seq1 = pF1KB6964.tfa, 723 bp
seq2 = pF1KB6964/gi568815592r_170435223.tfa (gi568815592r:170435223_170653242), 218020 bp

>pF1KB6964 723
>gi568815592r:170435223_170653242 (Chr6)

(complement)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-221  (104130-104237)   100% ->
222-303  (107059-107140)   100% ->
304-433  (109513-109642)   100% ->
434-540  (115903-116009)   100% ->
541-723  (117838-118020)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGTCCTCTACAGCCATGTATTCGGCTCCTGGCAGAGACTTGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGTCCTCTACAGCCATGTATTCGGCTCCTGGCAGAGACTTGGGGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAACCGCACAGAGCCGCGGGCCCTTTGCAGCTGCGATTTTCGCCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAACCGCACAGAGCCGCGGGCCCTTTGCAGCTGCGATTTTCGCCCTACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTTCAACGGAGG         TACTATACTGGCAATTGCTGGAGAAGAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTTCAACGGAGGGTA...CAGTACTATACTGGCAATTGCTGGAGAAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGCAATTGTTGCTTCTGATACTCGATTGAGTGAAGGGTTTTCAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104158 TTTGCAATTGTTGCTTCTGATACTCGATTGAGTGAAGGGTTTTCAATTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TACGCGGGATAGCCCCAAATGTTACAAATT         AACAGACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104208 TACGCGGGATAGCCCCAAATGTTACAAATTGTA...CAGAACAGACAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGTCATTGGATGCAGCGGTTTTCATGGAGACTGTCTTACGCTGACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107070 CAGTCATTGGATGCAGCGGTTTTCATGGAGACTGTCTTACGCTGACAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTATTGAAGCAAGACTAAAG         ATGTATAAGCATTCCAATAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 107120 ATTATTGAAGCAAGACTAAAGGTA...CAGATGTATAAGCATTCCAATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TAAGGCCATGACTACGGGGGCAATTGCTGCAATGCTGTCTACAATCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109533 TAAGGCCATGACTACGGGGGCAATTGCTGCAATGCTGTCTACAATCCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATTCAAGGCGCTTCTTTCCATACTATGTTTACAACATCATCGGTGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109583 ATTCAAGGCGCTTCTTTCCATACTATGTTTACAACATCATCGGTGGACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATGAAGAAG         GAAAGGGGGCTGTATACAGCTTTGATCCAGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 109633 GATGAAGAAGGTA...AAGGAAAGGGGGCTGTATACAGCTTTGATCCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGGGTCTTACCAGAGAGACTCCTTCAAGGCTGGAGGCTCAGCAAGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115934 AGGGTCTTACCAGAGAGACTCCTTCAAGGCTGGAGGCTCAGCAAGTGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCTACAGCCCCTGCTTGACAACCAG         GTTGGTTTTAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 115984 TGCTACAGCCCCTGCTTGACAACCAGGTA...CAGGTTGGTTTTAAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGCAGAATGTGGAGCATGTTCCGCTGTCCTTGGACAGAGCCATGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117853 ATGCAGAATGTGGAGCATGTTCCGCTGTCCTTGGACAGAGCCATGCGGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGTGAAAGATGTCTTCATTTCTGCGGCTGAGAGAGATGTGTACACTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117903 GGTGAAAGATGTCTTCATTTCTGCGGCTGAGAGAGATGTGTACACTGGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACGCACTCCGGATCTGCATAGTGACCAAAGAGGGCATTAGGGAGGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 117953 ACGCACTCCGGATCTGCATAGTGACCAAAGAGGGCATCAGGGAGGAAACT

    750     .    :    .
    706 GTTTCCTTAAGGAAGGAC
        ||||||||||||||||||
 118003 GTTTCCTTAAGGAAGGAC