seq1 = pF1KB6887.tfa, 549 bp
seq2 = pF1KB6887/gi568815597r_16874923.tfa (gi568815597r:16874923_17078273), 203351 bp

>pF1KB6887 549
>gi568815597r:16874923_17078273 (Chr1)

(complement)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-127  (101076-101165)   100% ->
128-154  (101351-101377)   100% ->
155-241  (101480-101566)   100% ->
242-286  (101729-101773)   100% ->
287-374  (102544-102631)   100% ->
375-448  (102932-103005)   100% ->
449-549  (103251-103351)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAGCTGCCTACCTCTTCCTGCTATTCCTGCCTG         CAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGAGAGCTGCCTACCTCTTCCTGCTATTCCTGCCTGGTA...CAGCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTGCTGGCTCAGGGCCAGTATGACCTGGACCCGCTGCCGCCGTTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101080 CTTGCTGGCTCAGGGCCAGTATGACCTGGACCCGCTGCCGCCGTTCCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCACGTCCAGTACACCCACTATAGCGACCAGATCG         ACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101130 ACCACGTCCAGTACACCCACTATAGCGACCAGATCGGTA...CAGACAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCAGACTACTATGATTATCAAG         AGGTGACTCCTCGGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101356 CCAGACTACTATGATTATCAAGGTA...CAGAGGTGACTCCTCGGCCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 CGAGGAACAGTTCCAGTTCCAGTCCCAGCAGCAAGTCCAACAGGAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101499 CGAGGAACAGTTCCAGTTCCAGTCCCAGCAGCAAGTCCAACAGGAAGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCCCAGCCCCAACCCCAG         AACCAGGAAATGCAGAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101549 TCCCAGCCCCAACCCCAGGTA...CAGAACCAGGAAATGCAGAGCTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CCCACAGAGCCTGGGCCTCTTG         ACTGCCGTGAGGAACAGTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101752 CCCACAGAGCCTGGGCCTCTTGGTA...CAGACTGCCGTGAGGAACAGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    306 CCCGTGCACCCGCCTCTACTCCATACACAGGCCTTGCAAACAGTGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102563 CCCGTGCACCCGCCTCTACTCCATACACAGGCCTTGCAAACAGTGTCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 ACGAGGTCTGCTTCTACAG         CCTCCGCCGTGTGTACGTCATT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102613 ACGAGGTCTGCTTCTACAGGTG...CAGCCTCCGCCGTGTGTACGTCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 AACAAGGAGATCTGTGTTCGTACAGTGTGTGCCCATGAGGAGCTCCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102954 AACAAGGAGATCTGTGTTCGTACAGTGTGTGCCCATGAGGAGCTCCTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 AG         CTGACCTCTGTCGGGACAAGTTCTCCAAATGTGGCGTGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103004 AGGTA...TAGCTGACCTCTGTCGGGACAAGTTCTCCAAATGTGGCGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 TGGCCAGCAGCGGCCTGTGCCAATCCGTGGCAGCCTCCTGTGCCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 103290 TGGCCAGCAGCGGCCTGTGCCAATCCGTGGCGGCCTCCTGTGCCAGGAGC

    600     .    :
    538 TGTGGGAGCTGC
        ||||||||||||
 103340 TGTGGGAGCTGC