seq1 = pF1KB6928.tfa, 681 bp
seq2 = pF1KB6928/gi568815592r_22187405.tfa (gi568815592r:22187405_22394586), 207182 bp

>pF1KB6928 681
>gi568815592r:22187405_22394586 (Chr6)

(complement)

1-28  (97605-97632)   100% ->
29-204  (100003-100178)   100% ->
205-312  (101942-102049)   100% ->
313-492  (104234-104413)   100% ->
493-681  (106994-107182)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACATCAAAGGATCGCCATGGAAAG         GGTCCCTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  97605 ATGAACATCAAAGGATCGCCATGGAAAGGTA...CAGGGTCCCTCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCTGCTGGTGTCAAACCTGCTCCTGTGCCAGAGCGTGGCCCCCTTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 GCTGCTGGTGTCAAACCTGCTCCTGTGCCAGAGCGTGGCCCCCTTGCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCTGTCCCGGCGGGGCTGCCCGATGCCAGGTGACCCTTCGAGACCTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100066 TCTGTCCCGGCGGGGCTGCCCGATGCCAGGTGACCCTTCGAGACCTGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCGCGCCGTCGTCCTGTCCCACTACATCCATAACCTCTCCTCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100116 GACCGCGCCGTCGTCCTGTCCCACTACATCCATAACCTCTCCTCAGAAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTCAGCGAATTC         GATAAACGGTATACCCATGGCCGGGGGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100166 GTTCAGCGAATTCGTA...CAGGATAAACGGTATACCCATGGCCGGGGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCATTACCAAGGCCATCAACAGCTGCCACACTTCTTCCCTTGCCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101970 TCATTACCAAGGCCATCAACAGCTGCCACACTTCTTCCCTTGCCACCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAGACAAGGAGCAAGCCCAACAGATGAAT         CAAAAAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102020 GAAGACAAGGAGCAAGCCCAACAGATGAATGTG...TAGCAAAAAGACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCTGAGCCTGATAGTCAGCATATTGCGATCCTGGAATGAGCCTCTGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104245 TCTGAGCCTGATAGTCAGCATATTGCGATCCTGGAATGAGCCTCTGTATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCTGGTCACGGAAGTACGTGGTATGCAAGAAGCCCCGGAGGCTATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104295 ATCTGGTCACGGAAGTACGTGGTATGCAAGAAGCCCCGGAGGCTATCCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCCAAAGCTGTAGAGATTGAGGAGCAAACCAAACGGCTTCTAGAGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104345 TCCAAAGCTGTAGAGATTGAGGAGCAAACCAAACGGCTTCTAGAGGGCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAGCTGATAGTCAGCCAG         GTTCATCCTGAAACCAAAGAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 104395 GGAGCTGATAGTCAGCCAGGTG...TAGGTTCATCCTGAAACCAAAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGAGATCTACCCTGTCTGGTCGGGACTTCCATCCCTGCAGATGGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107016 ATGAGATCTACCCTGTCTGGTCGGGACTTCCATCCCTGCAGATGGCTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAAGAGTCTCGCCTTTCTGCTTATTATAACCTGCTCCACTGCCTACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107066 GAAGAGTCTCGCCTTTCTGCTTATTATAACCTGCTCCACTGCCTACGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGATTCACATAAAATCGACAATTATCTCAAGCTCCTGAAGTGCCGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107116 GGATTCACATAAAATCGACAATTATCTCAAGCTCCTGAAGTGCCGAATCA

    700     .    :    .
    665 TCCACAACAACAACTGC
        |||||||||||||||||
 107166 TCCACAACAACAACTGC