seq1 = pF1KB6935.tfa, 621 bp
seq2 = pF1KB6935/gi568815588f_129436253.tfa (gi568815588f:129436253_129866994), 430742 bp

>pF1KB6935 621
>gi568815588f:129436253_129866994 (Chr10)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-274  (271635-271791)   96% ->
275-414  (322950-323089)   100% ->
415-621  (330536-330742)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAAGGATTGTGAAATGAAACGCACCACACTGGACAGCCCTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAAGGATTGTGAAATGAAACGCACCACACTGGACAGCCCTTTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGCTGGAGCTGTCTGGTTGTGAGCAGGGTCTGCACGAAATAAAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGCTGGAGCTGTCTGGTTGTGAGCAGGGTCTGCACGAAATAAAGCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGGCAAGGGGAC         GTCTGCAGCTGATGCCGTGGAGGTCCCA
        |||||||||||||>>>...>>> | ||||---|-||||||||||||||||
 100101 TGGGCAAGGGGACGTC...CACTTTTGCA   G TGCCGTGGAGGTCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCCCCGCTGCGGTTCTCGGAGGTCCGGAGCCCCTGATGCAGTGCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271659 GCCCCCGCTGCGGTTCTCGGAGGTCCGGAGCCCCTGATGCAGTGCACAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGGCTGAATGCCTATTTCCACCAGCCCGAGGCTATCGAAGAGTTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271709 CTGGCTGAATGCCTATTTCCACCAGCCCGAGGCTATCGAAGAGTTCCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCCGGCTCTTCACCATCCCGTTTTCCAGCAAG         AGTCGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 271759 TGCCGGCTCTTCACCATCCCGTTTTCCAGCAAGGTC...CAGAGTCGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCAGACAGGTGTTATGGAAGCTGCTGAAGGTTGTGAAATTCGGAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 322958 ACCAGACAGGTGTTATGGAAGCTGCTGAAGGTTGTGAAATTCGGAGAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATTTCTTACCAGCAATTAGCAGCCCTGGCAGGCAACCCCAAAGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 323008 GATTTCTTACCAGCAATTAGCAGCCCTGGCAGGCAACCCCAAAGCCGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAGCAGTGGGAGGAGCAATGAGAGGCAATCCT         GTCCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 323058 GAGCAGTGGGAGGAGCAATGAGAGGCAATCCTGTG...CAGGTCCCCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTCATCCCGTGCCACAGAGTGGTCTGCAGCAGCGGAGCCGTGGGCAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330545 CTCATCCCGTGCCACAGAGTGGTCTGCAGCAGCGGAGCCGTGGGCAACTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCCGGAGGACTGGCCGTGAAGGAATGGCTTCTGGCCCATGAAGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330595 CTCCGGAGGACTGGCCGTGAAGGAATGGCTTCTGGCCCATGAAGGCCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGTTGGGGAAGCCAGGCTTGGGAGGGAGCTCAGGTCTGGCAGGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330645 GGTTGGGGAAGCCAGGCTTGGGAGGGAGCTCAGGTCTGGCAGGGGCCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    574 CTCAAGGGAGCGGGAGCTACCTCGGGCTCCCCGCCTGCTGGCCGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330695 CTCAAGGGAGCGGGAGCTACCTCGGGCTCCCCGCCTGCTGGCCGAAAC