seq1 = pF1KB6903.tfa, 609 bp
seq2 = pF1KB6903/gi568815583r_79745213.tfa (gi568815583r:79745213_79996988), 251776 bp

>pF1KB6903 609
>gi568815583r:79745213_79996988 (Chr15)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-379  (107635-107896)   100% ->
380-609  (151547-151776)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCAGCGGTGAGCAGCGCCAAGCGGAGCCTGCGGGGAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCAGCGGTGAGCAGCGCCAAGCGGAGCCTGCGGGGAGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGCAGCGTCTGCGGGCGATGAGTGCCGAGGAGCGGCTACGCCAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGCAGCGTCTGCGGGCGATGAGTGCCGAGGAGCGGCTACGCCAGTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGTACTGAGCCAGAAG         GTGATTGCCCACAGTGAGTATCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGTACTGAGCCAGAAGGTG...TAGGTGATTGCCCACAGTGAGTATCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGTCCAAAAGAATTTCCATCTTTCTGAGCATGCAAGATGAAATTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107659 AAGTCCAAAAGAATTTCCATCTTTCTGAGCATGCAAGATGAAATTGAGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAAGAGATCATCAAGGACATTTTCCAACGAGGCAAAATCTGCTTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107709 AGAAGAGATCATCAAGGACATTTTCCAACGAGGCAAAATCTGCTTCATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCGGTACCGGTTCCAGAGCAATCACATGGATATGGTGAGAATAGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107759 CTCGGTACCGGTTCCAGAGCAATCACATGGATATGGTGAGAATAGAATCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCAGAGGAAATTTCTTTACTTCCCAAAACATCCTGGAATATCCCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107809 CCAGAGGAAATTTCTTTACTTCCCAAAACATCCTGGAATATCCCTCAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGGTGAGGGTGATGTTCGGGAGGAGGCCTTGTCCACAG         GGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 107859 TGGTGAGGGTGATGTTCGGGAGGAGGCCTTGTCCACAGGTG...CAGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GACTTGATCTCATCTTCATGCCAGGCCTTGGGTTTGACAAACATGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151550 GACTTGATCTCATCTTCATGCCAGGCCTTGGGTTTGACAAACATGGCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGACTGGGGAGGGGCAAGGGCTACTATGATGCCTATCTGAAGCGCTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151600 CGACTGGGGAGGGGCAAGGGCTACTATGATGCCTATCTGAAGCGCTGTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCAGCATCAGGAAGTGAAGCCCTACACCCTGGCGTTGGCTTTCAAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151650 GCAGCATCAGGAAGTGAAGCCCTACACCCTGGCGTTGGCTTTCAAAGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGATTTGCCTCCAGGTCCCAGTGAATGAAAACGACATGAAGGTAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151700 AGATTTGCCTCCAGGTCCCAGTGAATGAAAACGACATGAAGGTAGATGAA

    600     .    :    .    :    .
    583 GTCCTTTACGAAGACTCGTCAACAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||
 151750 GTCCTTTACGAAGACTCGTCAACAGCT