seq1 = pF1KB6969.tfa, 648 bp
seq2 = pF1KB6969/gi568815581r_42025786.tfa (gi568815581r:42025786_42230502), 204717 bp

>pF1KB6969 648
>gi568815581r:42025786_42230502 (Chr17)

(complement)

1-166  (100001-100166)   100% ->
167-318  (101703-101854)   100% ->
319-441  (102120-102242)   100% ->
442-535  (103655-103748)   100% ->
536-648  (104605-104717)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGTCGGGGAGGCGCAGCACGACCCAATGGACCAGCTGCTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGTCGGGGAGGCGCAGCACGACCCAATGGACCAGCTGCTGGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGATCTGTCAATTTAAGCTGGTTCTGCTGGGGGAGTCTGCGGTAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGATCTGTCAATTTAAGCTGGTTCTGCTGGGGGAGTCTGCGGTAGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AATCCAGCCTCGTCCTCCGCTTTGTCAAGGGACAGTTTCACGAGTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AATCCAGCCTCGTCCTCCGCTTTGTCAAGGGACAGTTTCACGAGTACCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGAGCACAATTGGAG         CGGCCTTCCTCACACAGACTGTCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGAGCACAATTGGAGGTG...CAGCGGCCTTCCTCACACAGACTGTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGGATGACACAACAGTCAAGTTTGAGATCTGGGACACAGCTGGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101728 CCTGGATGACACAACAGTCAAGTTTGAGATCTGGGACACAGCTGGACAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCGGTATCACAGCCTGGCCCCCATGTACTATCGGGGGGCCCAGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101778 AGCGGTATCACAGCCTGGCCCCCATGTACTATCGGGGGGCCCAGGCTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATCGTGGTCTATGACATCACCAACACA         GATACATTTGCACG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101828 ATCGTGGTCTATGACATCACCAACACAGTA...CAGGATACATTTGCACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCCAAGAACTGGGTGAAGGAGCTACAGAGGCAGGCCAGCCCCAACATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102134 GGCCAAGAACTGGGTGAAGGAGCTACAGAGGCAGGCCAGCCCCAACATCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCATTGCACTCGCGGGTAACAAGGCAGACCTGGCCAGCAAGAGAGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102184 TCATTGCACTCGCGGGTAACAAGGCAGACCTGGCCAGCAAGAGAGCCGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAATTCCAG         GAAGCACAAGCCTATGCAGACGACAACAGTTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102234 GAATTCCAGGTG...CAGGAAGCACAAGCCTATGCAGACGACAACAGTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTGTTCATGGAGACATCAGCAAAGACTGCAATGAACGTGAACGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103687 GCTGTTCATGGAGACATCAGCAAAGACTGCAATGAACGTGAACGAAATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCATGGCAATAG         CTAAGAAGCTTCCCAAGAACGAGCCCCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103737 TCATGGCAATAGGTC...CAGCTAAGAAGCTTCCCAAGAACGAGCCCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AATGCAACTGGTGCTCCAGGCCGAAACCGAGGTGTGGACCTCCAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104634 AATGCAACTGGTGCTCCAGGCCGAAACCGAGGTGTGGACCTCCAGGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :
    615 CAACCCAGCCAGCCGGAGCCAGTGCTGCAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104684 CAACCCAGCCAGCCGGAGCCAGTGCTGCAGCAAC