seq1 = pF1KB6936.tfa, 687 bp
seq2 = pF1KB6936/gi568815579f_4129551.tfa (gi568815579f:4129551_4337085), 207535 bp

>pF1KB6936 687
>gi568815579f:4129551_4337085 (Chr19)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-200  (101641-101773)   100% ->
201-379  (103579-103757)   100% ->
380-537  (105117-105274)   100% ->
538-687  (107386-107535)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCCGCAGCTTCTCCTGGCCCTTGTCCTCTGGGCCAGCTGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCCGCAGCTTCTCCTGGCCCTTGTCCTCTGGGCCAGCTGCCCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCAGTGGAAGGAAAG         GGCCCCCAGCAGCTCTGACACTGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCAGTGGAAGGAAAGGTA...CAGGGCCCCCAGCAGCTCTGACACTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCGGGTGCAATGCCGAGCCTCTCGGTACCCGATCGCCGTGGATTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101665 CCCGGGTGCAATGCCGAGCCTCTCGGTACCCGATCGCCGTGGATTGCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGACCCTGCCGCCTGCTCCAAACTCCACCAGCCCCGTGTCCTTCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101715 TGGACCCTGCCGCCTGCTCCAAACTCCACCAGCCCCGTGTCCTTCATTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACGTACAG         GCTCGGCATGGCTGCCCGGGGCCACAGCTGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101765 CACGTACAGGTC...CAGGCTCGGCATGGCTGCCCGGGGCCACAGCTGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCTGCCTGCAGCAGACGCCAACGTCCACCAGCTGCACCATCACGGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103611 CCTGCCTGCAGCAGACGCCAACGTCCACCAGCTGCACCATCACGGATGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGCTGTTCTCCATGGCTCCCTACGTGCTCAATGTCACCGCCGTCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103661 CAGCTGTTCTCCATGGCTCCCTACGTGCTCAATGTCACCGCCGTCCACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTGGGGCTCCAGCAGCAGCTTCGTGCCTTTCATAACAGAGCACATCA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103711 CTGGGGCTCCAGCAGCAGCTTCGTGCCTTTCATAACAGAGCACATCAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    380       TCAAGCCCGACCCTCCAGAAGGCGTGCGCCTAAGCCCCCTCGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103761 ...CAGTCAAGCCCGACCCTCCAGAAGGCGTGCGCCTAAGCCCCCTCGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGCGCCAGCTACAGGTGCAGTGGGAGCCTCCCGGGTCCTGGCCCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105161 GAGCGCCAGCTACAGGTGCAGTGGGAGCCTCCCGGGTCCTGGCCCTTCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAGATCTTCTCACTGAAGTACTGGATCCGTTACAAGCGTCAGGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105211 AGAGATCTTCTCACTGAAGTACTGGATCCGTTACAAGCGTCAGGGAGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGCGCTTCCACCGG         GTGGGGCCCATTGAAGCCACGTCCTTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105261 CGCGCTTCCACCGGGTG...CAGGTGGGGCCCATTGAAGCCACGTCCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATCCTCAGGGCTGTGCGGCCCCGAGCCAGGTACTACGTCCAAGTGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107413 ATCCTCAGGGCTGTGCGGCCCCGAGCCAGGTACTACGTCCAAGTGGCGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCAGGACCTCACAGACTACGGGGAACTGAGTGACTGGAGTCTCCCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107463 TCAGGACCTCACAGACTACGGGGAACTGAGTGACTGGAGTCTCCCCGCCA

    700     .    :    .    :
    665 CTGCCACAATGAGCCTGGGCAAG
        |||||||||||||||||||||||
 107513 CTGCCACAATGAGCCTGGGCAAG