seq1 = pF1KB6924.tfa, 681 bp
seq2 = pF1KB6924/gi568815579f_19415990.tfa (gi568815579f:19415990_19628123), 212134 bp

>pF1KB6924 681
>gi568815579f:19415990_19628123 (Chr19)

1-343  (100001-100343)   100% ->
344-422  (110193-110271)   100% ->
423-494  (111292-111363)   100% ->
495-564  (111712-111781)   100% ->
565-681  (112018-112134)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAGAACCAAGGCGAGTCACGCCCTGTCTGGGCAAAAGAGGAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAAGAACCAAGGCGAGTCACGCCCTGTCTGGGCAAAAGAGGAGTAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCCCTCAGCTGCAGCCCGGCAGCGCATTCCTACCCAGGGTCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCCCTCAGCTGCAGCCCGGCAGCGCATTCCTACCCAGGGTCCGCCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGCTTTCCCGCGCGGTCGGATAGTTACACTACTGTCCGGGACTTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAGCTTTCCCGCGCGGTCGGATAGTTACACTACTGTCCGGGACTTCCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGTGCCGCGGACCATCTCAAGTGCTTCCGCCACACTCATCATGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGTGCCGCGGACCATCTCAAGTGCTTCCGCCACACTCATCATGGCGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCAGTAAGTCACTTCCGCCCGGGACCGGAAGTGTGGGATACTGCGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCAGTAAGTCACTTCCGCCCGGGACCGGAAGTGTGGGATACTGCGAGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCGGCGTCAAAGGTGAAGCAGGACATGCCTCCGCCGGGGGGCTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCGGCGTCAAAGGTGAAGCAGGACATGCCTCCGCCGGGGGGCTATGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCATCGACTACAAACGGAACTTGCCGCGTCGAGGACTGTCGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100301 CCCATCGACTACAAACGGAACTTGCCGCGTCGAGGACTGTCGGGTC...C

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    344   GCTACAGCATGCTGGCCATAGGGATTGGAACCCTGATCTACGGGCACT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110191 AGGCTACAGCATGCTGGCCATAGGGATTGGAACCCTGATCTACGGGCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGAGCATAATGAAGTGGAACCGTGAGCGCAG         GCGCCTACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 110241 GGAGCATAATGAAGTGGAACCGTGAGCGCAGGTA...CAGGCGCCTACAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCGAGGACTTCGAGGCTCGCATCGCGCTGTTGCCACTGTTACAGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111302 ATCGAGGACTTCGAGGCTCGCATCGCGCTGTTGCCACTGTTACAGGCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AACCGACCGGAG         GACCTTGCAGATGCTTCGGGAGAACCTGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 111352 AACCGACCGGAGGTA...CAGGACCTTGCAGATGCTTCGGGAGAACCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGAGGAGGCCATCATCATGAAGGACGTGCCCGACTGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111741 AGGAGGAGGCCATCATCATGAAGGACGTGCCCGACTGGAAGGTG...CAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGGGGGAGTCTGTGTTCCACACAACCCGCTGGGTGCCCCCCTTGATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112018 GTGGGGGAGTCTGTGTTCCACACAACCCGCTGGGTGCCCCCCTTGATCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAGCTGTACGGGCTGCGCACCACAGAGGAGGCTCTCCATGCCAGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112068 GGAGCTGTACGGGCTGCGCACCACAGAGGAGGCTCTCCATGCCAGCCACG

    700     .    :    .
    665 GCTTCATGTGGTACACG
        |||||||||||||||||
 112118 GCTTCATGTGGTACACG