seq1 = pF1KB6951.tfa, 636 bp
seq2 = pF1KB6951/gi568815595r_123869158.tfa (gi568815595r:123869158_124080481), 211324 bp

>pF1KB6951 636
>gi568815595r:123869158_124080481 (Chr3)

(complement)

1-116  (100001-100116)   100% ->
117-234  (103501-103618)   100% ->
235-396  (104942-105103)   100% ->
397-572  (110265-110440)   100% ->
573-636  (111261-111324)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCAGACAGATAAGCCAACATGCATCCCGCCGGAGCTGCCGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCAGACAGATAAGCCAACATGCATCCCGCCGGAGCTGCCGAAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGAAGGAGTTTGCCAAAGCCGCCATTAGGGTGCAGCCGCAGGACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGAAGGAGTTTGCCAAAGCCGCCATTAGGGTGCAGCCGCAGGACCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCAGTGGGCAGCCGA         TTATTTTGAGGCCCTGTCCCGTGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCAGTGGGCAGCCGAGTA...TAGTTATTTTGAGGCCCTGTCCCGTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGACGCCTCCGGTGAGAGAGCGGTCTGAGCGAGTCGCTTTGTGTAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103526 GAGACGCCTCCGGTGAGAGAGCGGTCTGAGCGAGTCGCTTTGTGTAACCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCAGAGCTAACACCTGAGCTGTTAAAGATCCTGCATTCTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103576 GGCAGAGCTAACACCTGAGCTGTTAAAGATCCTGCATTCTCAGGTA...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    235   GTTGCTGGCAGACTGATCATCCGTGCAGAGGAGCTGGCCCAGATGTGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104940 AGGTTGCTGGCAGACTGATCATCCGTGCAGAGGAGCTGGCCCAGATGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAGTGGTGAATCTCCCAACAGATCTGTTTAATAGTGTGATGAATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104990 AAAGTGGTGAATCTCCCAACAGATCTGTTTAATAGTGTGATGAATGTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCGCTTCACGGAGGAGATCGAGTGGCTGAAGTTTTTAGCCCTTGCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105040 TCGCTTCACGGAGGAGATCGAGTGGCTGAAGTTTTTAGCCCTTGCTTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCGCTCTGGGAGTT         ACTATTACCAAAACTCTCAAGATAGTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105090 GCGCTCTGGGAGTTGTA...TAGACTATTACCAAAACTCTCAAGATAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGTGAGGTCTTATCATGTGACCATAATGGTGGGTCGCCCCGGATCCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110292 TGTGAGGTCTTATCATGTGACCATAATGGTGGGTCGCCCCGGATCCCGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGCACCTTCCAGTTTCTCTACACGTATATTGCCAAAGTGGATGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110342 CAGCACCTTCCAGTTTCTCTACACGTATATTGCCAAAGTGGATGGGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCTCTGCATCACATGTCAGCAGGATGCTAAACTACATGGAACAGGAAGT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 110392 TCTCTGCATCACATGTCAGCAGGATGCTAAACTACATGGAACAGGAAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    573         AATTGGCCCTGATGGTATAATCACAGTGAATGACTTTACCCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110442 TA...CAGAATTGGCCCTGATGGTATAATCACAGTGAATGACTTTACCCA

    650     .    :    .    :
    615 AAACCCCAGGGTTCAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||
 111303 AAACCCCAGGGTTCAGCTGGAG