seq1 = pF1KB6985.tfa, 657 bp
seq2 = pF1KB6985/gi568815589f_33165079.tfa (gi568815589f:33165079_33380856), 215778 bp

>pF1KB6985 657
>gi568815589f:33165079_33380856 (Chr9)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-174  (100932-101036)   100% ->
175-221  (102775-102821)   100% ->
222-315  (105545-105638)   100% ->
316-387  (106074-106145)   100% ->
388-496  (111378-111486)   100% ->
497-609  (113035-113147)   100% ->
610-657  (115731-115778)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCGACTCTTCGGGAAAGCGAAACCCAAGGCTCCGCCGCCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCGACTCTTCGGGAAAGCGAAACCCAAGGCTCCGCCGCCCAGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACTGACTGCATTGGCACG         GTGGACAGTAGAGCAGAATCCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 GACTGACTGCATTGGCACGGTG...AAGGTGGACAGTAGAGCAGAATCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGACAAGAAGATTTCTCGATTGGATGCTGAGCTAGTGAAGTATAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100954 TTGACAAGAAGATTTCTCGATTGGATGCTGAGCTAGTGAAGTATAAGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGATCAAGAAGATGAGAGAGGGTCCTGCAAAG         AATATGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101004 CAGATCAAGAAGATGAGAGAGGGTCCTGCAAAGGTA...CAGAATATGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAGCAGAAAGCCTTGCGAGTTTTAAAGCAAAAGAGGAT         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102783 CAAGCAGAAAGCCTTGCGAGTTTTAAAGCAAAAGAGGATGTA...AAGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATGAGCAGCAGCGGGACAATCTTGCCCAACAGTCATTCAACATGGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105547 ATGAGCAGCAGCGGGACAATCTTGCCCAACAGTCATTCAACATGGAACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCAATTATACCATCCAGTCTTTGAAGGACACCAAGACCACG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105597 GCCAATTATACCATCCAGTCTTTGAAGGACACCAAGACCACGGTA...TA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    316  GTTGATGCTATGAAACTGGGAGTAAAGGAAATGAAGAAGGCATACAAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106073 GGTTGATGCTATGAAACTGGGAGTAAAGGAAATGAAGAAGGCATACAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGTGAAGATCGACCAGATTGAG         GATTTACAAGACCAGCTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106123 AAGTGAAGATCGACCAGATTGAGGTG...TAGGATTTACAAGACCAGCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GAGGATATGATGGAAGATGCAAATGAAATCCAAGAAGCACTGAGTCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111396 GAGGATATGATGGAAGATGCAAATGAAATCCAAGAAGCACTGAGTCGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TTATGGCACCCCAGAACTGGATGAAGATGATTTAGAAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111446 TTATGGCACCCCAGAACTGGATGAAGATGATTTAGAAGCAGGTA...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AGTTGGATGCACTAGGTGATGAGCTTCTGGCTGATGAAGACAGTTCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113035 AGTTGGATGCACTAGGTGATGAGCTTCTGGCTGATGAAGACAGTTCTTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TTGGATGAGGCAGCATCTGCACCTGCAATTCCAGAAGGTGTTCCCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113085 TTGGATGAGGCAGCATCTGCACCTGCAATTCCAGAAGGTGTTCCCACTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TACAAAAAACAAG         GATGGAGTTCTGGTGGATGAATTTGGAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 113135 TACAAAAAACAAGGTG...CAGGATGGAGTTCTGGTGGATGAATTTGGAT

    700     .    :    .    :
    638 TGCCACAGATCCCTGCTTCA
        ||||||||||||||||||||
 115759 TGCCACAGATCCCTGCTTCA