seq1 = pF1KB6944.tfa, 693 bp
seq2 = pF1KB6944/gi568815579r_42197081.tfa (gi568815579r:42197081_42402309), 205229 bp

>pF1KB6944 693
>gi568815579r:42197081_42402309 (Chr19)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-168  (100271-100360)   100% ->
169-285  (102023-102139)   100% ->
286-408  (102218-102340)   100% ->
409-693  (104945-105229)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGGAGAGGAGAACCCAGCCAGCAAGCCCACGCCGGTGCAGGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGGAGAGGAGAACCCAGCCAGCAAGCCCACGCCGGTGCAGGACGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGGGCGACGGGCGCTGGATGTCCCTG         CACCATCGGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 ACAGGGCGACGGGCGCTGGATGTCCCTGGTG...CAGCACCATCGGTTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGCTGACAGCAAAGATAAGGAACCCGAAGTCGTCTTCATCGGGGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100284 TGGCTGACAGCAAAGATAAGGAACCCGAAGTCGTCTTCATCGGGGACTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGGTCCAGCTCATGCACCAGTGCGAG         ATCTGGCGCGAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100334 TTGGTCCAGCTCATGCACCAGTGCGAGGTG...CAGATCTGGCGCGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTCTCTCCTCTGCATGCACTTAACTTTGGCATTGGTGGTGACGGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102037 CTTCTCTCCTCTGCATGCACTTAACTTTGGCATTGGTGGTGACGGCACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCATGTACTGTGGCGGCTGGAGAATGGGGAGCTGGAACACATCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102087 AGCATGTACTGTGGCGGCTGGAGAATGGGGAGCTGGAACACATCCGGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAG         ATTGTGGTGGTCTGGGTGGGCACCAACAACCACGGACA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102137 AAGGTG...CAGATTGTGGTGGTCTGGGTGGGCACCAACAACCACGGACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CACAGCAGAGCAGGTGACTGGTGGCATCAAGGCCATTGTGCAACTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102256 CACAGCAGAGCAGGTGACTGGTGGCATCAAGGCCATTGTGCAACTGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGAGCGACAGCCCCAGGCCCGGGTTGTGGTGCTG         GGCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102306 ATGAGCGACAGCCCCAGGCCCGGGTTGTGGTGCTGGTG...CAGGGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTTCCGCGAGGCCAACATCCCAACCCACTTCGGGAGAAGAACCGACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104951 CTTCCGCGAGGCCAACATCCCAACCCACTTCGGGAGAAGAACCGACAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAACGAGCTGGTACGGGCGGCACTGGCTGGCCACCCTCGGGCCCACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105001 GAACGAGCTGGTACGGGCGGCACTGGCTGGCCACCCTCGGGCCCACTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TAGATGCCGACCCTGGCTTTGTGCACTCAGATGGCACCATCAGCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105051 TAGATGCCGACCCTGGCTTTGTGCACTCAGATGGCACCATCAGCCATCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GACATGTATGATTACCTGCATCTGAGCCGCCTGGGCTACACACCTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105101 GACATGTATGATTACCTGCATCTGAGCCGCCTGGGCTACACACCTGTTTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCGGGCTCTGCACTCCCTGCTTCTGCGTCTGCTGGCCCAAGACCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105151 CCGGGCTCTGCACTCCCTGCTTCTGCGTCTGCTGGCCCAAGACCAGGGCC

    700     .    :    .    :    .
    665 AAGGTGCTCCCCTGCTGGAGCCCGCACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 105201 AAGGTGCTCCCCTGCTGGAGCCCGCACCC