seq1 = pF1KB6966.tfa, 723 bp
seq2 = pF1KB6966/gi568815592r_31630845.tfa (gi568815592r:31630845_31836300), 205456 bp

>pF1KB6966 723
>gi568815592r:31630845_31836300 (Chr6)

(complement)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-149  (102038-102147)   100% ->
150-275  (102340-102465)   100% ->
276-382  (102629-102735)   100% ->
383-564  (103903-104084)   100% ->
565-723  (105298-105456)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAAGAACAACCGCAGGTCGAATTGTTCGTGAAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGGCTGAAGAACAACCGCAGGTCGAATTGTTCGTGAAGGTA...CAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGGCAGTGATGGGGCCAAGATTGGGAACTGCCCATTCTCCCAGAGACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102040 TGGCAGTGATGGGGCCAAGATTGGGAACTGCCCATTCTCCCAGAGACTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCATGGTACTGTGGCTCAAGGGAGTCACCTTCAATGTTACCACCGTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102090 TCATGGTACTGTGGCTCAAGGGAGTCACCTTCAATGTTACCACCGTTGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCAAAAG         GCGGACCGAGACAGTGCAGAAGCTGTGCCCAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102140 ACCAAAAGGTA...CAGGCGGACCGAGACAGTGCAGAAGCTGTGCCCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGGGCAGCTCCCATTCCTGCTGTATGGCACTGAAGTGCACACAGACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102373 GGGGCAGCTCCCATTCCTGCTGTATGGCACTGAAGTGCACACAGACACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAAGATTGAGGAATTTCTGGAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102423 ACAAGATTGAGGAATTTCTGGAGGCAGTGCTGTGCCCTCCCAGGTA...C

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    276   GTACCCCAAGCTGGCAGCTCTGAACCCTGAGTCCAACACAGCTGGGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102627 AGGTACCCCAAGCTGGCAGCTCTGAACCCTGAGTCCAACACAGCTGGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGACATATTTGCCAAATTTTCTGCCTACATCAAGAATTCAAACCCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102677 GGACATATTTGCCAAATTTTCTGCCTACATCAAGAATTCAAACCCAGCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCAATGACA         ATCTGGAGAAGGGACTCCTGAAAGCCCTGAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102727 TCAATGACAGTG...CAGATCTGGAGAAGGGACTCCTGAAAGCCCTGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTTTTAGACAATTACTTAACATCCCCCCTCCCAGAAGAAGTGGATGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103935 GTTTTAGACAATTACTTAACATCCCCCCTCCCAGAAGAAGTGGATGAAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAGTGCTGAAGATGAAGGTGTCTCTCAGAGGAAGTTTTTGGATGGCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103985 CAGTGCTGAAGATGAAGGTGTCTCTCAGAGGAAGTTTTTGGATGGCAACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGCTCACCCTGGCTGACTGCAACCTGTTGCCAAAGTTACACATAGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104035 AGCTCACCCTGGCTGACTGCAACCTGTTGCCAAAGTTACACATAGTACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565          GTGGTGTGTAAGAAGTACCGGGGATTCACCATCCCCGAGGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104085 GTG...CAGGTGGTGTGTAAGAAGTACCGGGGATTCACCATCCCCGAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTTCCGGGGAGTGCATCGGTACTTGAGCAATGCCTACGCCCGGGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105339 CTTCCGGGGAGTGCATCGGTACTTGAGCAATGCCTACGCCCGGGAAGAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCGCTTCCACCTGTCCAGATGATGAGGAGATCGAGCTCGCCTATGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105389 TCGCTTCCACCTGTCCAGATGATGAGGAGATCGAGCTCGCCTATGAGCAA

    750     .    :    .
    706 GTGGCAAAGGCCCTCAAA
        ||||||||||||||||||
 105439 GTGGCAAAGGCCCTCAAA