seq1 = pF1KB6996.tfa, 762 bp
seq2 = pF1KB6996/gi568815596r_69296249.tfa (gi568815596r:69296249_69537422), 241174 bp

>pF1KB6996 762
>gi568815596r:69296249_69537422 (Chr2)

(complement)

1-62  (100001-100062)   100% ->
63-166  (105418-105521)   100% ->
167-302  (113706-113841)   100% ->
303-369  (117819-117885)   100% ->
370-484  (122124-122238)   100% ->
485-545  (131341-131401)   100% ->
546-720  (136885-137059)   100% ->
721-762  (141133-141174)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGACGGCCAGGCGGGGCTGGGGAGCTGCGGCTGTTGCCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGACGGCCAGGCGGGGCTGGGGAGCTGCGGCTGTTGCCGCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCGCAGGCG         GTTCTGTCATATGTTGAAGAATCCATACA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCGCAGGCGGTA...CAGGTTCTGTCATATGTTGAAGAATCCATACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATTAAGAAACAGCCTCTGCATCAGTTTGTACAAAGACCACTTTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105447 CCATTAAGAAACAGCCTCTGCATCAGTTTGTACAAAGACCACTTTTCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTACCTGCAGCCTTTTATCACCCAG         TGAGATACATGTTTAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105497 CTACCTGCAGCCTTTTATCACCCAGGTA...TAGTGAGATACATGTTTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCAAACACAAGATACCCCAAATCCAAACAGCTTAAAGTTTATACCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113722 TCAAACACAAGATACCCCAAATCCAAACAGCTTAAAGTTTATACCAGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACCAGTTCTTGAGACAAGGACCATGGATTTTCCCACCCCAGCTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113772 AACCAGTTCTTGAGACAAGGACCATGGATTTTCCCACCCCAGCTGCAGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTCGCTCCCCTCTGGCTAG         GCAGTTATTTAGGATTGAAGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 113822 TTTCGCTCCCCTCTGGCTAGGTA...CAGGCAGTTATTTAGGATTGAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTAAAAAGTGTCTTCTTTGGACCAGATTTCATCACTGTCACAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 117840 AGTAAAAAGTGTCTTCTTTGGACCAGATTTCATCACTGTCACAAAGGTA.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    370      GAAAATGAAGAATTAGACTGGAATTTACTGAAACCAGATATTTAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117890 ..TAGGAAAATGAAGAATTAGACTGGAATTTACTGAAACCAGATATTTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCAACAATCATGGACTTCTTTGCATCTGGCTTACCCCTGGTTACTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122169 GCAACAATCATGGACTTCTTTGCATCTGGCTTACCCCTGGTTACTGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AACACCTTCAGGAGAAGCAG         GATCTGAAGAAGATGATGAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 122219 AACACCTTCAGGAGAAGCAGGTA...TAGGATCTGAAGAAGATGATGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTGTGGCAATGATTAAGGAATTGTTAGATACTAGAATACG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 131362 TTGTGGCAATGATTAAGGAATTGTTAGATACTAGAATACGGTA...CAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CCAACTGTGCAGGAAGATGGAGGGGATGTAATCTACAAAGGCTTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136886 CCAACTGTGCAGGAAGATGGAGGGGATGTAATCTACAAAGGCTTTGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGGCATTGTACAGCTGAAACTCCAGGGTTCTTGTACCAGCTGCCCTAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136936 TGGCATTGTACAGCTGAAACTCCAGGGTTCTTGTACCAGCTGCCCTAGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAATCATTACTCTGAAAAATGGAATTCAGAACATGCTGCAGTTTTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136986 CAATCATTACTCTGAAAAATGGAATTCAGAACATGCTGCAGTTTTATATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCGGAGGTAGAAGGCGTAGAACAG         GTTATGGATGATGAATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 137036 CCGGAGGTAGAAGGCGTAGAACAGGTA...TAGGTTATGGATGATGAATC

    800     .    :    .    :    .
    738 AGATGAAAAAGAAGCAAACTCACCT
        |||||||||||||||||||||||||
 141150 AGATGAAAAAGAAGCAAACTCACCT