seq1 = pF1KB6942.tfa, 687 bp
seq2 = pF1KB6942/gi568815593r_176292777.tfa (gi568815593r:176292777_176516363), 223587 bp

>pF1KB6942 687
>gi568815593r:176292777_176516363 (Chr5)

(complement)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-234  (106061-106107)   100% ->
235-352  (118317-118434)   100% ->
353-464  (118646-118757)   100% ->
465-518  (119832-119885)   100% ->
519-687  (123419-123587)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGATGACTTTGGCTTCTTCTCGTCGTCGGAGAGCGGTGCCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGATGACTTTGGCTTCTTCTCGTCGTCGGAGAGCGGTGCCCCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGCGGAGGAGGACCCGGCGGCCGCCTTCCTGGCCCAGCAGGAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGCGGAGGAGGACCCGGCGGCCGCCTTCCTGGCCCAGCAGGAGAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATTGCAGGCATAGAGAACGACGAGGGCTTCGGGGCACCTGCCGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGATTGCAGGCATAGAGAACGACGAGGGCTTCGGGGCACCTGCCGGCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATGCGGCCCCCGCGCAGCCGGGCCCCACGAGTGGGG         CTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 CATGCGGCCCCCGCGCAGCCGGGCCCCACGAGTGGGGGTG...CAGCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCTGAGGACATGGGGACCACAGTCAATGGAGATGTGTTTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106065 TTCTGAGGACATGGGGACCACAGTCAATGGAGATGTGTTTCAGGTA...T

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    235   GAGGCCAACGGTCCTGCTGATGGCTACGCAGCCATTGCCCAGGCTGAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118315 AGGAGGCCAACGGTCCTGCTGATGGCTACGCAGCCATTGCCCAGGCTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGGCTGACCCAGGAGCCTGAGAGCATCCGCAAGTGGCGAGAGGAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118365 AGGCTGACCCAGGAGCCTGAGAGCATCCGCAAGTGGCGAGAGGAGCAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAACGGCTGCAAGAGCTGG         ATGCTGCATCTAAGGTCACGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 118415 GAAACGGCTGCAAGAGCTGGGTG...TAGATGCTGCATCTAAGGTCACGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AACAGGAATGGCGGGAGAAGGCCAAGAAGGACCTGGAGGAGTGGAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118667 AACAGGAATGGCGGGAGAAGGCCAAGAAGGACCTGGAGGAGTGGAACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGCCAGAGTGAACAAGTAGAGAAGAACAAGATCAACAACCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 118717 CGCCAGAGTGAACAAGTAGAGAAGAACAAGATCAACAACCGGTG...AAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GATCGCTGACAAAGCATTCTACCAGCAGCCAGATGCTGATATCATCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119832 GATCGCTGACAAAGCATTCTACCAGCAGCCAGATGCTGATATCATCGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACGT         GGCATCCGAGGAGGCTTTCGTGAAGGAATCCAAGGAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119882 ACGTGTA...CAGGGCATCCGAGGAGGCTTTCGTGAAGGAATCCAAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGACCCCAGGCACAGAGTGGGAGAAGGTGGCCCAGCTATGTGACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123456 GAGACCCCAGGCACAGAGTGGGAGAAGGTGGCCCAGCTATGTGACTTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCCCAAGAGCAGCAAGCAGTGCAAAGATGTGTCCCGCCTGCGCTCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123506 CCCCAAGAGCAGCAAGCAGTGCAAAGATGTGTCCCGCCTGCGCTCGGTGC

    700     .    :    .    :    .    :
    656 TCATGTCCCTGAAGCAGACGCCACTGTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 123556 TCATGTCCCTGAAGCAGACGCCACTGTCCCGC