seq1 = pF1KB6988.tfa, 744 bp
seq2 = pF1KB6988/gi568815588r_52668140.tfa (gi568815588r:52668140_52871635), 203496 bp

>pF1KB6988 744
>gi568815588r:52668140_52871635 (Chr10)

(complement)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-304  (100850-100966)   100% ->
305-373  (102321-102389)   100% ->
374-744  (103126-103496)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCTGTTTCCATCACTCCCTCTCCTTCTCCTGAGTATGGTGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCTGTTTCCATCACTCCCTCTCCTTCTCCTGAGTATGGTGGCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCTTACTCAGAAACTGTGACCTGTGAGGATGCCCAAAAGACCTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCTTACTCAGAAACTGTGACCTGTGAGGATGCCCAAAAGACCTGCCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGTGATTGCCTGTAGCTCTCCAGGCATCAACGGCTTCCCAGGCAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGTGATTGCCTGTAGCTCTCCAGGCATCAACGGCTTCCCAGGCAAAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCGTGATGGCACCAAGGGAGAAAAGGGGGAACCAG         GCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 GGGCGTGATGGCACCAAGGGAGAAAAGGGGGAACCAGGTA...CAGGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGGCTCAGAGGCTTACAGGGCCCCCCTGGAAAGTTGGGGCCTCCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100854 AGGGCTCAGAGGCTTACAGGGCCCCCCTGGAAAGTTGGGGCCTCCAGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATCCAGGGCCTTCTGGGTCACCAGGACCAAAGGGCCAAAAAGGAGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100904 ATCCAGGGCCTTCTGGGTCACCAGGACCAAAGGGCCAAAAAGGAGACCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGAAAAAGTCCGG         ATGGTGATAGTAGCCTGGCTGCCTCAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100954 GGAAAAAGTCCGGGTA...TAGATGGTGATAGTAGCCTGGCTGCCTCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAGAAAAGCTCTGCAAACAGAAATGGCACGTATCAAAAAGT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102349 AAGAAAAGCTCTGCAAACAGAAATGGCACGTATCAAAAAGTGTA...TAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGCTGACCTTCTCTCTGGGCAAACAAGTTGGGAACAAGTTCTTCCTGACC
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103126 GGCTCACCTTCTCTCTGGGCAAACAAGTTGGGAACAAGTTCTTCCTGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATGGTGAAATAATGACCTTTGAAAAAGTGAAGGCCTTGTGTGTCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103176 AATGGTGAAATAATGACCTTTGAAAAAGTGAAGGCCTTGTGTGTCAAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCAGGCCTCTGTGGCCACCCCCAGGAATGCTGCAGAGAATGGAGCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103226 CCAGGCCTCTGTGGCCACCCCCAGGAATGCTGCAGAGAATGGAGCCATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAATCTCATCAAGGAGGAAGCCTTCCTGGGCATCACTGATGAGAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103276 AGAATCTCATCAAGGAGGAAGCCTTCCTGGGCATCACTGATGAGAAGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAGGGCAGTTTGTGGATCTGACAGGAAATAGACTGACCTACACAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103326 GAAGGGCAGTTTGTGGATCTGACAGGAAATAGACTGACCTACACAAACTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAACGAGGGTGAACCCAACAATGCTGGTTCTGATGAAGATTGTGTATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103376 GAACGAGGGTGAACCCAACAATGCTGGTTCTGATGAAGATTGTGTATTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TACTGAAAAATGGCCAGTGGAATGACGTCCCCTGCTCCACCTCCCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103426 TACTGAAAAATGGCCAGTGGAATGACGTCCCCTGCTCCACCTCCCATCTG

    750     .    :    .    :
    724 GCCGTCTGTGAGTTCCCTATC
        |||||||||||||||||||||
 103476 GCCGTCTGTGAGTTCCCTATC