seq1 = pF1KB6956.tfa, 714 bp
seq2 = pF1KB6956/gi568815596r_38645136.tfa (gi568815596r:38645136_38850196), 205061 bp

>pF1KB6956 714
>gi568815596r:38645136_38850196 (Chr2)

(complement)

1-28  (98941-98968)   100% ->
29-209  (100003-100183)   100% ->
210-386  (100492-100668)   100% ->
387-461  (101544-101618)   100% ->
462-572  (102040-102150)   100% ->
573-626  (103450-103503)   100% ->
627-662  (104018-104053)   100% ->
663-714  (105010-105061)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGCGTTACGGGCGGTACGGAGGAG         AAACCAAGGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  98941 ATGTCGCGTTACGGGCGGTACGGAGGAGGTA...CAGAAACCAAGGTGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGTTGGTAACCTGGGAACTGGCGCTGGCAAAGGAGAGTTAGAAAGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 TGTTGGTAACCTGGGAACTGGCGCTGGCAAAGGAGAGTTAGAAAGGGCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAGTTATTATGGTCCTTTAAGAACTGTATGGATTGCGAGAAATCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100066 TCAGTTATTATGGTCCTTTAAGAACTGTATGGATTGCGAGAAATCCTCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGATTTGCCTTTGTGGAATTCGAAGATCCTAGAGATGCAGAAGATGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100116 GGATTTGCCTTTGTGGAATTCGAAGATCCTAGAGATGCAGAAGATGCAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACGAGGACTGGATGGAAA         GGTGATTTGTGGCTCCCGAGTGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100166 ACGAGGACTGGATGGAAAGTA...TAGGGTGATTTGTGGCTCCCGAGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGTTGAACTATCGACAGGCATGCCTCGGAGATCACGTTTTGATAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100515 GGGTTGAACTATCGACAGGCATGCCTCGGAGATCACGTTTTGATAGACCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTGCCCGACGTCCCTTTGATCCAAATGATAGATGCTATGAGTGTGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100565 CCTGCCCGACGTCCCTTTGATCCAAATGATAGATGCTATGAGTGTGGCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAAGGGACATTATGCTTATGATTGTCATCGTTACAGCCGGCGAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100615 AAAGGGACATTATGCTTATGATTGTCATCGTTACAGCCGGCGAAGAAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAG         GTCACGGTCTAGATCACATTCTCGATCCAGAGGAAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100665 GCAGGTA...TAGGTCACGGTCTAGATCACATTCTCGATCCAGAGGAAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGATACTCTCGCTCACGCAGCAGGAGCAGGGGACGAAG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101581 CGATACTCTCGCTCACGCAGCAGGAGCAGGGGACGAAGGTG...TAGGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAGGTCAGCATCTCCTCGACGATCAAGATCTATCTCTCTTCGTAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102043 AAGGTCAGCATCTCCTCGACGATCAAGATCTATCTCTCTTCGTAGATCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GATCAGCTTCACTCAGAAGATCTAGGTCTGGTTCTATAAAAGGATCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102093 GATCAGCTTCACTCAGAAGATCTAGGTCTGGTTCTATAAAAGGATCGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATTTCCA         ATCCCCGTCGAGGTCAAGATCAAGATCCAGGTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102143 TATTTCCAGTA...AAGATCCCCGTCGAGGTCAAGATCAAGATCCAGGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TATTTCACGACCAAGAAGCAG         CCGATCAAAGTCCAGATCTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103483 TATTTCACGACCAAGAAGCAGGTA...CAGCCGATCAAAGTCCAGATCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CATCTCCAAAAAGAAG         TCGTTCCCCATCAGGAAGTCCTCGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 104038 CATCTCCAAAAAGAAGGTA...TAGTCGTTCCCCATCAGGAAGTCCTCGC

    750     .    :    .    :    .
    688 AGAAGTGCAAGTCCTGAAAGAATGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||
 105035 AGAAGTGCAAGTCCTGAAAGAATGGAC