seq1 = pF1KB6884.tfa, 603 bp
seq2 = pF1KB6884/gi568815587f_117103014.tfa (gi568815587f:117103014_117304356), 201343 bp

>pF1KB6884 603
>gi568815587f:117103014_117304356 (Chr11)

1-180  (100001-100180)   100% ->
181-358  (100294-100471)   100% ->
359-461  (100769-100871)   100% ->
462-603  (101202-101343)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAACAAGGGTCCTTCCTATGGCATGAGCCGCGAAGTGCAGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAACAAGGGTCCTTCCTATGGCATGAGCCGCGAAGTGCAGTCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATCGAGAAGAAGTATGACGAGGAGCTGGAGGAGCGGCTGGTGGAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATCGAGAAGAAGTATGACGAGGAGCTGGAGGAGCGGCTGGTGGAGTGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATAGTGCAGTGTGGCCCTGATGTGGGCCGCCCAGACCGTGGGCGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATAGTGCAGTGTGGCCCTGATGTGGGCCGCCCAGACCGTGGGCGCTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCTTCCAGGTCTGGCTGAAGAATGGCGTG         ATTCTGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100151 GGCTTCCAGGTCTGGCTGAAGAATGGCGTGGTG...TAGATTCTGAGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGTGAACAGCCTGTACCCTGATGGCTCCAAGCCGGTGAAGGTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100305 GCTGGTGAACAGCCTGTACCCTGATGGCTCCAAGCCGGTGAAGGTGCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAACCCACCCTCCATGGTCTTCAAGCAGATGGAGCAGGTGGCTCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100355 AGAACCCACCCTCCATGGTCTTCAAGCAGATGGAGCAGGTGGCTCAGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGAAGGCGGCTGAGGACTATGGGGTCATCAAGACTGACATGTTCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100405 CTGAAGGCGGCTGAGGACTATGGGGTCATCAAGACTGACATGTTCCAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGTTGACCTCTTTGAAG         GCAAAGACATGGCAGCAGTGCAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100455 TGTTGACCTCTTTGAAGGTA...CAGGCAAAGACATGGCAGCAGTGCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGACCCTGATGGCTTTGGGCAGCTTGGCAGTGACCAAGAATGATGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100793 GGACCCTGATGGCTTTGGGCAGCTTGGCAGTGACCAAGAATGATGGGCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TACCGTGGAGATCCCAACTGGTTTATGAA         GAAAGCGCAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100843 TACCGTGGAGATCCCAACTGGTTTATGAAGTA...TAGGAAAGCGCAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCATAAGAGGGAATTCACAGAGAGCCAGCTGCAGGAGGGAAAGCATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101214 GCATAAGAGGGAATTCACAGAGAGCCAGCTGCAGGAGGGAAAGCATGTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGGCCTTCAGATGGGCAGCAACAGAGGGGCCTCCCAGGCCGGCATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101264 TTGGCCTTCAGATGGGCAGCAACAGAGGGGCCTCCCAGGCCGGCATGACA

    600     .    :    .    :    .    :
    574 GGCTACGGACGACCTCGGCAGATCATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 101314 GGCTACGGACGACCTCGGCAGATCATCAGT