seq1 = pF1KB6879.tfa, 540 bp
seq2 = pF1KB6879/gi568815590r_38500685.tfa (gi568815590r:38500685_38701200), 200516 bp

>pF1KB6879 540
>gi568815590r:38500685_38701200 (Chr8)

(complement)

1-540  (100001-100537)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCAGCGGAGGAGGAGGACGGGGGCCCCGAAGGGCCAAATCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCAGCGGAGGAGGAGGACGGGGGCCCCGAGGGGCCAAATCGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGGGCGGGGCGGGCGCGACCTTCGAATGTAATATATGTTTGGAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGGGGCGGGGCGGGCGCGACCTTCGAATGTAATATATGTTTGGAGACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCGGGAAGCTGTGGTCAGTGTGTGTGGCCACCTGTACTGTTGGCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCGGGAAGCTGTGGTCAGTGTGTGTGGCCACCTGTACTGTTGGCCATGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTCATCAGTGGCTGGAGACACGGCCAGAACGGCAAGAGTGTCCAGTATG
        ||||||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTTCATCAGTGGCTGG   CACGGCCAGAACGGCAAGAGTGTCCAGTATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAAAGCTGGGATCAGCAGAGAGAAGGTTGTCCCGCTTTATGGGCGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100198 TAAAGCTGGGATCAGCAGAGAGAAGGTTGTCCCGCTTTATGGGCGAGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCAGAAGCCCCAGGATCCCAGATTAAAAACTCCACCCCGCCCCCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100248 GCCAGAAGCCCCAGGATCCCAGATTGAAAACTCCACCCCGCCCCCAGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGAGACCAGCTCCGGAGAGCAGAGGGGGATTCCAGCCATTTGGTGATAC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100298 CAGAGACCAGCTCCAGAGAGCAGAGGGGGATTCCAGCCATTTGGTGATAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGGGGCTTCCACTTCTCATTTGGTGTTGGTGCTTTTCCCTTTGGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100348 CGGGGGCTTCCACTTCTCATTTGGTGTTGGTGCTTTTCCCTTTGGCTTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCACCACCGTCTTCAATGCCCATGAGCCTTTCCGCCGGGGTACAGGTGTG
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100398 TCACCATCGTCTTCAATGCCCATGAGCCTTTCCGCCGGGGTACAGGTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GATCTGGGACAGGGTCACCCAGCCTCCAGCTGGCAGGATTCCCTCTTCCT
        |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
 100448 GATCTGGGACAGGGTCACCCGGCCTCCAGCTGACAGGATTCCCTCTTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTTCTCGCCATCTTCTTCTTTTTTTGGCTGCTCAGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100498 GTTTCTCGCCATCTTCTTCTTTTTTTGGCTGCTCAGTATT