seq1 = pF1KB6950.tfa, 702 bp
seq2 = pF1KB6950/gi568815591r_42817577.tfa (gi568815591r:42817577_43032158), 214582 bp

>pF1KB6950 702
>gi568815591r:42817577_43032158 (Chr7)

(complement)

1-41  (100001-100041)   100% ->
42-118  (104700-104776)   100% ->
119-251  (105491-105623)   100% ->
252-374  (107362-107484)   100% ->
375-456  (108753-108834)   100% ->
457-530  (110228-110301)   100% ->
531-588  (114324-114381)   100% ->
589-702  (114469-114582)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGCGCGGGTACAGCTTTTCGCTGACTACATTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100001 ATGGCGGAGCGCGGGTACAGCTTTTCGCTGACTACATTCAGGTA...AAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCCGTCTGGTAAACTTGTCCAGATTGAATATGCTTTGGCTGCTGTAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104700 CCCGTCTGGTAAACTTGTCCAGATTGAATATGCTTTGGCTGCTGTAGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAGGAGCCCCGTCCGTGGGAATTAAAG         CTGCAAATGGTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 104750 GAGGAGCCCCGTCCGTGGGAATTAAAGGTA...AAGCTGCAAATGGTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTATTAGCAACTGAGAAAAAACAGAAATCCATTCTGTATGATGAGCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105505 GTATTAGCAACTGAGAAAAAACAGAAATCCATTCTGTATGATGAGCGAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTACACAAAGTAGAACCAATTACCAAGCATATAGGTTTGGTGTACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105555 TGTACACAAAGTAGAACCAATTACCAAGCATATAGGTTTGGTGTACAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCATGGGCCCCGATTACAG         AGTGCTTGTGCACAGAGCTCGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105605 GCATGGGCCCCGATTACAGGTA...TAGAGTGCTTGTGCACAGAGCTCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAACTAGCTCAACAATACTATCTTGTGTACCAAGAACCCATTCCTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107384 AAACTAGCTCAACAATACTATCTTGTGTACCAAGAACCCATTCCTACAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCAGCTGGTACAGAGAGTAGCTTCTGTGATGCAAGAATATACTCAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107434 TCAGCTGGTACAGAGAGTAGCTTCTGTGATGCAAGAATATACTCAGTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 G         TGGTGTTCGTCCATTTGGAGTTTCTTTACTTATTTGTGGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107484 GGTA...CAGTGGTGTTCGTCCATTTGGAGTTTCTTTACTTATTTGTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGGAATGAGGGACGACCATATTTATTTCAGTCAGATCCATCT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 108793 TGGAATGAGGGACGACCATATTTATTTCAGTCAGATCCATCTGTA...TA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    457  GGAGCTTACTTTGCCTGGAAAGCTACAGCAATGGGAAAGAACTATGTGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110227 GGGAGCTTACTTTGCCTGGAAAGCTACAGCAATGGGAAAGAACTATGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATGGGAAGACTTTCCTTGAGAAAAG         ATATAATGAAGATCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 110277 ATGGGAAGACTTTCCTTGAGAAAAGGTA...CAGATATAATGAAGATCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GAACTTGAAGATGCCATTCATACAGCCATCTTAACCCTAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 114340 GAACTTGAAGATGCCATTCATACAGCCATCTTAACCCTAAAGGTT...TA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    589  GAAAGCTTTGAAGGGCAAATGACAGAGGATAACATAGAAGTTGGAATCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114468 GGAAAGCTTTGAAGGGCAAATGACAGAGGATAACATAGAAGTTGGAATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GCAATGAAGCTGGATTTAGGAGGCTTACTCCAACTGAAGTTAAGGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114518 GCAATGAAGCTGGATTTAGGAGGCTTACTCCAACTGAAGTTAAGGATTAC

    750     .    :    .
    688 TTGGCTGCCATAGCA
        |||||||||||||||
 114568 TTGGCTGCCATAGCA