seq1 = pF1KB6875.tfa, 477 bp
seq2 = pF1KB6875/gi568815596f_113027687.tfa (gi568815596f:113027687_113232868), 205182 bp

>pF1KB6875 477
>gi568815596f:113027687_113232868 (Chr2)

6-62  (99998-100054)   98% ->
63-151  (101890-101978)   98% ->
152-264  (103359-103471)   100% ->
265-477  (104970-105182)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      6 TTTAGAGACGATCTGCCGACCCTCTGGGAGAAAATCCAGCAAGATGCAAG
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 TTCAGAGACGATCTGCCGACCCTCTGGGAGAAAATCCAGCAAGATGCAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     56 CCTTCAG         AATCTGGGATGTTAACCAGAAGACCTTCTATCTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100048 CCTTCAGGTA...CAGAATCTGGGATGTTAACCAGAAGACCTTCTATCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97 AGGAACAACCAACTAGTTGCCGGATACTTGCAAGGACCAAATGTCAATTT
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 101924 AGGAACAACCAACTAGTTGCTGGATACTTGCAAGGACCAAATGTCAATTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    147 AGAAG         AAAAGATAGATGTGGTACCCATTGAGCCTCATGCTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101974 AGAAGGTG...CAGAAAAGATAGATGTGGTACCCATTGAGCCTCATGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188 TGTTCTTGGGAATCCATGGAGGGAAGATGTGCCTGTCCTGTGTCAAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103395 TGTTCTTGGGAATCCATGGAGGGAAGATGTGCCTGTCCTGTGTCAAGTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    238 GGTGATGAGACCAGACTCCAGCTGGAG         GCAGTTAACATCAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103445 GGTGATGAGACCAGACTCCAGCTGGAGGTA...CAGGCAGTTAACATCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    279 TGACCTGAGCGAGAACAGAAAGCAGGACAAGCGCTTCGCCTTCATCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104984 TGACCTGAGCGAGAACAGAAAGCAGGACAAGCGCTTCGCCTTCATCCGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    329 CAGACAGTGGCCCCACCACCAGTTTTGAGTCTGCCGCCTGCCCCGGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105034 CAGACAGTGGCCCCACCACCAGTTTTGAGTCTGCCGCCTGCCCCGGTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    379 TTCCTCTGCACAGCGATGGAAGCTGACCAGCCCGTCAGCCTCACCAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105084 TTCCTCTGCACAGCGATGGAAGCTGACCAGCCCGTCAGCCTCACCAATAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    429 GCCTGACGAAGGCGTCATGGTCACCAAATTCTACTTCCAGGAGGACGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105134 GCCTGACGAAGGCGTCATGGTCACCAAATTCTACTTCCAGGAGGACGAG