seq1 = pF1KB6998.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KB6998/gi568815581r_63772129.tfa (gi568815581r:63772129_63895024), 122896 bp

>pF1KB6998 651
>gi568815581r:63772129_63895024 (Chr17)

(complement)

1-171  (21676-21846)   97% ->
172-291  (22071-22190)   100% ->
292-456  (22284-22448)   100% ->
457-651  (22702-22896)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCAGGCTCCCGGACGTCCCTGCTCCTGGCTTTTGCCCTGCTCTG
         |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21676 TTCTCCCCAGGCTCCCGGACGTCCCTGCTCCTGGCTTTTGCCCTGCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCCCTGGCTTCAAGAGGCTGGTGCCGTCCAAACCGTTCCGTTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21726 CCTGCCCTGGCTTCAAGAGGCTGGTGCCGTCCAAACCGTTCCGTTATCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCTTTTTGACCACGCTATGCTCCAAGCCCATCGCGCGCACCAGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21776 GGCTTTTTGACCACGCTATGCTCCAAGCCCATCGCGCGCACCAGCTGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGACACCTACCAGGAGTTT         GAAGAAACCTATATCCCAAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  21826 ATTGACACCTACCAGGAGTTTGTA...TAGGAAGAAACCTATATCCCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGACCAGAAGTATTCATTCCTGCATGACTCCCAGACCTCCTTCTGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22091 GGACCAGAAGTATTCATTCCTGCATGACTCCCAGACCTCCTTCTGCTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGACTCTATTCCGACACCCTCCAACATGGAGGAAACGCAACAGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22141 CAGACTCTATTCCGACACCCTCCAACATGGAGGAAACGCAACAGAAATCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292          AATCTAGAGCTGCTCCGCATCTCCCTGCTGCTCATCGAGTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22191 GTG...CAGAATCTAGAGCTGCTCCGCATCTCCCTGCTGCTCATCGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTGGCTGGAGCCCGTGCGGTTCCTCAGGAGTATGTTCGCCAACAACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22325 GTGGCTGGAGCCCGTGCGGTTCCTCAGGAGTATGTTCGCCAACAACCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTATGACACCTCGGACAGCGATGACTATCACCTCCTAAAGGACCTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22375 TGTATGACACCTCGGACAGCGATGACTATCACCTCCTAAAGGACCTAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGGCATCCAAACGCTGATGGGG         AGGCTGGAAGACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  22425 GAAGGCATCCAAACGCTGATGGGGGTG...CAGAGGCTGGAAGACGGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCGCCGGACTGGGCAGATCCTCAAGCAGACCTACAGCAAGTTTGACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22719 CCGCCGGACTGGGCAGATCCTCAAGCAGACCTACAGCAAGTTTGACACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACTCGCACAACCATGACGCACTGCTCAAGAACTACGGGCTGCTCTACTGC
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22769 ACTCACACAACCATGACGCACTGCTCAAGAACTACGGGCTGCTCTACTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTCAGGAAGGACATGGACAAGGTCGAGACATTCCTGCGCATGGTGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22819 TTCAGGAAGGACATGGACAAGGTCGAGACATTCCTGCGCATGGTGCAGTG

    650     .    :    .    :    .
    624 CCGCTCTGTGGAGGGCAGCTGTGGCTTC
        ||||||||| ||||| ||||||||||||
  22869 CCGCTCTGTAGAGGGTAGCTGTGGCTTC