seq1 = pF1KB6938.tfa, 687 bp
seq2 = pF1KB6938/gi568815586r_9893146.tfa (gi568815586r:9893146_10099100), 205955 bp

>pF1KB6938 687
>gi568815586r:9893146_10099100 (Chr12)

(complement)

1-64  (100001-100064)   98% ->
65-163  (100721-100819)   98% ->
164-283  (101822-101941)   99% ->
284-438  (102101-102255)   100% ->
439-545  (103855-103961)   100% ->
546-687  (105814-105955)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGATGAAGATGGATACATCACCTTAAATATTAAAACTCGGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGATGAAGATGGATACATCACCTTAAATATTAAAACTCGGAAACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCTCTCGTCTCCG         TTGGCCCTGCATCCTCCTCCTGGTGGC
        ||||||| ||||||>>>...>>>||||| |||||||||||||||||||||
 100051 AGCTCTCATCTCCGGTA...CAGTTGGCTCTGCATCCTCCTCCTGGTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGTGATGGCTTTGATTCTGCTGATCCTGTGCGTGGGGATGGTTGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100748 GTGTGATGGCTTTGATTCTGCTGATCCTGTGCGTGGGGATGGTTGTCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGTGGCTCTGGGGATTTGGT         CTGTCATGCAGCGCAATTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100798 CTGGTGGCTCTGGGGATTTGGTGTA...TAGCTGTCATGCAGCGCAATTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTACAAGATGAGAATGAAAATCGCACAGGAACTCTGCAACAATTAGCAA
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101841 CCTACAAGGTGAGAATGAAAATCGCACAGGAACTCTGCAACAATTAGCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCGCTTCTGTCAATATGTGGTAAAACAATCAGAACTAAAGGGCACTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101891 AGCGCTTCTGTCAATATGTGGTAAAACAATCAGAACTAAAGGGCACTTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 A         AAGGTCATAAATGCAGCCCCTGTGACACAAACTGGAGATA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101941 AGTA...CAGAAGGTCATAAATGCAGCCCCTGTGACACAAACTGGAGATA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTATGGAGATAGCTGCTATGGGTTCTTCAGGCACAACTTAACATGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102141 TTATGGAGATAGCTGCTATGGGTTCTTCAGGCACAACTTAACATGGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAGTAAGCAGTACTGCACTGACATGAATGCTACTCTCCTGAAGATTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102191 AGAGTAAGCAGTACTGCACTGACATGAATGCTACTCTCCTGAAGATTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACCGGAACATTGTG         GAGTACATCAAAGCCAGGACTCATTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102241 AACCGGAACATTGTGGTA...TAGGAGTACATCAAAGCCAGGACTCATTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AATTCGTTGGGTCGGATTATCTCGCCAGAAGTCGAATGAGGTCTGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103881 AATTCGTTGGGTCGGATTATCTCGCCAGAAGTCGAATGAGGTCTGGAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGGAGGATGGCTCGGTTATCTCAGAAAATAT         GTTTGAGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103931 GGGAGGATGGCTCGGTTATCTCAGAAAATATGTA...CAGGTTTGAGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTGGAAGATGGAAAAGGAAATATGAATTGTGCTTATTTTCATAATGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105824 TTGGAAGATGGAAAAGGAAATATGAATTGTGCTTATTTTCATAATGGGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AATGCACCCTACCTTCTGTGAGAACAAACATTATTTAATGTGTGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105874 AATGCACCCTACCTTCTGTGAGAACAAACATTATTTAATGTGTGAGAGGA

    700     .    :    .    :    .    :
    656 AGGCTGGCATGACCAAGGTGGACCAACTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 105924 AGGCTGGCATGACCAAGGTGGACCAACTACCT