seq1 = pF1KB6881.tfa, 543 bp
seq2 = pF1KB6881/gi568815586r_48838950.tfa (gi568815586r:48838950_49041095), 202146 bp

>pF1KB6881 543
>gi568815586r:48838950_49041095 (Chr12)

(complement)

1-148  (100001-100148)   99% ->
149-259  (100989-101099)   100% ->
260-384  (101317-101441)   100% ->
385-543  (101988-102146)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAATATCTTTGGAAACCTTCTCAAGAGCCTGATTGGGAAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAATATCTTTGGAAACCTTCTCAAGAGCCTGATTGGGAAGAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGCGCATCCTGATGGTGGGCCTGGATGCCGCAGGAAAGACCACCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGCGCATCCTGATGGTGGGCCTGGATGCCGCAGGAAAGACCACCATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATACAAGCTGAAACTGGGGGAGATCGTCACCACCATCCCTACCATTG  
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100101 TATACAAGCTGAAACTCGGGGAGATCGTCACCACCATCCCTACCATTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149        GGTTCAATGTGGAGACAGTGGAGTATAAGAACATCAGCTTTAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 A...AAGGGTTCAATGTGGAGACAGTGGAGTATAAGAACATCAGCTTTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTGTGGGATGTGGGTGGCCAGGACAAGATTCGACCCCTCTGGAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101032 AGTGTGGGATGTGGGTGGCCAGGACAAGATTCGACCCCTCTGGAGACACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTTCCAGAACACCCAAG         GGTTGATATTTGTGGTCGACAGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101082 ACTTCCAGAACACCCAAGGTA...TAGGGTTGATATTTGTGGTCGACAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATGATCGGGAGCGAGTAAATGAGGCCCGGGAAGAGCTGATGAGAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101340 AATGATCGGGAGCGAGTAAATGAGGCCCGGGAAGAGCTGATGAGAATGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCGGAGGACGAGCTCCGGGATGCTGTACTCCTTGTCTTTGCAAACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101390 GGCGGAGGACGAGCTCCGGGATGCTGTACTCCTTGTCTTTGCAAACAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AG         GATCTGCCTAATGCTATGAACGCTGCTGAGATCACAGAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101440 AGGTG...CAGGATCTGCCTAATGCTATGAACGCTGCTGAGATCACAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGCTGGGCCTGCATTCCCTTCGTCACCGTAACTGGTACATTCAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102027 AAGCTGGGCCTGCATTCCCTTCGTCACCGTAACTGGTACATTCAGGCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTGTGCCACCAGCGGGGACGGGCTGTACGAAGGCCTGGACTGGCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102077 CTGTGCCACCAGCGGGGACGGGCTGTACGAAGGCCTGGACTGGCTGGCCA

    550     .    :    .    :
    524 ATCAGCTCAAAAACAAGAAG
        ||||||||||||||||||||
 102127 ATCAGCTCAAAAACAAGAAG