seq1 = pF1KB6883.tfa, 543 bp
seq2 = pF1KB6883/gi568815588r_119400116.tfa (gi568815588r:119400116_119642638), 242523 bp

>pF1KB6883 543
>gi568815588r:119400116_119642638 (Chr10)

(complement)

1-49  (100001-100049)   100% ->
50-168  (115215-115333)   100% ->
169-255  (116521-116607)   100% ->
256-399  (126987-127130)   100% ->
400-543  (142380-142523)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCAACCGCGCCGTGAGCCGGCTGAGCAGGAAGCGGCCGCCGTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100001 ATGTTCAACCGCGCCGTGAGCCGGCTGAGCAGGAAGCGGCCGCCGTCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50         ACATCCACGACAGCGATGGCAGTTCCAGCAGCAGCCACCAGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TA...CAGACATCCACGACAGCGATGGCAGTTCCAGCAGCAGCCACCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCCTCAAGAGCACAGCCAAATGGGCGGCATCCCTGGAGAATCTGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115257 GCCTCAAGAGCACAGCCAAATGGGCGGCATCCCTGGAGAATCTGCTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCCAGAAGGCGTGAAAAGATTTAGG         GAATTTTTAAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 115307 GACCCAGAAGGCGTGAAAAGATTTAGGGTT...CAGGAATTTTTAAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGAATTCAGTGAAGAAAATGTTTTGTTTTGGCTAGCATGTGAAGATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116535 GGAATTCAGTGAAGAAAATGTTTTGTTTTGGCTAGCATGTGAAGATTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAAATGCAAGATAAGACGCAG         ATGCAGGAAAAGGCAAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 116585 AGAAAATGCAAGATAAGACGCAGGTA...CAGATGCAGGAAAAGGCAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGATCTACATGACCTTTCTGTCCAGCAAGGCCTCATCACAGGTCAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127005 GAGATCTACATGACCTTTCTGTCCAGCAAGGCCTCATCACAGGTCAACGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGAGGGGCAGTCTCGGCTCAACGAGAAGATCCTGGAAGAACCGCACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127055 GGAGGGGCAGTCTCGGCTCAACGAGAAGATCCTGGAAGAACCGCACCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGATGTTCCAGAAACTCCAGGACCAG         ATCTTTAATCTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 127105 TGATGTTCCAGAAACTCCAGGACCAGGTA...TAGATCTTTAATCTCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGTACGACAGCTACAGCCGCTTCTTAAAGTCTGACTTGTTTTTAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142395 AAGTACGACAGCTACAGCCGCTTCTTAAAGTCTGACTTGTTTTTAAAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAAGCGAACCGAGGAAGAGGAAGAAGATTTGCCTGATGCTCAAACTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142445 CAAGCGAACCGAGGAAGAGGAAGAAGATTTGCCTGATGCTCAAACTGCAG

    550     .    :    .    :    .
    515 CTAAAAGAGCTTCCAGAATTTATAACACA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 142495 CTAAAAGAGCTTCCAGAATTTATAACACA