seq1 = pF1KB6979.tfa, 654 bp
seq2 = pF1KB6979/gi568815579f_48855547.tfa (gi568815579f:48855547_49061094), 205548 bp

>pF1KB6979 654
>gi568815579f:48855547_49061094 (Chr19)

1-34  (99383-99416)   100% ->
35-86  (100002-100053)   100% ->
87-233  (100141-100287)   100% ->
234-369  (100652-100787)   100% ->
370-654  (105264-105548)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGGGTCCGGGGAGCAGCCCAGAGGCGGGG         GGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  99383 ATGGACGGGTCCGGGGAGCAGCCCAGAGGCGGGGGTG...TAGGGCCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CAGCTCTGAGCAGATCATGAAGACAGGGGCCCTTTTGCTTCAGGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100009 CAGCTCTGAGCAGATCATGAAGACAGGGGCCCTTTTGCTTCAGGGGTG..

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     87     TTTCATCCAGGATCGAGCAGGGCGAATGGGGGGGGAGGCACCCGAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 .TAGTTTCATCCAGGATCGAGCAGGGCGAATGGGGGGGGAGGCACCCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTGGCCCTGGACCCGGTGCCTCAGGATGCGTCCACCAAGAAGCTGAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100187 CTGGCCCTGGACCCGGTGCCTCAGGATGCGTCCACCAAGAAGCTGAGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTGTCTCAAGCGCATCGGGGACGAACTGGACAGTAACATGGAGCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100237 GTGTCTCAAGCGCATCGGGGACGAACTGGACAGTAACATGGAGCTGCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 G         GATGATTGCCGCCGTGGACACAGACTCCCCCCGAGAGGTC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100287 GGTG...CAGGATGATTGCCGCCGTGGACACAGACTCCCCCCGAGAGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTTTCCGAGTGGCAGCTGACATGTTTTCTGACGGCAACTTCAACTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100692 TTTTTCCGAGTGGCAGCTGACATGTTTTCTGACGGCAACTTCAACTGGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCGGGTTGTCGCCCTTTTCTACTTTGCCAGCAAACTGGTGCTCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100742 CCGGGTTGTCGCCCTTTTCTACTTTGCCAGCAAACTGGTGCTCAAGGTG.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    370      GCCCTGTGCACCAAGGTGCCGGAACTGATCAGAACCATCATGGGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100792 ..CAGGCCCTGTGCACCAAGGTGCCGGAACTGATCAGAACCATCATGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGGACATTGGACTTCCTCCGGGAGCGGCTGTTGGGCTGGATCCAAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105309 TGGACATTGGACTTCCTCCGGGAGCGGCTGTTGGGCTGGATCCAAGACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGGTGGTTGGGTGAGACTCCTCAAGCCTCCTCACCCCCACCACCGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105359 GGGTGGTTGGGTGAGACTCCTCAAGCCTCCTCACCCCCACCACCGCGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCACCACCGCCCCTGCCCCACCGTCCCTGCCCCCCGCCACTCCTCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105409 TCACCACCGCCCCTGCCCCACCGTCCCTGCCCCCCGCCACTCCTCTGGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCCTGGGCCTTCTGGAGCAGGTCACAGTGGTGCCCTCTCCCCATCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105459 CCCTGGGCCTTCTGGAGCAGGTCACAGTGGTGCCCTCTCCCCATCTTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ATCATCAGATGTGGTCTATAATGCGTTTTCCTTACGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105509 ATCATCAGATGTGGTCTATAATGCGTTTTCCTTACGTGTC