seq1 = pF1KB6987.tfa, 657 bp
seq2 = pF1KB6987/gi568815590f_30285093.tfa (gi568815590f:30285093_30647420), 362328 bp

>pF1KB6987 657
>gi568815590f:30285093_30647420 (Chr8)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-144  (189687-189764)   100% ->
145-183  (192707-192745)   100% ->
184-246  (194223-194285)   100% ->
247-397  (219194-219344)   100% ->
398-528  (259402-259532)   100% ->
529-657  (262200-262328)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACAACGGCGGCAAAGCCGAGAAGGAGAACACCCCGAGCGAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACAACGGCGGCAAAGCCGAGAAGGAGAACACCCCGAGCGAGGCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTCAGGAGGAGGAG         GTCCGGACCCTATTTGTCAGTGGCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTCAGGAGGAGGAGGTA...CAGGTCCGGACCCTATTTGTCAGTGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTCCTCTGGATATCAAACCTCGGGAGCTCTATCTGCTTTTCAGACCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189712 TTCCTCTGGATATCAAACCTCGGGAGCTCTATCTGCTTTTCAGACCATTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAG         GGCTATGAGGGTTCTCTTATAAAGCTCACATCTAAACA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189762 AAGGTA...CAGGGCTATGAGGGTTCTCTTATAAAGCTCACATCTAAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 G         CCTGTAGGTTTTGTCAGTTTTGACAGTCGCTCAGAAGCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192745 GGTA...CAGCCTGTAGGTTTTGTCAGTTTTGACAGTCGCTCAGAAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGGCTGCAAAGAATGCTTTGAAT         GGCATCCGCTTCGATCCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 194263 AGGCTGCAAAGAATGCTTTGAATGTA...AAGGGCATCCGCTTCGATCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GAAATTCCGCAAACACTACGACTAGAGTTTGCTAAGGCAAACACGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219212 GAAATTCCGCAAACACTACGACTAGAGTTTGCTAAGGCAAACACGAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGCCAAGAACAAACTCGTAGGGACTCCAAACCCCAGTACTCCTCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219262 GGCCAAGAACAAACTCGTAGGGACTCCAAACCCCAGTACTCCTCTGCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACACTGTACCTCAGTTCATTGCCAGAGAGCCAT         ATGAGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 219312 ACACTGTACCTCAGTTCATTGCCAGAGAGCCATGTA...CAGATGAGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 ACAGTGCCTGCACTTTACCCCAGTAGCCCTGAAGTGTGGGCCCCGTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259410 ACAGTGCCTGCACTTTACCCCAGTAGCCCTGAAGTGTGGGCCCCGTACCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TCTGTACCCAGCGGAGTTAGCGCCTGCTCTACCTCCTCCTGCTTTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259460 TCTGTACCCAGCGGAGTTAGCGCCTGCTCTACCTCCTCCTGCTTTCACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATCCCGCTTCACTGCATGCCCAG         TGTTTCTCTCCTGAGGCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 259510 ATCCCGCTTCACTGCATGCCCAGGTA...TAGTGTTTCTCTCCTGAGGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAGCCCAACACACCTGTCTTTTGTCCACTTCTCCAGCAAATTAGATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 262218 AAGCCCAACACACCTGTCTTTTGTCCACTTCTCCAGCAAATTAGATTTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTCTGGGAATGTGTTTGTAACATACCAACCTACTGCAGACCAGCAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 262268 CTCTGGGAATGTGTTTGTAACATACCAACCTACTGCAGACCAGCAGAGGG

    700     .    :
    647 AGCTCCCATGT
        |||||||||||
 262318 AGCTCCCATGT