seq1 = pF1KB6989.tfa, 657 bp
seq2 = pF1KB6989/gi568815592f_32754230.tfa (gi568815592f:32754230_32959529), 205300 bp

>pF1KB6989 657
>gi568815592f:32754230_32959529 (Chr6)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-128  (101909-101976)   100% ->
129-260  (103034-103165)   100% ->
261-390  (103776-103905)   100% ->
391-532  (104135-104276)   100% ->
533-657  (105176-105300)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCGGGCGGGAGCACCAACCGGGGACTTACCCCGGGCGGGAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCGGGCGGGAGCACCAACCGGGGACTTACCCCGGGCGGGAGAAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACACCGGG         ACCACCATCATGGCAGTGGAGTTTGACGGGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACACCGGGGTA...CAGACCACCATCATGGCAGTGGAGTTTGACGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCGTTGTGATGGGTTCTGATTCCCGAGTGTCTGCAGG         CGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101940 GCGTTGTGATGGGTTCTGATTCCCGAGTGTCTGCAGGGTG...CAGCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCGGTGGTGAACCGAGTGTTTGACAAGCTGTCCCCGCTGCACGAGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103038 GCGGTGGTGAACCGAGTGTTTGACAAGCTGTCCCCGCTGCACGAGCGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTACTGTGCACTCTCTGGTTCAGCTGCTGATGCCCAAGCCGTGGCCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103088 CTACTGTGCACTCTCTGGTTCAGCTGCTGATGCCCAAGCCGTGGCCGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGCCGCCTACCAGCTGGAGCTCCATGG         GATAGAACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103138 TGGCCGCCTACCAGCTGGAGCTCCATGGGTA...CAGGATAGAACTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAACCTCCACTTGTTTTGGCTGCTGCAAATGTGGTGAGAAATATCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103789 GAACCTCCACTTGTTTTGGCTGCTGCAAATGTGGTGAGAAATATCAGCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TAAATATCGAGAGGACTTGTCTGCACATCTCATGGTAGCTGGCTGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103839 TAAATATCGAGAGGACTTGTCTGCACATCTCATGGTAGCTGGCTGGGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AACGTGAAGGAGGTCAG         GTATATGGAACCCTGGGAGGAATG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103889 AACGTGAAGGAGGTCAGGTG...CAGGTATATGGAACCCTGGGAGGAATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGACTCGACAGCCTTTTGCCATTGGTGGCTCCGGCAGCACCTTTATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104159 CTGACTCGACAGCCTTTTGCCATTGGTGGCTCCGGCAGCACCTTTATCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGTTATGTGGATGCAGCATATAAGCCAGGCATGTCTCCCGAGGAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104209 TGGTTATGTGGATGCAGCATATAAGCCAGGCATGTCTCCCGAGGAGTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGCGCTTCACCACAGACG         CTATTGCTCTGGCCATGAGCCGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104259 GGCGCTTCACCACAGACGGTA...CAGCTATTGCTCTGGCCATGAGCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GATGGCTCAAGCGGGGGTGTCATCTACCTGGTCACTATTACAGCTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105199 GATGGCTCAAGCGGGGGTGTCATCTACCTGGTCACTATTACAGCTGCCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTGGACCATCGAGTCATCTTGGGCAATGAACTGCCAAAATTCTATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105249 TGTGGACCATCGAGTCATCTTGGGCAATGAACTGCCAAAATTCTATGATG

    700 
    656 AG
        ||
 105299 AG