seq1 = pF1KB6998.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KB6998/gi568815581r_63873344.tfa (gi568815581r:63873344_63996239), 122896 bp

>pF1KB6998 651
>gi568815581r:63873344_63996239 (Chr17)

(complement)

1-171  (99995-100165)   97% ->
172-291  (100390-100509)   100% ->
292-456  (100603-100767)   100% ->
457-651  (101021-101215)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCAGGCTCCCGGACGTCCCTGCTCCTGGCTTTTGCCCTGCTCTG
         |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99995 TTCTCCCCAGGCTCCCGGACGTCCCTGCTCCTGGCTTTTGCCCTGCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCCCTGGCTTCAAGAGGCTGGTGCCGTCCAAACCGTTCCGTTATCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100045 CCTGCCCTGGCTTCAAGAGGCTGGTGCCGTCCAAACCGTTCCCTTATCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCTTTTTGACCACGCTATGCTCCAAGCCCATCGCGCGCACCAGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100095 GGCTTTTTGACCACGCTATGCTCCAAGCCCATCGCGCGCACCAGCTGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGACACCTACCAGGAGTTT         GAAGAAACCTATATCCCAAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100145 ATTGACACCTACCAGGAGTTTGTA...TAGGAAGAAACCTATATCCCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGACCAGAAGTATTCATTCCTGCATGACTCCCAGACCTCCTTCTGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100410 GGACCAGAAGTATTCATTCCTGCATGACTCCCAGACCTCCTTCTGCTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGACTCTATTCCGACACCCTCCAACATGGAGGAAACGCAACAGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100460 CAGACTCTATTCCGACACCCTCCAACATGGAGGAAACGCAACAGAAATCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292          AATCTAGAGCTGCTCCGCATCTCCCTGCTGCTCATCGAGTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100510 GTG...CAGAATCTAGAGCTGCTCCGCATCTCCCTGCTGCTCATCGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTGGCTGGAGCCCGTGCGGTTCCTCAGGAGTATGTTCGCCAACAACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100644 GTGGCTGGAGCCCGTGCGGTTCCTCAGGAGTATGTTCGCCAACAACCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTATGACACCTCGGACAGCGATGACTATCACCTCCTAAAGGACCTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100694 TGTATGACACCTCGGACAGCGATGACTATCACCTCCTAAAGGACCTAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGGCATCCAAACGCTGATGGGG         AGGCTGGAAGACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100744 GAAGGCATCCAAACGCTGATGGGGGTG...CAGAGGCTGGAAGACGGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCGCCGGACTGGGCAGATCCTCAAGCAGACCTACAGCAAGTTTGACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101038 CCGCCGGACTGGGCAGATCCTCAAGCAGACCTACAGCAAGTTTGACACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACTCGCACAACCATGACGCACTGCTCAAGAACTACGGGCTGCTCTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101088 ACTCGCACAACCATGACGCACTGCTCAAGAACTACGGGCTGCTCTACTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTCAGGAAGGACATGGACAAGGTCGAGACATTCCTGCGCATGGTGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101138 TTCAGGAAGGACATGGACAAGGTCGAGACATTCCTGCGCATGGTGCAGTG

    650     .    :    .    :    .
    624 CCGCTCTGTGGAGGGCAGCTGTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 101188 CCGCTCTGTGGAGGGCAGCTGTGGCTTC