seq1 = pF1KB6879.tfa, 540 bp
seq2 = pF1KB6879/gi568815592f_32078512.tfa (gi568815592f:32078512_32280302), 201791 bp

>pF1KB6879 540
>gi568815592f:32078512_32280302 (Chr6)

1-140  (100001-100140)   100% ->
141-159  (101030-101048)   100% ->
160-272  (101140-101252)   100% ->
273-327  (101366-101420)   100% ->
328-445  (101498-101615)   100% ->
446-540  (101718-101812)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCAGCGGAGGAGGAGGACGGGGGCCCCGAAGGGCCAAATCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCAGCGGAGGAGGAGGACGGGGGCCCCGAAGGGCCAAATCGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGGGCGGGGCGGGCGCGACCTTCGAATGTAATATATGTTTGGAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGGGGCGGGGCGGGCGCGACCTTCGAATGTAATATATGTTTGGAGACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCGGGAAGCTGTGGTCAGTGTGTGTGGCCACCTGTACTG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100101 CTCGGGAAGCTGTGGTCAGTGTGTGTGGCCACCTGTACTGGTG...CAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGCCATGTCTTCATCAG         TGGCTGGAGACACGGCCAGAACG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101031 TGGCCATGTCTTCATCAGGTG...CAGTGGCTGGAGACACGGCCAGAACG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCAAGAGTGTCCAGTATGTAAAGCTGGGATCAGCAGAGAGAAGGTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101163 GCAAGAGTGTCCAGTATGTAAAGCTGGGATCAGCAGAGAGAAGGTTGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGCTTTATGGGCGAGGGAGCCAGAAGCCCCAGGATCCCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101213 CGCTTTATGGGCGAGGGAGCCAGAAGCCCCAGGATCCCAGGTG...CAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTAAAAACTCCACCCCGCCCCCAGGGCCAGAGACCAGCTCCGGAGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101367 TTAAAAACTCCACCCCGCCCCCAGGGCCAGAGACCAGCTCCGGAGAGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGGG         GGATTCCAGCCATTTGGTGATACCGGGGGCTTCCACT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101417 AGGGGTG...TAGGGATTCCAGCCATTTGGTGATACCGGGGGCTTCCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TCTCATTTGGTGTTGGTGCTTTTCCCTTTGGCTTTTTCACCACCGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101535 TCTCATTTGGTGTTGGTGCTTTTCCCTTTGGCTTTTTCACCACCGTCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AATGCCCATGAGCCTTTCCGCCGGGGTACAG         GTGTGGATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101585 AATGCCCATGAGCCTTTCCGCCGGGGTACAGGTA...CAGGTGTGGATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGGACAGGGTCACCCAGCCTCCAGCTGGCAGGATTCCCTCTTCCTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101728 GGGACAGGGTCACCCAGCCTCCAGCTGGCAGGATTCCCTCTTCCTGTTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .
    506 TCGCCATCTTCTTCTTTTTTTGGCTGCTCAGTATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101778 TCGCCATCTTCTTCTTTTTTTGGCTGCTCAGTATT