seq1 = pF1KB7001.tfa, 3921 bp
seq2 = pF1KB7001/gi568815596f_123925651.tfa (gi568815596f:123925651_125014285), 1088635 bp

>pF1KB7001 3921
>gi568815596f:123925651_125014285 (Chr2)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-187  (296055-296159)   100% ->
188-381  (316550-316743)   100% ->
382-529  (491793-491940)   100% ->
530-733  (508834-509037)   99% ->
734-918  (521103-521287)   100% ->
919-1062  (549089-549232)   100% ->
1063-1327  (578642-578906)   100% ->
1328-1477  (598653-598802)   100% ->
1478-1649  (601635-601806)   100% ->
1650-1756  (637567-637673)   100% ->
1757-1876  (684151-684270)   100% ->
1877-2077  (722108-722308)   100% ->
2078-2234  (821579-821735)   100% ->
2235-2362  (838022-838149)   100% ->
2363-2533  (838327-838497)   100% ->
2534-2752  (847149-847367)   100% ->
2753-2992  (864252-864491)   100% ->
2993-3217  (872446-872670)   100% ->
3218-3348  (939656-939786)   100% ->
3349-3436  (944025-944112)   100% ->
3437-3655  (977232-977450)   100% ->
3656-3727  (985817-985888)   100% ->
3728-3921  (988442-988635)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTCTTTACCACGGCTGACCAGCGTTTTGACTTTGCTGTTCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATTCTTTACCACGGCTGACCAGCGTTTTGACTTTGCTGTTCTCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGTGGCATTTAGGATTAACAGCGACAAACT         ACAACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 CTTGTGGCATTTAGGATTAACAGCGACAAACTGTG...TAGACAACTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGATCCACTAGCATCCCTGCTCTCTCCAATGGCTTTTTCCAGTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296064 ATGATCCACTAGCATCCCTGCTCTCTCCAATGGCTTTTTCCAGTTCCTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCTCACTGGCACTCACAGCCCAGCTCAACTCAACTGGAGAGTTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 296114 GACCTCACTGGCACTCACAGCCCAGCTCAACTCAACTGGAGAGTTGGTA.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188      GAACTGGCGGTTGGTCCCCAGCAGATTCCAATGCTCAACAGTGGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296164 ..CAGGAACTGGCGGTTGGTCCCCAGCAGATTCCAATGCTCAACAGTGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCAGATGGACCTGGGAAACAGAGTAGAGATTACAGCAGTGGCCACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 316595 TCCAGATGGACCTGGGAAACAGAGTAGAGATTACAGCAGTGGCCACGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGAAGATACGGAAGCTCTGACTGGGTGACGAGTTACAGCCTGATGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 316645 GGAAGATACGGAAGCTCTGACTGGGTGACGAGTTACAGCCTGATGTTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGACACAGGACGCAACTGGAAACAGTACAAACAAGAAGACAGCATCTGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 316695 TGACACAGGACGCAACTGGAAACAGTACAAACAAGAAGACAGCATCTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    382         ACCTTTGCAGGAAACATGAATGCTGACAGCGTGGTGCACCAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 316745 TA...CAGACCTTTGCAGGAAACATGAATGCTGACAGCGTGGTGCACCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGCTATTGCACTCAGTGAGAGCCCGATTTGTTCGCTTTGTGCCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 491835 AAGCTATTGCACTCAGTGAGAGCCCGATTTGTTCGCTTTGTGCCCCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATGGAATCCCAGTGGGAAGATTGGCATGAGAGTCGAGGTCTACGGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 491885 ATGGAATCCCAGTGGGAAGATTGGCATGAGAGTCGAGGTCTACGGATGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCTATA         AATCAGACGTTGCTGACTTTGATGGCCGAAGCTCA
        ||||||>>>...>>>||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 491935 CCTATAGTA...CAGAATCAGATGTTGCTGACTTTGATGGCCGAAGCTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTTCTGTACAGGTTCAATCAGAAGTTGATGAGTACTCTCAAAGATGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 508869 CTTCTGTACAGGTTCAATCAGAAGTTGATGAGTACTCTCAAAGATGTGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTCCCTGAAGTTCAAGAGCATGCAAGGAGATGGGGTCCTGTTCCATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 508919 CTCCCTGAAGTTCAAGAGCATGCAAGGAGATGGGGTCCTGTTCCATGGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGGTCAGCGTGGAGACCACATCACCTTGGAACTCCAGAAGGGGAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 508969 AAGGTCAGCGTGGAGACCACATCACCTTGGAACTCCAGAAGGGGAGGCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCCTACACCTCAATTTGG         GTGACAGCAAAGCGCGGCTCAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 509019 GCCCTACACCTCAATTTGGGTA...CAGGTGACAGCAAAGCGCGGCTCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAGCAGCTTGCCCTCTGCCACCCTGGGCAGCCTCCTGGATGACCAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 521125 CAGCAGCTTGCCCTCTGCCACCCTGGGCAGCCTCCTGGATGACCAGCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGCACTCGGTCCTCATTGAGCGGGTGGGCAAGCAGGTGAACTTCACGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 521175 GGCACTCGGTCCTCATTGAGCGGGTGGGCAAGCAGGTGAACTTCACGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACAAGCACACACAGCACTTCCGCACCAAGGGCGAGACGGATGCCTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 521225 GACAAGCACACACAGCACTTCCGCACCAAGGGCGAGACGGATGCCTTAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CATTGACTATGAG         CTTAGTTTTGGAGGAATTCCAGTACCAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 521275 CATTGACTATGAGGTG...AAGCTTAGTTTTGGAGGAATTCCAGTACCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GAAAACCTGGGACCTTTTTAAAGAAAAACTTCCATGGATGCATCGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 549117 GAAAACCTGGGACCTTTTTAAAGAAAAACTTCCATGGATGCATCGAAAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTTTACTACAATGGAGTAAACATAATTGACCTGGCTAAGAGACGAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 549167 CTTTACTACAATGGAGTAAACATAATTGACCTGGCTAAGAGACGAAAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TCAGATCTATACTGTG         GGCAATGTCACTTTTTCCTGCTCCG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 549217 TCAGATCTATACTGTGGTA...CAGGGCAATGTCACTTTTTCCTGCTCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AACCACAGATTGTGCCCATCACATTTGTCAACTCCAGCGGCAGCTATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 578667 AACCACAGATTGTGCCCATCACATTTGTCAACTCCAGCGGCAGCTATTTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTGCTGCCCGGCACCCCCCAAATTGATGGGCTCTCAGTGAGTTTCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 578717 CTGCTGCCCGGCACCCCCCAAATTGATGGGCTCTCAGTGAGTTTCCAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TCGAACATGGAACAAGGATGGTCTGCTTCTGTCCACAGAGCTGTCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 578767 TCGAACATGGAACAAGGATGGTCTGCTTCTGTCCACAGAGCTGTCTGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GCTCGGGAACCCTGCTGCTGAGCCTGGAGGGTGGAATCCTGAGACTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 578817 GCTCGGGAACCCTGCTGCTGAGCCTGGAGGGTGGAATCCTGAGACTCGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ATTCAGAAAATGACAGAACGCGTAGCTGAAATCCTCACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 578867 ATTCAGAAAATGACAGAACGCGTAGCTGAAATCCTCACAGGTA...CAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CAGCAACTTGAATGATGGCCTGTGGCACTCGGTTAGCATCAACGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 598654 CAGCAACTTGAATGATGGCCTGTGGCACTCGGTTAGCATCAACGCCAGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GGAACCGCATCACGCTCACTCTGGATGATGAAGCAGCACCCCCGGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 598704 GGAACCGCATCACGCTCACTCTGGATGATGAAGCAGCACCCCCGGCTCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GACAGCACTTGGGTGCAGATTTATTCTGGAAATAGCTACTATTTTGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 598754 GACAGCACTTGGGTGCAGATTTATTCTGGAAATAGCTACTATTTTGGAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1478         GGTGCCCCGACAATCTCACCGATTCCCAATGTTTAAATCCCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 598804 TA...CAGGGTGCCCCGACAATCTCACCGATTCCCAATGTTTAAATCCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TTAAGGCTTTCCAAGGCTGCATGAGGCTCATCTTTATTGATAACCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 601677 TTAAGGCTTTCCAAGGCTGCATGAGGCTCATCTTTATTGATAACCAGCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 AAGGACCTCATTTCAGTTCAGCAAGGTTCCCTGGGGAATTTTAGTGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 601727 AAGGACCTCATTTCAGTTCAGCAAGGTTCCCTGGGGAATTTTAGTGATTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 ACACATTGATCTGTGTAGCATCAAAGACAG         GTGTTTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 601777 ACACATTGATCTGTGTAGCATCAAAGACAGGTA...TAGGTGTTTGCCAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 ACTACTGTGAACATGGAGGAAGCTGCTCCCAGTCCTGGACTACCTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 637578 ACTACTGTGAACATGGAGGAAGCTGCTCCCAGTCCTGGACTACCTTCTAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 TGTAACTGCAGTGACACAAGTTACACTGGTGCCACCTGCCACAACT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 637628 TGTAACTGCAGTGACACAAGTTACACTGGTGCCACCTGCCACAACTGTG.

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757      CCATCTACGAGCAATCCTGCGAGGTGTACAGGCACCAGGGGAATA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 637678 ..CAGCCATCTACGAGCAATCCTGCGAGGTGTACAGGCACCAGGGGAATA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CAGCCGGCTTCTTCTACATCGACTCAGATGGCAGCGGCCCACTGGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 684196 CAGCCGGCTTCTTCTACATCGACTCAGATGGCAGCGGCCCACTGGGACCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CTCCAGGTGTACTGCAATATCACTG         AGGACAAGATCTGGAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 684246 CTCCAGGTGTACTGCAATATCACTGGTA...CAGAGGACAAGATCTGGAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 ATCAGTGCAGCACAACAATACAGAGCTGACCCGAGTGCGGGGCGCTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 722124 ATCAGTGCAGCACAACAATACAGAGCTGACCCGAGTGCGGGGCGCTAACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CTGAGAAGCCCTATGCCATGGCCTTGGACTACGGGGGCAGCATGGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 722174 CTGAGAAGCCCTATGCCATGGCCTTGGACTACGGGGGCAGCATGGAACAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 CTGGAGGCCGTGATCGACGGCTCTGAGCACTGTGAGCAGGAGGTGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 722224 CTGGAGGCCGTGATCGACGGCTCTGAGCACTGTGAGCAGGAGGTGGCCTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 CCACTGCAGGAGGTCCCGCCTGCTCAACACGCCGG         ATGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 722274 CCACTGCAGGAGGTCCCGCCTGCTCAACACGCCGGGTA...CAGATGGAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 CACCATTTACCTGGTGGATTGGGCGGTCCAATGAAAGGCACCCTTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 821585 CACCATTTACCTGGTGGATTGGGCGGTCCAATGAAAGGCACCCTTACTGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GGAGGTTCCCCTCCTGGGGTCCAGCAGTGTGAGTGTGGCCTAGACGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 821635 GGAGGTTCCCCTCCTGGGGTCCAGCAGTGTGAGTGTGGCCTAGACGAGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CTGCCTGGACATTCAGCACTTTTGCAATTGCGACGCTGACAAGGATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 821685 CTGCCTGGACATTCAGCACTTTTGCAATTGCGACGCTGACAAGGATGAAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 G         GACAAATGATACTGGCTTTCTTTCCTTCAAAGACCACTTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 821735 GGTA...CAGGACAAATGATACTGGCTTTCTTTCCTTCAAAGACCACTTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 CCTGTCACTCAGATAGTTATCACTGATACCGACAGATCAAACTCAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 838062 CCTGTCACTCAGATAGTTATCACTGATACCGACAGATCAAACTCAGAAGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CGCTTGGAGAATTGGTCCCTTGCGTTGCTATGGTGACC         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 838112 CGCTTGGAGAATTGGTCCCTTGCGTTGCTATGGTGACCGTG...CAGGAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 GCTTCTGGAACGCCGTCTCATTTTATACAGAAGCCTCTTACCTCCACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 838330 GCTTCTGGAACGCCGTCTCATTTTATACAGAAGCCTCTTACCTCCACTTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 CCTACCTTCCATGCGGAATTCAGTGCCGATATTTCCTTCTTTTTTAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 838380 CCTACCTTCCATGCGGAATTCAGTGCCGATATTTCCTTCTTTTTTAAAAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 CACAGCATTATCCGGAGTTTTCCTAGAAAATCTTGGCATTAAAGACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 838430 CACAGCATTATCCGGAGTTTTCCTAGAAAATCTTGGCATTAAAGACTTCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 TTCGACTCGAAATAAGCT         CTCCTTCAGAGATCACCTTTGCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 838480 TTCGACTCGAAATAAGCTGTA...CAGCTCCTTCAGAGATCACCTTTGCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 ATCGATGTTGGGAATGGTCCTGTGGAGCTTGTAGTCCAGTCTCCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 847172 ATCGATGTTGGGAATGGTCCTGTGGAGCTTGTAGTCCAGTCTCCTTCTCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 TCTGAATGACAACCAATGGCACTATGTCCGGGCTGAGAGGAACCTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 847222 TCTGAATGACAACCAATGGCACTATGTCCGGGCTGAGAGGAACCTCAAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 AGACCTCCCTGCAGGTGGACAACCTTCCAAGGAGCACCAGGGAGACGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 847272 AGACCTCCCTGCAGGTGGACAACCTTCCAAGGAGCACCAGGGAGACGTCG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 GAGGAGGGCCATTTTCGACTGCAGCTGAACAGCCAGTTGTTTGTAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 847322 GAGGAGGGCCATTTTCGACTGCAGCTGAACAGCCAGTTGTTTGTAGGTA.

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2753      GGGGAACGTCATCCAGACAGAAAGGCTTCCTAGGATGCATTCGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 847372 ..TAGGGGGAACGTCATCCAGACAGAAAGGCTTCCTAGGATGCATTCGCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 CCTTACACTTGAATGGACAGAAAATGGACCTGGAAGAGAGGGCAAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 864297 CCTTACACTTGAATGGACAGAAAATGGACCTGGAAGAGAGGGCAAAGGTC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 ACATCTGGAGTCAGGCCAGGCTGCCCCGGCCACTGCAGCAGCTACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 864347 ACATCTGGAGTCAGGCCAGGCTGCCCCGGCCACTGCAGCAGCTACGGCAG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2898 CATCTGCCACAACGGGGGCAAGTGTGTGGAGAAGCACAATGGCTACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 864397 CATCTGCCACAACGGGGGCAAGTGTGTGGAGAAGCACAATGGCTACCTGT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 GTGATTGCACCAATTCACCTTATGAAGGGCCCTTTTGCAAAAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 864447 GTGATTGCACCAATTCACCTTATGAAGGGCCCTTTTGCAAAAAAGGTA..

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2993     AGGTTTCTGCTGTTTTTGAGGCTGGCACGTCGGTTACTTACATGTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 864497 .CAGAGGTTTCTGCTGTTTTTGAGGCTGGCACGTCGGTTACTTACATGTT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3039 TCAAGAACCCTATCCTGTGACCAAGAATATAAGCCTCTCATCCTCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 872492 TCAAGAACCCTATCCTGTGACCAAGAATATAAGCCTCTCATCCTCAGCTA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3089 TTTACACAGATTCAGCTCCATCCAAGGAAAACATTGCACTTAGCTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 872542 TTTACACAGATTCAGCTCCATCCAAGGAAAACATTGCACTTAGCTTTGTG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3139 ACAACCCAGGCACCCAGTCTTTTGCTCTTTATCAATTCTTCTTCTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 872592 ACAACCCAGGCACCCAGTCTTTTGCTCTTTATCAATTCTTCTTCTCAGGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3189 CTTCGTGGTTGTTCTGCTCTGCAAGAATG         GAAGCTTACAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 872642 CTTCGTGGTTGTTCTGCTCTGCAAGAATGGTG...AAGGAAGCTTACAGG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3230 TTCGCTATCACCTAAACAAGGAAGAAACCCATGTATTCACCATTGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 939668 TTCGCTATCACCTAAACAAGGAAGAAACCCATGTATTCACCATTGATGCA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3280 GATAACTTTGCTAACAGAAGGATGCACCACTTGAAGATTAACCGAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 939718 GATAACTTTGCTAACAGAAGGATGCACCACTTGAAGATTAACCGAGAGGG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3330 AAGAGAGCTTACCATTCAG         ATGGACCAGCAACTTCGACTCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 939768 AAGAGAGCTTACCATTCAGGTA...CAGATGGACCAGCAACTTCGACTCA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3371 GTTATAACTTCTCTCCGGAAGTAGAGTTCAGGGTTATAAGGTCACTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 944047 GTTATAACTTCTCTCCGGAAGTAGAGTTCAGGGTTATAAGGTCACTCACC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3421 TTGGGCAAAGTCACAG         AGAATCTTGGTTTGGATTCTGAAGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 944097 TTGGGCAAAGTCACAGGTA...CAGAGAATCTTGGTTTGGATTCTGAAGT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3462 TGCTAAAGCAAATGCCATGGGTTTTGCTGGATGCATGTCTTCCGTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 977257 TGCTAAAGCAAATGCCATGGGTTTTGCTGGATGCATGTCTTCCGTCCAGT

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3512 ACAACCACATAGCACCACTGAAGGCTGCCCTGCGCCATGCCACTGTCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 977307 ACAACCACATAGCACCACTGAAGGCTGCCCTGCGCCATGCCACTGTCGCG

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3562 CCTGTGACTGTCCATGGGACCTTGACGGAATCCAGCTGTGGCTTCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 977357 CCTGTGACTGTCCATGGGACCTTGACGGAATCCAGCTGTGGCTTCATGGT

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3612 GGACTCAGATGTGAATGCAGTGACCACGGTGCATTCTTCATCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 977407 GGACTCAGATGTGAATGCAGTGACCACGGTGCATTCTTCATCAGGTA...

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3656    ATCCTTTTGGGAAGACAGATGAGCGGGAACCACTCACAAATGCTGTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 985814 CAGATCCTTTTGGGAAGACAGATGAGCGGGAACCACTCACAAATGCTGTT

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3703 CGAAGTGATTCGGCAGTCATCGGAG         GGGTGATAGCAGTGGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 985864 CGAAGTGATTCGGCAGTCATCGGAGGTA...CAGGGGTGATAGCAGTGGT

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3744 GATATTCATCATCTTCTGTATCATCGGCATCATGACCCGGTTCCTCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 988458 GATATTCATCATCTTCTGTATCATCGGCATCATGACCCGGTTCCTCTACC

   4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3794 AGCACAAGCAGTCACATCGTACGAGCCAGATGAAGGAGAAGGAATATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 988508 AGCACAAGCAGTCACATCGTACGAGCCAGATGAAGGAGAAGGAATATCCA

   4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3844 GAAAATTTGGACAGTTCCTTCAGAAATGAAATTGACTTGCAAAACACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 988558 GAAAATTTGGACAGTTCCTTCAGAAATGAAATTGACTTGCAAAACACAGT

   4100     .    :    .    :    .
   3894 GAGCGAGTGTAAACGGGAATATTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 988608 GAGCGAGTGTAAACGGGAATATTTCATC