seq1 = pF1KB6961.tfa, 525 bp
seq2 = pF1KB6961/gi568815596r_73629946.tfa (gi568815596r:73629946_73834569), 204624 bp

>pF1KB6961 525
>gi568815596r:73629946_73834569 (Chr2)

(complement)

1-141  (100001-100141)   100% ->
142-264  (102285-102407)   100% ->
265-441  (103834-104010)   100% ->
442-525  (104541-104624)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTTAACACATCAGCTGGACCTATTTCCCGAATGCAGGGTAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTTAACACATCAGCTGGACCTATTTCCCGAATGCAGGGTAACCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGTTATTTAAAGATGTAAAAAATGCGGGAGACTTGAGAAGAAAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGTTATTTAAAGATGTAAAAAATGCGGGAGACTTGAGAAGAAAGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAAGGCACCATCGATGGATCACTGATAAATCCTACAGTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100101 TGGAAGGCACCATCGATGGATCACTGATAAATCCTACAGTGGTA...TAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTGTTGATCCATTTCAGATACTTGTGGCAGCAAACAAAGCAGTTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102285 ATTGTTGATCCATTTCAGATACTTGTGGCAGCAAACAAAGCAGTTCACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACAAACTGGGAAAAATGAAGACAAGAACTCTATCTACTGAAATTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102335 CTACAAACTGGGAAAAATGAAGACAAGAACTCTATCTACTGAAATTATTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAACCTTTCCCCAAATAACAAT         ATTTCAGAGGCTTTGAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102385 TCAACCTTTCCCCAAATAACAATGTA...TAGATTTCAGAGGCTTTGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAATTTGGTATCTCAGCAAATGACACTTCAATTCTAATTGTTTACATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103852 AAATTTGGTATCTCAGCAAATGACACTTCAATTCTAATTGTTTACATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAGGGAGAAAAACAAATAAATCAAGAATACCTAATATCTCAAGTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103902 AGAGGGAGAAAAACAAATAAATCAAGAATACCTAATATCTCAAGTAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTCATCAGGTTTCTCTGAAAAATCTTCCTGAAATAATGAATATTACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103952 GTCATCAGGTTTCTCTGAAAAATCTTCCTGAAATAATGAATATTACAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTCAAAAAG         ATATATAAACTCTCTTCACAAGAAGAAAGTAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 104002 GTCAAAAAGGTT...CAGATATATAAACTCTCTTCACAAGAAGAAAGTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGGACATTATTGGATGCTATCATTTGTAGAATGTCAACAAAAGATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104573 TGGGACATTATTGGATGCTATCATTTGTAGAATGTCAACAAAAGATGTTT

    550 
    524 TA
        ||
 104623 TA