGCTGGGACCCAGCCTGAGCCCCGGCCAGGACCCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126630 GGCTGAGGCCATGCTGGGACCCAGCCTGAGCCCCGGCCAGGACCCCGAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GAGGCGTCGACTATAAGAACATCCACCTCGAGAAGAAATATGTCCGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 126680 GAGGCGTCGACTATAAGAACATCCACCTCGAGAAGAAATATGTCCGCAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2133         GGACAGTGGCTTCTCCAGCCAGGGTGTGGACACCTATGTGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126730 TA...TAGGGACAGTGGCTTCTCCAGCCAGGGTGTGGACACCTATGTGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GATGAGGCCTGTCTCCACTTCTTCAAATGACTCCTTCTCTGAGCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 128878 GATGAGGCCTGTCTCCACTTCTTCAAATGACTCCTTCTCTGAGCAAGGTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2222       ACCTGGACAAGGAGGATGGACGGCCCCTGGAGCTCCGGGACCTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128928 ...TAGACCTGGACAAGGAGGATGGACGGCCCCTGGAGCTCCGGGACCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CTTCACTTCTCCAGCCAAGTAGCCCAGGGCATGGCCTTCCTCGCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129088 CTTCACTTCTCCAGCCAAGTAGCCCAGGGCATGGCCTTCCTCGCTTCCAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GAAT         TGCATCCACCGGGACGTGGCAGCGCGTAACGTGCTGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129138 GAATGTG...CAGTGCATCCACCGGGACGTGGCAGCGCGTAACGTGCTGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 TGACCAATGGTCATGTGGCCAAGATTGGGGACTTCGGGCTGGCTAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130124 TGACCAATGGTCATGTGGCCAAGATTGGGGACTTCGGGCTGGCTAGGGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 ATCATGAATGACTCCAACTACATTGTCAAGGGCAAT         GCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 130174 ATCATGAATGACTCCAACTACATTGTCAAGGGCAATGTA...CAGGCCCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 CCTGCCTGTGAAGTGGATGGCCCCAGAGAGCATCTTTGACTGTGTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130296 CCTGCCTGTGAAGTGGATGGCCCCAGAGAGCATCTTTGACTGTGTCTACA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 CGGTTCAGAGCGACGTCTGGTCCTATGGCATCCTCCTCTGGGAGATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130346 CGGTTCAGAGCGACGTCTGGTCCTATGGCATCCTCCTCTGGGAGATCTTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 TCACTTG         GGCTGAATCCCTACCCTGGCATCCTGGTGAACAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130396 TCACTTGGTG...CAGGGCTGAATCCCTACCCTGGCATCCTGGTGAACAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 CAAGTTCTATAAACTGGTGAAGGATGGATACCAAATGGCCCAGCCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131126 CAAGTTCTATAAACTGGTGAAGGATGGATACCAAATGGCCCAGCCTGCAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TTGCCCCAAAGAATAT         ATACAGCATCATGCAGGCCTGCTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 131176 TTGCCCCAAAGAATATGTA...CAGATACAGCATCATGCAGGCCTGCTGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 GCCTTGGAGCCCACCCACAGACCCACCTTCCAGCAGATCTGCTCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132023 GCCTTGGAGCCCACCCACAGACCCACCTTCCAGCAGATCTGCTCCTTCCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 TCAGGAGCAGGCCCAAGAGGACAGGAGAGAGCGG         GACTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 132073 TCAGGAGCAGGCCCAAGAGGACAGGAGAGAGCGGGTG...CAGGACTATA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 CCAATCTGCCGAGCAGCAGCAGAAGCGGTGGCAGCGGCAGCAGCAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132211 CCAATCTGCCGAGCAGCAGCAGAAGCGGTGGCAGCGGCAGCAGCAGCAGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821 GAGCTGGAGGAGGAGAGCTCTAGTGAGCACCTGACCTGCTGCGAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132261 GAGCTGGAGGAGGAGAGCTCTAGTGAGCACCTGACCTGCTGCGAGCAAGG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2871 GGATATCGCCCAGCCCTTGCTGCAGCCCAACAACTATCAGTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132311 GGATATCGCCCAGCCCTTGCTGCAGCCCAACAACTATCAGTTCTGC