seq1 = pF1KB6886.tfa, 573 bp
seq2 = pF1KB6886/gi568815597r_37395884.tfa (gi568815597r:37395884_37614746), 218863 bp

>pF1KB6886 573
>gi568815597r:37395884_37614746 (Chr1)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-206  (101209-101324)   100% ->
207-294  (105205-105292)   100% ->
295-340  (105424-105469)   100% ->
341-533  (112751-112943)   100% ->
534-573  (118829-118865)   92%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGATGCACAACAAGGCGGCGCCGCCGCAGATCCCGGACACCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGATGCACAACAAGGCGGCGCCGCCGCAGATCCCGGACACCCGGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCTGGCGGAGCTCGTGAAGCGGAAGCAGGAGCTGGCG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 GGAGCTGGCGGAGCTCGTGAAGCGGAAGCAGGAGCTGGCGGTG...CAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAACATTGGCAAATTTGGAGCGACAGATCTATGCTTTTGAGGGAAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101210 AAACATTGGCAAATTTGGAGCGACAGATCTATGCTTTTGAGGGAAGCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGAAGACACTCAGATGTATGGCAATATTATTCGTGGCTGGGATCGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101260 CTGGAAGACACTCAGATGTATGGCAATATTATTCGTGGCTGGGATCGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTGACCAACCAAAA         AAACTCCAATAGCAAAAATGATCGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101310 TCTGACCAACCAAAAGTG...TAGAAACTCCAATAGCAAAAATGATCGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAACCGGAAGTTTAAGGAAGCTGAGCGGCTCTTCAGTAAATCCTCGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105231 GGAACCGGAAGTTTAAGGAAGCTGAGCGGCTCTTCAGTAAATCCTCGGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCTCAGCAGCT         GCAGTAAGTGCATTGGCAGGAGTTCAGGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 105281 ACCTCAGCAGCTGTA...TAGGCAGTAAGTGCATTGGCAGGAGTTCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCAGCTCATTGAAAAGA         GGGAGCCAGGAAGTGGGACGGAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105453 CCAGCTCATTGAAAAGAGTA...CAGGGGAGCCAGGAAGTGGGACGGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GTGACACTTCTCCAGACTTCCACAATCAGGAAAATGAGCCCAGCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112775 GTGACACTTCTCCAGACTTCCACAATCAGGAAAATGAGCCCAGCCAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GACCCTGAGGATCTGGATGGATCTGTGCAGGGAGTGAAACCTCAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112825 GACCCTGAGGATCTGGATGGATCTGTGCAGGGAGTGAAACCTCAGAAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGCTTCTTCTACTTCCTCAGGGAGTCACCACAGCAGCCATAAAAAGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112875 TGCTTCTTCTACTTCCTCAGGGAGTCACCACAGCAGCCATAAAAAGCGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGAATAAAAACCGGCACAG         GATTGATCTGAAGTTAAACAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 112925 AGAATAAAAACCGGCACAGGTC...CAGGATTGATCTGAAGTTAAACAAA

    600     .    :    .
    556 AAACCACGAGCTGACTAT
        |||||||||||||--||-
 118851 AAACCACGAGCTG  TA