seq1 = pF1KB6915.tfa, 615 bp
seq2 = pF1KB6915/gi568815596r_130112873.tfa (gi568815596r:130112873_130313489), 200617 bp

>pF1KB6915 615
>gi568815596r:130112873_130313489 (Chr2)

(complement)

1-615  (100000-100617)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCACGGGCCCGGCGCGCTGATGCTCAAGTGCGTGGTGGTCGGCGA
         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 GTGGCTCACGGGCCTGGCGCGCTGATGCTCAAGTGCGTGGTGGTCGGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGGCGGTGGGCAAGACGTGCCTACTCATGAGCTATGCCAACGACGCCT
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
 100050 CGGGGCGGTGGGCAAGACGTGCCCACTCATGAGCTATGCCAACGAAGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCGGAGGAGTACGTGCCCACCGTCTTCGACCACTACGCAGTCAGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100100 TCCCGGAGGAGTACGTGCCCACCGTCTTCGACCACTAAGCAGTCAGCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCGTGGGGGGCAAGCAGTACCTCCTAGGACTCTATGACACGGCCGGACA
        || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100150 ACTGTGGGGGGCAAGTAGTACCTCCTAGGACTCTATGACACGGCCGGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAGACTATGACCGTCTGAGGCCTTTATCTTACCCAATGACCGATGTCT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
 100200 GGAAGACTATGACTGTCTGAGGCCTTTATCTTACCCAGTGACCGACGTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCTTATATGCTTCTCGGTGGTAAATCCAGCCTCATTTCAAAATGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100250 TCCTTATATGCTTCTCGGTGGTAAATCCAGCCTCATTTCAAAATGTGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGAGTGGGTACCGGAACTTAAGGAATACGCACCAAATGTACCCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100300 GAGGAGTGGGTACCGGAACTTAAGGAATACGCACCAAATGTACCCTTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATTAATAGGAACTCAGATTGATCTCCGAGATGACCCCAAAACTTTAGCAA
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100350 ATTAATAAGAACTCAGATTGATCTCCGAGATGACCCCAAAACTTTAGCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GACTGAATGATATGAAAGAAAAACCTATATGTGTGGAACAAGGACAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100400 GACTGAATGATATGAAAGAAAAACCTATATGTGTGGAACAAGGACAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTAGCAAAAGAGATAGGAGCATGCTGCTATGTGGAATGTTCAGCTTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100450 CTAGCAAAAGAGATAGGAGCATGCTGCTATGTGGAATGTTCAGCTTTAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCAGAAGGGATTGAAGACTGTTTTTGATGAGGCTATCATAGCCATTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100500 CCAGAAGGGATTGAAGACTGTTTTTGATGAGGCTATCATAGCCATTTTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCCAAAGAAACACACTGTAAAAAAAA   GAATAGGATCAAGATGTATA
        |||||||||||||||||||||||||||---||||||||||||||||||||
 100550 CTCCAAAGAAACACACTGTAAAAAAAAAAAGAATAGGATCAAGATGTATA

    600     .    :    .
    598 AACTGTTGTTTAATTACG
        ||||||||||||||||||
 100600 AACTGTTGTTTAATTACG