Result of SIM4 for
pF1KB7020
seq1 = pF1KB7020.tfa, 2994 bp
seq2 = pF1KB7020/gi568815595f_184471316.tfa (gi568815595f:184471316_184681619), 210304 bp
>pF1KB7020 2994
>gi568815595f:184471316_184681619 (Chr3)
1-118 (90921-91038) 100% ->
119-183 (100003-100067) 100% ->
184-856 (101189-101861) 99% ->
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2889-2994 (110199-110304) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCCAGAGCCCGCCCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGCCGGGGCTTCT
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90921 ATGGCCAGAGCCCGCCCGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGCCGGGGCTTCT
50 . : . : . : . : . :
51 GCCGCTGCTCCCTCCGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCCCGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
90971 GCCGCTGCTCCCTCCGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCCCGCCG
100 . : . : . : . : . :
101 GCTGCCGGGCGCTGGAAG AGACCCTCATGGACACAAAATGG
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
91021 GCTGCCGGGCGCTGGAAGGTG...CAGAGACCCTCATGGACACAAAATGG
150 . : . : . : . : . :
142 GTAACATCTGAGTTGGCGTGGACATCTCATCCAGAAAGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
100026 GTAACATCTGAGTTGGCGTGGACATCTCATCCAGAAAGTGGGGTG...CA
200 . : . : . : . : . :
184 TGGGAAGAGGTGAGTGGCTACGATGAGGCCATGAATCCCATCCGCACAT
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101188 GTGGGAAGAGGTGAGTGGCTACGATGAGGCCATGAATCCCATCCGCACAT
250 . : . : . : . : . :
233 ACCAGGTATGTAATGTGCGCGAGTCAAGCCAGAACAACTGGCTTCGCACG
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101238 ACCAGGTGTGTAATGTGCGCGAGTCAAGCCAGAACAACTGGCTTCGCACG
300 . : . : . : . : . :
283 GGGTTCATCTGGCGGCGGGATGTGCAGCGGGTCTACGTGGAGCTCAAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101288 GGGTTCATCTGGCGGCGGGATGTGCAGCGGGTCTACGTGGAGCTCAAGTT
350 . : . : . : . : . :
333 CACTGTGCGTGACTGCAACAGCATCCCCAACATCCCCGGCTCCTGCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101338 CACTGTGCGTGACTGCAACAGCATCCCCAACATCCCCGGCTCCTGCAAGG
400 . : . : . : . : . :
383 AGACCTTCAACCTCTTCTACTACGAGGCTGACAGCGATGTGGCCTCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101388 AGACCTTCAACCTCTTCTACTACGAGGCTGACAGCGATGTGGCCTCAGCC
450 . : . : . : . : . :
433 TCCTCCCCCTTCTGGATGGAGAACCCCTACGTGAAAGTGGACACCATTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101438 TCCTCCCCCTTCTGGATGGAGAACCCCTACGTGAAAGTGGACACCATTGC
500 . : . : . : . : . :
483 ACCCGATGAGAGCTTCTCGCGGCTGGATGCCGGCCGTGTCAACACCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101488 ACCCGATGAGAGCTTCTCGCGGCTGGATGCCGGCCGTGTCAACACCAAGG
550 . : . : . : . : . :
533 TGCGCAGCTTTGGGCCACTTTCCAAGGCTGGCTTCTACCTGGCCTTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101538 TGCGCAGCTTTGGGCCACTTTCCAAGGCTGGCTTCTACCTGGCCTTCCAG
600 . : . : . : . : . :
583 GACCAGGGCGCCTGCATGTCGCTCATCTCCGTGCGCGCCTTCTACAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101588 GACCAGGGCGCCTGCATGTCGCTCATCTCCGTGCGCGCCTTCTACAAGAA
650 . : . : . : . : . :
633 GTGTGCATCCACCACCGCAGGCTTCGCACTCTTCCCCGAGACCCTCACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101638 GTGTGCATCCACCACCGCAGGCTTCGCACTCTTCCCCGAGACCCTCACTG
700 . : . : . : . : . :
683 GGGCGGAGCCCACCTCGCTGGTCATTGCTCCTGGCACCTGCATCCCTAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101688 GGGCGGAGCCCACCTCGCTGGTCATTGCTCCTGGCACCTGCATCCCTAAC
750 . : . : . : . : . :
733 GCCGTGGAGGTGTCGGTGCCACTCAAGCTCTACTGCAACGGCGATGGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101738 GCCGTGGAGGTGTCGGTGCCACTCAAGCTCTACTGCAACGGCGATGGGGA
800 . : . : . : . : . :
783 GTGGATGGTGCCTGTGGGTGCCTGCACCTGTGCCACCGGCCATGAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101788 GTGGATGGTGCCTGTGGGTGCCTGCACCTGTGCCACCGGCCATGAGCCAG
850 . : . : . : . : . :
833 CTGCCAAGGAGTCCCAGTGCCGCC CCTGTCCCCCTGGGAGC
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
101838 CTGCCAAGGAGTCCCAGTGCCGCCGTG...CAGCCTGTCCCCCTGGGAGC
900 . : . : . : . : . :
874 TACAAGGCGAAGCAGGGAGAGGGGCCCTGCCTCCCATGTCCCCCCAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104532 TACAAGGCGAAGCAGGGAGAGGGGCCCTGCCTCCCATGTCCCCCCAACAG
950 . : . : . : . : . :
924 CCGTACCACCTCCCCAGCCGCCAGCATCTGCACCTGCCACAATAACTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104582 CCGTACCACCTCCCCAGCCGCCAGCATCTGCACCTGCCACAATAACTTCT
1000 . : . : . : . : . :
974 ACCGTGCAGACTCGGACTCTGCGGACAGTGCCTGCACCA CC
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||>>>...>>>||
104632 ACCGTGCAGACTCGGACTCTGCGGACAGTGCCTGTACCAGTG...CAGCC
1050 . : . : . : . : . :
1015 GTGCCATCTCCACCCCGAGGTGTGATCTCCAATGTGAATGAAACCTCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105529 GTGCCATCTCCACCCCGAGGTGTGATCTCCAATGTGAATGAAACCTCACT
1100 . : . : . : . : . :
1065 GATCCTCGAGTGGAGTGAGCCCCGGGACCTGGGTGGCCGGGATGACCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105579 GATCCTCGAGTGGAGTGAGCCCCGGGACCTGGGTGGCCGGGATGACCTCC
1150 . : . : . : . : . :
1115 TGTACAATGTCATCTGCAAGAAGTGCCATGGGGCTGGAGGGGCCTCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105629 TGTACAATGTCATCTGCAAGAAGTGCCATGGGGCTGGAGGGGCCTCAGCC
1200 . : . : . : . : . :
1165 TGCTCACGCTGTGATGACAACGTGGAGTTTGTGCCTCGGCAGCTGGGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105679 TGCTCACGCTGTGATGACAACGTGGAGTTTGTGCCTCGGCAGCTGGGCCT
1250 . : . : . : . : . :
1215 GACGGAGCGCCGGGTCCACATCAGCCATCTGCTGGCCCACACGCGCTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105729 GACGGAGCGCCGGGTCCACATCAGCCATCTGCTGGCCCACACGCGCTACA
1300 . : . : . : . : . :
1265 CCTTTGAGGTGCAGGCGGTCAACGGTGTCTCGGGCAAGAGCCCTCTGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105779 CCTTTGAGGTGCAGGCGGTCAACGGTGTCTCGGGCAAGAGCCCTCTGCCG
1350 . : . : . : . : . :
1315 CCTCGTTATGCGGCCGTGAATATCACCACAAACCAGGCTG C
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
105829 CCTCGTTATGCGGCCGTGAATATCACCACAAACCAGGCTGGTG...CAGC
1400 . : . : . : . : . :
1356 CCCGTCTGAAGTGCCCACACTACGCCTGCACAGCAGCTCAGGCAGCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106029 CCCGTCTGAAGTGCCCACACTACGCCTGCACAGCAGCTCAGGCAGCAGCC
1450 . : . : . : . : . :
1406 TCACCCTATCCTGGGCACCCCCAGAGCGGCCCAACGGAGTCATCCTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106079 TCACCCTATCCTGGGCACCCCCAGAGCGGCCCAACGGAGTCATCCTGGAC
1500 . : . : . : . : . :
1456 TACGAGATGAAGTACTTTGAGAAG AGCGAGGGCATCGCCTC
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
106129 TACGAGATGAAGTACTTTGAGAAGGTC...CAGAGCGAGGGCATCGCCTC
1550 . : . : . : . : . :
1497 CACAGTGACCAGCCAGATGAACTCCGTGCAGCTGGACGGGCTTCGGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106360 CACAGTGACCAGCCAGATGAACTCCGTGCAGCTGGACGGGCTTCGGCCTG
1600 . : . : . : . : . :
1547 ACGCCCGCTATGTGGTCCAGGTCCGTGCCCGCACAGTAGCTGGCTATGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106410 ACGCCCGCTATGTGGTCCAGGTCCGTGCCCGCACAGTAGCTGGCTATGGG
1650 . : . : . : . : . :
1597 CAGTACAGCCGCCCTGCCGAGTTTGAGACCACAAGTGAGAGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
106460 CAGTACAGCCGCCCTGCCGAGTTTGAGACCACAAGTGAGAGAGGTT...C
1700 . : . : . : . : . :
1640 GCTCTGGGGCCCAGCAGCTCCAGGAGCAGCTTCCCCTCATCGTGGGCT
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106581 AGGCTCTGGGGCCCAGCAGCTCCAGGAGCAGCTTCCCCTCATCGTGGGCT
1750 . : . : . : . : . :
1688 CCGCTACAGCTGGGCTTGTCTTCGTGGTGGCTGTCGTGGTCATCGCTATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106631 CCGCTACAGCTGGGCTTGTCTTCGTGGTGGCTGTCGTGGTCATCGCTATC
1800 . : . : . : . : . :
1738 GTCTGCCTCAG GAAGCAGCGACACGGCTCTGATTCGGAGTA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
106681 GTCTGCCTCAGGTA...CAGGAAGCAGCGACACGGCTCTGATTCGGAGTA
1850 . : . : . : . : . :
1779 CACGGAGAAGCTGCAGCAGTACA TTGCTCCTGGAATGAAGG
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
107129 CACGGAGAAGCTGCAGCAGTACAGTG...CAGTTGCTCCTGGAATGAAGG
1900 . : . : . : . : . :
1820 TTTATATTGACCCTTTTACCTACGAGGACCCTAATGAGGCTGTTCGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108180 TTTATATTGACCCTTTTACCTACGAGGACCCTAATGAGGCTGTTCGGGAG
1950 . : . : . : . : . :
1870 TTTGCCAAGGAGATCGACGTGTCCTGCGTCAAGATCGAGGAGGTGATCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108230 TTTGCCAAGGAGATCGACGTGTCCTGCGTCAAGATCGAGGAGGTGATCGG
2000 . : . : . : . : . :
1920 AGCTG GGGAATTTGGGGAAGTGTGCCGTGGTCGACTGAAAC
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108280 AGCTGGTG...CAGGGGAATTTGGGGAAGTGTGCCGTGGTCGACTGAAAC
2050 . : . : . : . : . :
1961 AGCCTGGCCGCCGAGAGGTGTTTGTGGCCATCAAGACGCTGAAGGTGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108408 AGCCTGGCCGCCGAGAGGTGTTTGTGGCCATCAAGACGCTGAAGGTGGGC
2100 . : . : . : . : . :
2011 TACACCGAGAGGCAGCGGCGGGACTTCCTAAGCGAGGCCTCCATCATGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108458 TACACCGAGAGGCAGCGGCGGGACTTCCTAAGCGAGGCCTCCATCATGGG
2150 . : . : . : . : . :
2061 TCAGTTTGATCACCCCAATATAATCCGGCTCGAGGGCGTGGTCACCAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108508 TCAGTTTGATCACCCCAATATAATCCGGCTCGAGGGCGTGGTCACCAAAA
2200 . : . : . : . : . :
2111 GTCGGCCAGTTATGATCCTCACTGAGTTCATGGAAAACTGCGCCCTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108558 GTCGGCCAGTTATGATCCTCACTGAGTTCATGGAAAACTGCGCCCTGGAC
2250 . : . : . : . : . :
2161 TCCTTCCTCCGG CTCAACGATGGGCAGTTCACGGTCATCCA
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
108608 TCCTTCCTCCGGGTA...CAGCTCAACGATGGGCAGTTCACGGTCATCCA
2300 . : . : . : . : . :
2202 GCTGGTGGGCATGTTGCGGGGCATTGCTGCCGGCATGAAGTACCTGTCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109116 GCTGGTGGGCATGTTGCGGGGCATTGCTGCCGGCATGAAGTACCTGTCCG
2350 . : . : . : . : . :
2252 AGATGAACTATGTGCACCGCGACCTGGCTGCTCGCAACATCCTTGTCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109166 AGATGAACTATGTGCACCGCGACCTGGCTGCTCGCAACATCCTTGTCAAC
2400 . : . : . : . : . :
2302 AGCAACCTGGTCTGCAAAGTCTCAGACTTTGGCCTCTCCCGCTTCCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109216 AGCAACCTGGTCTGCAAAGTCTCAGACTTTGGCCTCTCCCGCTTCCTGGA
2450 . : . : . : . : . :
2352 GGATGACCCCTCCGATCCTACCTACACCAGTTCCCTG GGCG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
109266 GGATGACCCCTCCGATCCTACCTACACCAGTTCCCTGGTA...CAGGGCG
2500 . : . : . : . : . :
2393 GGAAGATCCCCATCCGCTGGACTGCCCCAGAGGCCATAGCCTATCGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109418 GGAAGATCCCCATCCGCTGGACTGCCCCAGAGGCCATAGCCTATCGGAAG
2550 . : . : . : . : . :
2443 TTCACTTCTGCTAGTGATGTCTGGAGCTACGGAATTGTCATGTGGGAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109468 TTCACTTCTGCTAGTGATGTCTGGAGCTACGGAATTGTCATGTGGGAGGT
2600 . : . : . : . : . :
2493 CATGAGCTATGGAGAGCGACCCTACTGGGACATGAGCAACCAAGAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||>>>.
109518 CATGAGCTATGGAGAGCGACCCTACTGGGACATGAGCAACCAGGATGTG.
2650 . : . : . : . : . :
2539 GTCATCAATGCCGTGGAGCAGGATTACCGGCTGCCACCACCCATG
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109568 ..CAGGTCATCAATGCCGTGGAGCAGGATTACCGGCTGCCACCACCCATG
2700 . : . : . : . : . :
2584 GACTGTCCCACAGCACTGCACCAGCTCATGCTGGACTGCTGGGTGCGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109702 GACTGTCCCACAGCACTGCACCAGCTCATGCTGGACTGCTGGGTGCGGGA
2750 . : . : . : . : . :
2634 CCGGAACCTCAGGCCCAAATTCTCCCAGATTGTCAATACCCTGGACAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109752 CCGGAACCTCAGGCCCAAATTCTCCCAGATTGTCAATACCCTGGACAAGC
2800 . : . : . : . : . :
2684 TCATCCGCAATGCTGCCAGCCTCAAGGTCATTGCCAGCGCTCAGTCTGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
109802 TCATCCGCAATGCTGCCAGCCTCAAGGTCATTGCCAGCGCTCAGTCTGGG
2850 . : . : . : . : . :
2733 CATGTCACAGCCCCTCCTGGACCGCACGGTCCCAGATTACAC
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109852 TT...CAGCATGTCACAGCCCCTCCTGGACCGCACGGTCCCAGATTACAC
2900 . : . : . : . : . :
2775 AACCTTCACGACAGTTGGTGATTGGCTGGATGCCATCAAGATGGGGCGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109980 AACCTTCACGACAGTTGGTGATTGGCTGGATGCCATCAAGATGGGGCGGT
2950 . : . : . : . : . :
2825 ACAAGGAGAGCTTCGTCAGTGCGGGGTTTGCATCCTTTGACCTGGTGGCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
110030 ACAAGGAGAGCTTCGTCAGTGCGGGGTTTGCATCTTTTGACCTGGTGGCC
3000 . : . : . : . : . :
2875 CAGATGACGGCAGA AGACCTGCTCCGTATTGGGGTCACCCT
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
110080 CAGATGACGGCAGAGTA...CAGAGACCTGCTCCGTATTGGGGTCACCCT
3050 . : . : . : . : . :
2916 GGCCGGCCACCAGAAGAAGATCCTGAGCAGTATCCAGGACATGCGGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110226 GGCCGGCCACCAGAAGAAGATCCTGAGCAGTATCCAGGACATGCGGCTGC
3100 . : . : .
2966 AGATGAACCAGACGCTGCCTGTGCAGGTC
|||||||||||||||||||||||||||||
110276 AGATGAACCAGACGCTGCCTGTGCAGGTC