Result of SIM4 for pF1KB7011

seq1 = pF1KB7011.tfa, 3135 bp
seq2 = pF1KB7011/gi568815585f_98113243.tfa (gi568815585f:98113243_98548314), 435072 bp

>pF1KB7011 3135
>gi568815585f:98113243_98548314 (Chr13)

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172-276  (230520-230624)   100% ->
277-319  (252153-252195)   100% ->
320-398  (254875-254953)   100% ->
399-496  (264579-264676)   100% ->
497-611  (271488-271602)   100% ->
612-759  (272425-272572)   99% ->
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856-1019  (276715-276878)   100% ->
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1089-1164  (280401-280476)   100% ->
1165-1414  (281985-282234)   100% ->
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1603-1692  (297492-297581)   100% ->
1693-1826  (298659-298792)   100% ->
1827-1905  (311330-311408)   100% ->
1906-2143  (317801-318038)   99% ->
2144-2274  (322334-322464)   100% ->
2275-2343  (325562-325630)   100% ->
2344-2433  (325865-325954)   100% ->
2434-2516  (326719-326801)   100% ->
2517-2629  (326881-326993)   100% ->
2630-2796  (327428-327594)   100% ->
2797-2904  (332856-332963)   100% ->
2905-3056  (333424-333575)   100% ->
3057-3135  (334994-335072)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGAAATAGAGCAGAGGCCGACCCCAGGATCACGACTGGGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGAAATAGAGCAGAGGCCGACCCCAGGATCACGACTGGGGGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAAATTCGGGGATCAGTACCTTGGAACGTGGACAGAAGCCGCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAAAATTCGGGGATCAGTACCTTGGAACGTGGACAGAAGCCGCCCCCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACCTTCAGGAAAACTCGTGTCCATCAAAATCCAGATGCTGGATGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACCTTCAGGAAAACTCGTGTCCATCAAAATCCAGATGCTGGATGACACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGAGGCATTTGAAGTTCCA         CAAAGAGCTCCTGGGAAGGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100151 CAGGAGGCATTTGAAGTTCCAGTA...CAGCAAAGAGCTCCTGGGAAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGCTGGATGCAGTTTGCAACCACCTCAACCTCGTGGAAGGTGACTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230540 GCTGCTGGATGCAGTTTGCAACCACCTCAACCTCGTGGAAGGTGACTATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGGCCTCGAGTTTCCTGATCACAAAAAGATCACG         GTGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 230590 TTGGCCTCGAGTTTCCTGATCACAAAAAGATCACGGTA...TAGGTGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGATCTCCTAAAACCCATTGTGAAACAGATTAGAA         GGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 252159 CTGGATCTCCTAAAACCCATTGTGAAACAGATTAGAAGTG...TAGGGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAGCACGTTGTTGTTAAGTTTGTGGTGAAATTCTTTCCGCCTGACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254879 AAAGCACGTTGTTGTTAAGTTTGTGGTGAAATTCTTTCCGCCTGACCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CACAACTCCAAGAAGAACTCACAAG         GTACCTGTTCGCGCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 254929 CACAACTCCAAGAAGAACTCACAAGGTT...CAGGTACCTGTTCGCGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAGGTGAAGCAGGACTTGGCTCAAGGCAGGTTGACGTGTAATGACACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264595 CAGGTGAAGCAGGACTTGGCTCAAGGCAGGTTGACGTGTAATGACACCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGCAGCTCTCTTGATTTCACACATTGTGCAAT         CTGAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 264645 CGCAGCTCTCTTGATTTCACACATTGTGCAATGTA...TAGCTGAGATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GGGATTTTGATGAAGCCTTGGACAGAGAGCACTTAGCAAAAAATAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271497 GGGATTTTGATGAAGCCTTGGACAGAGAGCACTTAGCAAAAAATAAATAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATACCTCAGCAAGACGCACTAGAGGACAAAATCGTGGAATTTCACCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271547 ATACCTCAGCAAGACGCACTAGAGGACAAAATCGTGGAATTTCACCATAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCACAT         TGGACAAACACCAGCAGAATCAGATTTCCAGCTCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 271597 CCACATGTA...CAGTGGACAAACACCAGCAGAATCAGATTTCCAGCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TAGAGATTGCCCGTCGGCTAGAGATGTATGGAATCCGGTTGCACCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272460 TAGAGATTGCCCGTCGGCTAGAGATGTATGGAATCCGGTTGCACCCGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAGGACAGGGAAGGCACGAAGATCAATCTGGCCGTTGCCAACACGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272510 AAGGACAGGGAAGGCACGAAGATCAATCTGGCCGTTGCCAACACGGGAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCTAGTGTTTCAG         GGTTTCACTAAGATCAATGCCTTCAACT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 272560 TCTAGTGTTTCAGGTG...TAGGGTTTCACTAAGATCAATGCCTTCAACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGGCCAAGGTGCGGAAGCTGAGCTTCAAGAGGAAGCGCTTTCTCATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275169 GGGCCAAGGTGCGGAAGCTGAGCTTCAAGAGGAAGCGCTTTCTCATCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTCCGGCCAGATGCCAAT         AGTGCGTACCAGGATACCTTGGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 275219 CTCCGGCCAGATGCCAATGTA...TAGAGTGCGTACCAGGATACCTTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 ATTCCTGATGGCCAGTCGGGATTTCTGCAAGTCCTTCTGGAAAATCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276738 ATTCCTGATGGCCAGTCGGGATTTCTGCAAGTCCTTCTGGAAAATCTGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TTGAACATCATGCCTTCTTTAGACTTTTTGAAGAGCCCAAACCAAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276788 TTGAACATCATGCCTTCTTTAGACTTTTTGAAGAGCCCAAACCAAAGCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAGCCCGTCCTCTTTAGCCGGGGGTCATCATTTCGGTTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 276838 AAGCCCGTCCTCTTTAGCCGGGGGTCATCATTTCGGTTCAGGTG...CAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGGTCGGACTCAGAAGCAGGTTCTCGACTATGTTAAAGAAGGAGGACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277570 TGGTCGGACTCAGAAGCAGGTTCTCGACTATGTTAAAGAAGGAGGACATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGAAGGTGCAGTTTGAAAG         GAAGCACAGCAAGATTCATTCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 277620 AGAAGGTGCAGTTTGAAAGGTA...CAGGAAGCACAGCAAGATTCATTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 ATCCGGAGCCTTGCTTCACAGCCTACAGAACTGAATTCGGAAGTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280423 ATCCGGAGCCTTGCTTCACAGCCTACAGAACTGAATTCGGAAGTGCTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GCAG         TCTCAGCAGAGCACCAGCCTTACATTTGGAGAAGGTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280473 GCAGGTC...CAGTCTCAGCAGAGCACCAGCCTTACATTTGGAGAAGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CCGAATCTCCAGGGGGCCAGAGCTGCCGGCGAGGAAAGGAACCGAAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 282022 CCGAATCTCCAGGGGGCCAGAGCTGCCGGCGAGGAAAGGAACCGAAGGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TCCGCCGGGGAGCCGGGGTCGCACCCGAGCCCTGCGCCGAGGAGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 282072 TCCGCCGGGGAGCCGGGGTCGCACCCGAGCCCTGCGCCGAGGAGAAGCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CGCGGGTAACAAGCAGGCGGACGGAGCCGCCTCGGCGCCCACGGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 282122 CGCGGGTAACAAGCAGGCGGACGGAGCCGCCTCGGCGCCCACGGAGGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGGAGGAGGTCGTTAAGGATAGGACCCAGCAGAGTAAACCTCAGCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 282172 AGGAGGAGGTCGTTAAGGATAGGACCCAGCAGAGTAAACCTCAGCCCCCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CAGCCAAGCACAG         GCTCCCTGACTGGCAGTCCTCACCTTTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 282222 CAGCCAAGCACAGGTC...CAGGCTCCCTGACTGGCAGTCCTCACCTTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CGAGCTGTCTGTGAACTCGCAGGGGGGAGTGGCCCCTGCCAACGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296124 CGAGCTGTCTGTGAACTCGCAGGGGGGAGTGGCCCCTGCCAACGTGACCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGTCTCCCAACCTGAGCCCCGACACCAAGCAGGCCTCTCCCTTGATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296174 TGTCTCCCAACCTGAGCCCCGACACCAAGCAGGCCTCTCCCTTGATCAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CCGCTGCTGAATGACCAGGCCTGCCCCCGGACGGACGATGAGGATGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296224 CCGCTGCTGAATGACCAGGCCTGCCCCCGGACGGACGATGAGGATGAGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CCGGAGGAAG         AGATTCCCAACTGATAAAGCGTACTTCATAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 296274 CCGGAGGAAGGTA...CAGAGATTCCCAACTGATAAAGCGTACTTCATAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CTAAGGAAGTGTCTACCACCGAGCGAACATATCTGAAGGATCTCGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 297523 CTAAGGAAGTGTCTACCACCGAGCGAACATATCTGAAGGATCTCGAAGTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ATCACTTCG         TGGTTTCAGAGCACAGTGAGCAAAGAGGACGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 297573 ATCACTTCGGTA...CAGTGGTTTCAGAGCACAGTGAGCAAAGAGGACGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 CATGCCGGAAGCACTGAAAAGTCTCATATTCCCGAATTTTGAACCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 298691 CATGCCGGAAGCACTGAAAAGTCTCATATTCCCGAATTTTGAACCTTTGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 ACAAATTTCATACTAATTTTCTCAAGGAAATTGAGCAACGACTTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 298741 ACAAATTTCATACTAATTTTCTCAAGGAAATTGAGCAACGACTTGCCCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TG         GGAAGGCCGCTCAAATGCCCAAATCAGAGATTACCAAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 298791 TGGTG...CAGGGAAGGCCGCTCAAATGCCCAAATCAGAGATTACCAAAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 AATCGGCGATGTCATGCTGAAGAACATTCAGGGCATGAAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 311369 AATCGGCGATGTCATGCTGAAGAACATTCAGGGCATGAAGGTG...AAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 ACCTGGCGGCTCACCTGTGGAAGCACAGCGAGGCCTTGGAGGCCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 317802 ACCTGGCGGCTCACCTGTGGAAGCACAGCGAGGCCTTGGAGGCCCTGGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 AATGGAATCAAGAGCTCCCGGCGGCTGGAGAACTTCTGCAGAGACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 317852 AATGGAATCAAGAGCTCCCGGCGGCTGGAGAACTTCTGCAGAGACTTTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 GCTGCAGAAGGTGTGTTACCTACCGCTCAACACCTTCCTCCTGCGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 317902 GCTGCAGAAGGTGTGTTACCTACCGCTCAACACCTTCCTCCTGCGGCCAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TGCACCGGCTCATGCACTACAACCAGGTCCTGGAGCGGCTGTGCAAACAC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 317952 TGCACCGGCTCATGCACTACAAGCAGGTCCTGGAGCGGCTGTGCAAACAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CACCCGCCGAGCCACGCCGACTTCAGGGACTGCCGAG         CCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 318002 CACCCGCCGAGCCACGCCGACTTCAGGGACTGCCGAGGTG...CAGCCGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TTTGGCAGAGATCACGGAGATGGTGGCACAGCTCCACGGTACGATGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 322338 TTTGGCAGAGATCACGGAGATGGTGGCACAGCTCCACGGTACGATGATCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 AGATGGAGAATTTCCAGAAGCTGCACGAACTCAAGAAAGATTTGATTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 322388 AGATGGAGAATTTCCAGAAGCTGCACGAACTCAAGAAAGATTTGATTGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 ATTGACAATCTTGTGGTTCCGGGAAGG         GAGTTCATCCGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 322438 ATTGACAATCTTGTGGTTCCGGGAAGGGTA...CAGGAGTTCATCCGTCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GGGCAGCCTCAGCAAGCTCTCGGGGAAGGGGCTCCAGCAGCGCATGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 325576 GGGCAGCCTCAGCAAGCTCTCGGGGAAGGGGCTCCAGCAGCGCATGTTCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 TCCTG         TTCAACGACGTCCTGCTATACACGAGCCGGGGGCTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 325626 TCCTGGTG...CAGTTCAACGACGTCCTGCTATACACGAGCCGGGGGCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 ACGGCCTCCAATCAGTTTAAAGTCCACGGGCAGCTCCCGCTCTATGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 325901 ACGGCCTCCAATCAGTTTAAAGTCCACGGGCAGCTCCCGCTCTATGGCAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 GACG         ATTGAGGAGAGCGAAGACGAGTGGGGGGTGCCCCACT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 325951 GACGGTG...CAGATTGAGGAGAGCGAAGACGAGTGGGGGGTGCCCCACT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 GCCTGACCCTCCGGGGCCAGCGGCAGTCCATCATCGTGGCCGCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 326756 GCCTGACCCTCCGGGGCCAGCGGCAGTCCATCATCGTGGCCGCCAGGTA.

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2517      TTCTCGGTCCGAGATGGAGAAGTGGGTTGAGGACATCCAGATGGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 326806 ..CAGTTCTCGGTCCGAGATGGAGAAGTGGGTTGAGGACATCCAGATGGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 CATTGACCTGGCGGAGAAGAGCAGCAGCCCCGCCCCTGAGTTCCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 326926 CATTGACCTGGCGGAGAAGAGCAGCAGCCCCGCCCCTGAGTTCCTGGCCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 GCAGCCCCCCTGACAACA         AGTCCCCTGATGAAGCCACCGCG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 326976 GCAGCCCCCCTGACAACAGTG...TAGAGTCCCCTGATGAAGCCACCGCG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 GCTGACCAGGAGTCAGAGGATGACCTGAGCGCCTCGCGCACATCGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327451 GCTGACCAGGAGTCAGAGGATGACCTGAGCGCCTCGCGCACATCGCTGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 GCGCCAGGCCCCGCACCGCGGCAACACAATGGTGCACGTGTGCTGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327501 GCGCCAGGCCCCGCACCGCGGCAACACAATGGTGCACGTGTGCTGGCACC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2753 GCAACACCAGCGTCTCCATGGTGGACTTCAGCATCGCAGTGGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 327551 GCAACACCAGCGTCTCCATGGTGGACTTCAGCATCGCAGTGGAGGTA...

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2797    AATCAGTTGTCTGGAAACCTGCTGAGGAAATTCAAAAACAGCAACGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 332853 CAGAATCAGTTGTCTGGAAACCTGCTGAGGAAATTCAAAAACAGCAACGG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 GTGGCAGAAGCTGTGGGTGGTGTTCACAAACTTCTGCCTGTTCTTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 332903 GTGGCAGAAGCTGTGGGTGGTGTTCACAAACTTCTGCCTGTTCTTCTACA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2894 AATCACACCAG         GACAATCATCCCCTTGCCAGCCTGCCTCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 332953 AATCACACCAGGTA...CAGGACAATCATCCCCTTGCCAGCCTGCCTCTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2935 CTCGGCTACTCGCTCACCATCCCCTCTGAGTCCGAGAACATCCAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333454 CTCGGCTACTCGCTCACCATCCCCTCTGAGTCCGAGAACATCCAGAAAGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2985 CTACGTGTTCAAGCTGCACTTCAAGTCCCACGTCTACTACTTCAGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333504 CTACGTGTTCAAGCTGCACTTCAAGTCCCACGTCTACTACTTCAGGGCGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3035 AAAGCGAGTACACGTTCGAAAG         GTGGATGGAAGTGATCCGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 333554 AAAGCGAGTACACGTTCGAAAGGTA...CAGGTGGATGGAAGTGATCCGC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3076 AGTGCCACCAGCTCTGCCTCGCGACCCCACGTGTTGAGTCACAAAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 335013 AGTGCCACCAGCTCTGCCTCGCGACCCCACGTGTTGAGTCACAAAGAGTC

   3350     .    :
   3126 TCTTGTGTAT
        ||||||||||
 335063 TCTTGTGTAT

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