seq1 = pF1KB6971.tfa, 648 bp
seq2 = pF1KB6971/gi568815583r_64056026.tfa (gi568815583r:64056026_64262986), 206961 bp

>pF1KB6971 648
>gi568815583r:64056026_64262986 (Chr15)

(complement)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-249  (100833-100946)   100% ->
250-343  (102790-102883)   100% ->
344-528  (106078-106262)   100% ->
529-648  (106842-106961)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCGCCTCTCCGAACGCAACATGAAGGTGCTCCTTGCCGCCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCGCCTCTCCGAACGCAACATGAAGGTGCTCCTTGCCGCCGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCGCGGGGTCCGTCTTCTTCCTGCTGCTGCCGGGACCTTCTGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCGCGGGGTCCGTCTTCTTCCTGCTGCTGCCGGGACCTTCTGCGGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGAGAAGAAGAAGGGGCCCAAAGTCACCGTCAAG         GTGTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 ATGAGAAGAAGAAGGGGCCCAAAGTCACCGTCAAGGTC...CAGGTGTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGACCTACGAATTGGAGATGAAGATGTAGGCCGGGTGATCTTTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100839 TTTGACCTACGAATTGGAGATGAAGATGTAGGCCGGGTGATCTTTGGTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCGGAAAGACTGTTCCAAAAACAGTGGATAATTTTGTGGCCTTAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100889 CTTCGGAAAGACTGTTCCAAAAACAGTGGATAATTTTGTGGCCTTAGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGGAGAG         AAAGGATTTGGCTACAAAAACAGCAAATTCCAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100939 CAGGAGAGGTA...TAGAAAGGATTTGGCTACAAAAACAGCAAATTCCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGTGTAATCAAGGACTTCATGATCCAGGGCGGAGACTTCACCAGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102823 CGTGTAATCAAGGACTTCATGATCCAGGGCGGAGACTTCACCAGGGGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGCACAGGAG         GAAAGAGCATCTACGGTGAGCGCTTCCCCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102873 TGGCACAGGAGGTA...CAGGAAAGAGCATCTACGGTGAGCGCTTCCCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGAGAACTTCAAACTGAAGCACTACGGGCCTGGCTGGGTGAGCATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106108 ATGAGAACTTCAAACTGAAGCACTACGGGCCTGGCTGGGTGAGCATGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACGCAGGCAAAGACACCAACGGCTCCCAGTTCTTCATCACGACAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106158 AACGCAGGCAAAGACACCAACGGCTCCCAGTTCTTCATCACGACAGTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GACAGCCTGGCTAGATGGCAAGCATGTGGTGTTTGGCAAAGTTCTAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106208 GACAGCCTGGCTAGATGGCAAGCATGTGGTGTTTGGCAAAGTTCTAGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCATG         GAGGTGGTGCGGAAGGTGGAGAGCACCAAGACAGAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106258 GCATGGTG...CAGGAGGTGGTGCGGAAGGTGGAGAGCACCAAGACAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGCCGGGATAAACCCCTGAAGGATGTGATCATCGCAGACTGCGGCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106878 AGCCGGGATAAACCCCTGAAGGATGTGATCATCGCAGACTGCGGCAAGAT

    650     .    :    .    :    .    :
    615 CGAGGTGGAGAAGCCCTTTGCCATCGCCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106928 CGAGGTGGAGAAGCCCTTTGCCATCGCCAAGGAG