seq1 = pF1KB6880.tfa, 603 bp
seq2 = pF1KB6880/gi568815586r_14842525.tfa (gi568815586r:14842525_15050712), 208188 bp

>pF1KB6880 603
>gi568815586r:14842525_15050712 (Chr12)

(complement)

1-181  (100001-100181)   100% ->
182-265  (100828-100911)   100% ->
266-342  (102764-102840)   100% ->
343-406  (105874-105937)   100% ->
407-603  (107992-108188)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGAAAAAGCCCCAGAGCCACATGTGGAGGAGGATGACGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGAAAAAGCCCCAGAGCCACATGTGGAGGAGGATGACGATGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGACAGCAAGCTCAATTATAAGCCTCCACCACAGAAGTCCCTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGACAGCAAGCTCAATTATAAGCCTCCACCACAGAAGTCCCTGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGCAGGAAATGGACAAAGATGATGAGAGTCTAATTAAGTACAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGCAGGAAATGGACAAAGATGATGAGAGTCTAATTAAGTACAAGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGCTGCTGGGAGATGGTCCTGTGGTGACAG         ATCCGAAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100151 ACGCTGCTGGGAGATGGTCCTGTGGTGACAGGTA...CAGATCCGAAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCCAATGTCGTTGTCACCCGGCTCACCCTGGTTTGTGAGAGTGCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100838 CCCCAATGTCGTTGTCACCCGGCTCACCCTGGTTTGTGAGAGTGCCCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACCAATCACCATGGACCTTACTG         GAGATCTGGAAGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100888 GACCAATCACCATGGACCTTACTGGTA...CAGGAGATCTGGAAGCCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAAAGGAAACCATTGTGTTAAAGGAAGGTTCTGAATATAGAGTCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102781 AAAAAGGAAACCATTGTGTTAAAGGAAGGTTCTGAATATAGAGTCAAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCACTTCAAA         GTGAACAGGGATATTGTGTCAGGCCTGAAAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102831 TCACTTCAAAGTA...CAGGTGAACAGGGATATTGTGTCAGGCCTGAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACGTTCAGCACACCTACAGGACTGGGGTGAAAG         TGGATAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105905 ACGTTCAGCACACCTACAGGACTGGGGTGAAAGGTA...TAGTGGATAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCAACATTTATGGTTGGCAGCTATGGACCTCGGCCTGAGGAGTATGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108000 GCAACATTTATGGTTGGCAGCTATGGACCTCGGCCTGAGGAGTATGAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTCACTCCAGTTGAGGAGGCTCCCAAGGGCATGCTGGCGCGAGGCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108050 CCTCACTCCAGTTGAGGAGGCTCCCAAGGGCATGCTGGCGCGAGGCACGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCACAACAAGTCCTTCTTCACCGACGATGACAAGCAAGACCACCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108100 ACCACAACAAGTCCTTCTTCACCGACGATGACAAGCAAGACCACCTCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .
    565 TGGGAGTGGAACCTGTCGATTAAGAAGGAGTGGACAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108150 TGGGAGTGGAACCTGTCGATTAAGAAGGAGTGGACAGAA