seq1 = pF1KB6891.tfa, 549 bp
seq2 = pF1KB6891/gi568815593r_17253876.tfa (gi568815593r:17253876_17454423), 200548 bp

>pF1KB6891 549
>gi568815593r:17253876_17454423 (Chr5)

(complement)

1-549  (100001-100548)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGACCGCGTCCACCTCGCAGGTGCGCCAGAACTACCACCAGGACTC
        |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| 
 100001 ATGACGACCGCGTCCACCTCACAGGTGCGCCAGGACTACCACCAGGACTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGCCGCCATCAACCGCCAGATCAACCTGGAGCTCTACGCCTCCTACG
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100051 A AGGCCGCCATCAACCGCCAGATCAACCTGGAGCTCTACGCCTCCTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTACCTGTCCATGTCTTACTACTTTGACCGCGATGATGTGGCTTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100100 TTTACCTGTCCATGTCTTACTACTTTGACCGCGATGATGTGGCTTTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACTTTGCCAAATACTTTCTTCACCAATCTCATGAGGAGAGGGAACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100150 AACTTTGCCAAATACTTTCTTCACCAATCTCATGAGGAGAGGGAACATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGAAACTGATGAAGCTGCAGAACCAACGAGGTGGCCGAATCTTCCTTC
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100200 TGAGAAACTGATGAAGCTGCAGAACCAAGGAGGTGGCCGAATCTTCCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGATATCAAGAAACCAGACTGTGATGACTGGGAGAGCGGGCTGAATGCA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100250 AGGATATCAAGAAACCGGACTGTGATGACTGGGAGAGCGGGCTGAATGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGGAGTGTGCATTACATTTGGAAAAAAATGTGAATCAGTCACTACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100300 ATGGAGTGTGCATTACATTTGGAAAAAAATGTGAATCAGTCACTACTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTGCACAAACTGGCCACTGACAAAAATGACCCCCATTTGTGTGACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100350 ACTGCACAAACTGGCCACTGACAAAAATGACCCCCATTTGTGTGACTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGAGACACATTACCTGAATGAGCAGGTGAAAGCCATCAAAGAATTGGGT
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100400 TTGAGACACATTACCTGAATGAGCAGGTCAAAGCCATCAAAGAATTGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACCACGTGACCAACTTGCGCAAGATGGGAGCGCCCGAATCTGGCTTGGC
        |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||
 100450 GACCACATGACCAACTTGTGCAAGATGGGAGCACCCGAATCTAGCTTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    501 GGAATATCTCTTTGACAAGCACACCCTGGGAGACAGTGATAATGAAAGC
        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100500 GGAATATCTCTTTGACCAGCACACCCTGGGAGACAGTGATAATGAAAGC