seq1 = pF1KB6926.tfa, 684 bp
seq2 = pF1KB6926/gi568815581f_74637010.tfa (gi568815581f:74637010_74845408), 208399 bp

>pF1KB6926 684
>gi568815581f:74637010_74845408 (Chr17)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-219  (103759-103869)   100% ->
220-261  (105245-105286)   100% ->
262-328  (106120-106186)   100% ->
329-381  (106279-106331)   100% ->
382-447  (107299-107364)   100% ->
448-504  (107864-107920)   100% ->
505-581  (107999-108075)   100% ->
582-684  (108297-108399)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGCTCATGTCCGAAGCGCACGGAGCCGAGCCGGTGTTGCTCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGCTCATGTCCGAAGCGCACGGAGCCGAGCCGGTGTTGCTCAGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGCCCGCCCCTTCACGCAGACCCTGCGGCTCTGCGTGCCCTCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGCCCGCCCCTTCACGCAGACCCTGCGGCTCTGCGTGCCCTCAGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGCAAG         GTGATGCTTCTGGGAGACACAGGCGTCGGCAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGCAAGGTC...TAGGTGATGCTTCTGGGAGACACAGGCGTCGGCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACATGTTTCCTGATCCAATTCAAAGACGGGGCCTTCCTGTCCGGAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103792 ACATGTTTCCTGATCCAATTCAAAGACGGGGCCTTCCTGTCCGGAACCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATAGCCACCGTCGGCATAGACTTCAGG         AACAAGGTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103842 CATAGCCACCGTCGGCATAGACTTCAGGGTG...CAGAACAAGGTGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGTGGATGGCGTGAGAGTGAAGCTGCAG         ATCTGGGACACC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 105258 CTGTGGATGGCGTGAGAGTGAAGCTGCAGGTG...CAGATCTGGGACACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCTGGGCAGGAACGGTTCCGAAGCGTCACCCATGCTTATTACAGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106132 GCTGGGCAGGAACGGTTCCGAAGCGTCACCCATGCTTATTACAGAGATGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCAGG         CCTTGCTTCTGCTGTATGACATCACCAACAAATCTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106182 TCAGGGTG...CAGCCTTGCTTCTGCTGTATGACATCACCAACAAATCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTTTCGACAACATCAGG         GCCTGGCTCACTGAGATTCATGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 106315 CTTTCGACAACATCAGGGTA...CAGGCCTGGCTCACTGAGATTCATGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TATGCCCAGAGGGACGTGGTGATCATGCTGCTAGGCAACAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 107323 TATGCCCAGAGGGACGTGGTGATCATGCTGCTAGGCAACAAGGTG...CA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    448  GCGGATATGAGCAGCGAAAGAGTGATCCGTTCCGAAGACGGAGAGACCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107863 GGCGGATATGAGCAGCGAAAGAGTGATCCGTTCCGAAGACGGAGAGACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGGCCAGG         GAGTACGGTGTTCCCTTCCTGGAGACCAGCGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 107913 TGGCCAGGGTA...CAGGAGTACGGTGTTCCCTTCCTGGAGACCAGCGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 AAGACTGGCATGAATGTGGAGTTAGCCTTTCTGGCCATCGCCAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 108032 AAGACTGGCATGAATGTGGAGTTAGCCTTTCTGGCCATCGCCAAGTG...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    582    GGAACTGAAATACCGGGCCGGGCATCAGGCGGATGAGCCCAGCTTCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108294 AAGGGAACTGAAATACCGGGCCGGGCATCAGGCGGATGAGCCCAGCTTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 AGATCCGAGACTATGTAGAGTCCCAGAAGAAGCGCTCCAGCTGCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108344 AGATCCGAGACTATGTAGAGTCCCAGAAGAAGCGCTCCAGCTGCTGCTCC

    750     .
    679 TTCATG
        ||||||
 108394 TTCATG