seq1 = pF1KB6919.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KB6919/gi568815581r_42472971.tfa (gi568815581r:42472971_42677563), 204593 bp

>pF1KB6919 651
>gi568815581r:42472971_42677563 (Chr17)

(complement)

1-34  (99878-99911)   100% ->
35-135  (100003-100103)   100% ->
136-225  (100262-100351)   100% ->
226-337  (103354-103465)   100% ->
338-483  (103941-104086)   100% ->
484-537  (104200-104253)   100% ->
538-597  (104398-104457)   100% ->
598-651  (104540-104593)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTAAAGGCCGGGCAGAAGCTGCGGCGGGAG         CCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  99878 ATGAGTAAAGGCCGGGCAGAAGCTGCGGCGGGAGGTA...TAGCCGCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GATCCTCCTGAGGTACCTGCAGGAGCAGAACCGGCCCTACAGCTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100010 GATCCTCCTGAGGTACCTGCAGGAGCAGAACCGGCCCTACAGCTCCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGTGTTCGGGAACCTACAGCGGGAACACGGACTGGGCAAGGCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100060 ATGTGTTCGGGAACCTACAGCGGGAACACGGACTGGGCAAGGCGGTG...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    136    GTGGTGGTGAAGACGCTGGAGCAGCTGGCGCAACAAGGCAAGATCAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100259 CAGGTGGTGGTGAAGACGCTGGAGCAGCTGGCGCAACAAGGCAAGATCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAGAAGATGTACGGCAAGCAGAAGATCTATTTTGCGGATCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100309 AGAGAAGATGTACGGCAAGCAGAAGATCTATTTTGCGGATCAGGTG...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    226   GACCAGTTTGACATGGTGAGTGATGCTGACCTTCAAGTCCTAGATGGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103352 AGGACCAGTTTGACATGGTGAGTGATGCTGACCTTCAAGTCCTAGATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAAATCGTGGCCCTCACTGCTAAGGTGCAGAGCTTGCAGCAGAGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103402 AAAATCGTGGCCCTCACTGCTAAGGTGCAGAGCTTGCAGCAGAGCTGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTACATGGAGGCTG         AGCTCAAGGAATTATCTAGTGCCCTGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103452 CTACATGGAGGCTGGTA...CAGAGCTCAAGGAATTATCTAGTGCCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCACACCAGAGATGCAGAAAGAAATCCAGGAGTTAAAGAAGGAATGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103968 CCACACCAGAGATGCAGAAAGAAATCCAGGAGTTAAAGAAGGAATGCGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGCTACAGAGAGAGATTGAAGAACATTAAAGCAGCTACCAATCATGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104018 GGCTACAGAGAGAGATTGAAGAACATTAAAGCAGCTACCAATCATGTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCCAGAAGAGAAAGAGCAG         GTGTACAGAGAGAGGCAGAAGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 104068 TCCAGAAGAGAAAGAGCAGGTG...TAGGTGTACAGAGAGAGGCAGAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACTGTAAGGAGTGGAGGAAGAGGAAGAGGATG         GCTACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104222 ACTGTAAGGAGTGGAGGAAGAGGAAGAGGATGGTA...CAGGCTACAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CTGTCTGATGCAATACTTGAAGGATACCCCAAGAGCAAGAAGCAGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104407 CTGTCTGATGCAATACTTGAAGGATACCCCAAGAGCAAGAAGCAGTTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 T         GAGGAAGTTGGGATAGAGACGGATGAAGATTACAACGTCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104457 TGTA...CAGGAGGAAGTTGGGATAGAGACGGATGAAGATTACAACGTCA

    700     .    :
    638 CACTCCCAGACCCC
        ||||||||||||||
 104580 CACTCCCAGACCCC