seq1 = pF1KB6943.tfa, 549 bp
seq2 = pF1KB6943/gi568815587f_8811450.tfa (gi568815587f:8811450_9019477), 208028 bp

>pF1KB6943 549
>gi568815587f:8811450_9019477 (Chr11)

1-222  (100001-100222)   100% ->
223-327  (103377-103481)   100% ->
328-408  (105838-105918)   100% ->
409-549  (107888-108028)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAACTGTTTGGCGGCCGCAGCGCTGAATGGGGTGGACCGACGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAACTGTTTGGCGGCCGCAGCGCTGAATGGGGTGGACCGACGTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCAGCGTTCAGCAAGGCTGGCTCTAGAAGTGCTGGAGAGGGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCAGCGTTCAGCAAGGCTGGCTCTAGAAGTGCTGGAGAGGGCCAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAGGGCGGTGGACTGGCATGCCCTGGAGCGTCCCAAAGGCTGCATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGAGGGCGGTGGACTGGCATGCCCTGGAGCGTCCCAAAGGCTGCATGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCTTGCCCGGGAGGCGCCCCACCTAGAGAAACAGCCGGCAGCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCCTTGCCCGGGAGGCGCCCCACCTAGAGAAACAGCCGGCAGCCGGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGCGCGTTCTCCCGGGAGAG         AAATATTATTCATCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100201 GCAGCGCGTTCTCCCGGGAGAGGTG...TAGAAATATTATTCATCTGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGAGGAAGGAGGGGCAACCCATGTCTATCGTTATCACAGAGGCGAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103396 CAGAGGAAGGAGGGGCAACCCATGTCTATCGTTATCACAGAGGCGAGTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGCTGCACATGTGCTTGGACATAGGGAATGGTCAG         AGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103446 AAGCTGCACATGTGCTTGGACATAGGGAATGGTCAGGTA...CAGAGAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGACAGAAAAAAGACATCCCTTGGTCCTGGAGGCAGCTATCAAATATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105843 AGACAGAAAAAAGACATCCCTTGGTCCTGGAGGCAGCTATCAAATATCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCATGCTCCAGAGGCATCCCAGCCT         GCTGAGAACATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105893 AGCATGCTCCAGAGGCATCCCAGCCTGTG...TAGGCTGAGAACATCTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGGACCTCTACATAGAAGTATATCCAGGGACCTATTCTGTCACTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107903 AAGGACCTCTACATAGAAGTATATCCAGGGACCTATTCTGTCACTGTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCAAATGACTTAACCAAGAAGACTCATGTGGTAGCAGTTGATTCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107953 CTCAAATGACTTAACCAAGAAGACTCATGTGGTAGCAGTTGATTCTGGAC

    550     .    :    .    :    .
    524 AAAGCGTGGACCTGGTCTTCCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 108003 AAAGCGTGGACCTGGTCTTCCCTGTG