seq1 = pF1KB6891.tfa, 549 bp
seq2 = pF1KB6891/gi568815596r_180772870.tfa (gi568815596r:180772870_180973414), 200545 bp

>pF1KB6891 549
>gi568815596r:180772870_180973414 (Chr2)

(complement)

1-549  (100001-100545)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGACCGCGTCCACCTCGCAGGTGCGCCAGAACTACCACCAGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100001 ATGACGACCGCGTCCACCTCGCAGGTGCGCCAGAACTACCACCAGTACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGCCGCCATCAACCGCCAGATCAACCTGGAGCTCTACGCCTCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
 100051 AGAGGCCGCCATCAACCGCCAGATCAACCTGGAGCACTACGCCTCCTAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTACCTGTCCATGTCTTACTACTTTGACCGCGATGATGTGGCTTTGAAG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTACCTGTCCCTGTCTTACTACTTTGACCGCGATGATGTGGCTTTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACTTTGCCAAATACTTTCTTCACCAATCTCATGAGGAGAGGGAACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100151 AACTTTGCCAAATACTTTCTTCACCAATCTCATGAGGAGAGGGGACATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGAAACTGATGAAGCTGCAGAACCAACGAGGTGGCCGAATCTTCCTTC
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100201 TGAGAAACTGATGAAGCTGCAGAACCAATGAGGTGGCCGAATCTTCCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGATATCAAGAAACCAGACTGTGATGACTGGGAGAGCGGGCTGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100251 AGGATATCAAGAAACCAGACTGTGATGACTGGGAGAGCGGGCTGAATGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGGAGTGTGCATTACATTTGGAAAAAAATGTGAATCAGTCACTACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGGAGTGTGCATTACATTTGGAAAAAAATGTGAATCAGTCACTACTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTGCACAAACTGGCCACTGACAAAAATGACCCCCATTTGTGTGACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--
 100351 ACTGCACAAACTGGCCACTGACAAAAATGACCCCCATTTGTGTGACTT  

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGAGACACATTACCTGAATGAGCAGGTGAAAGCCATCAAAGAATTGGGT
        --|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100399   GAGATACATTACCTGAATGAGCAGGTGAAAGCCATCAAAGAATTGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACCACGTGACCAACTTGCGCAAGATGGGAGCGCCCGAATCTGGCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| 
 100447 GACCACGTGACCAACTTGCGCAAGATGGGAGCGCCCGAATCTGGCGTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    501 GGAATATCTCTTTGACAAGCACACCCTGGGAGACAGTGATAATGAAAGC
         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100497 AGAATATCTCTTTGACAAGCACACTCTGGGAGACAGTGATAATGAAAGC